| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_000913 | 802,118 | 0 | A | C | 28.6% | 104.8 / 13.5 | 56 | T78P (ACC→CCC) | ybhI | putative tricarboxylate transporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (35/5); new base C (0/16); total (35/21) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.89e-10 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Rejected as consensus: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
GCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCAC > NC_000913/801980‑802257 | gCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAac > 2:652322/1‑140 (MQ=255) cGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAacc > 1:867344/1‑140 (MQ=255) gTGGGTGTTTTTTGTTATTTGCCTGGGGGCCATTGGGGGGGGGTTTATCAGGCCTTG‑CCCGGAACCTGTGGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTGAAGGGGGGTGGTCGGTAACTTAGCCGAGGTTGGGTTTAAAaccg < 2:1293544/140‑2 (MQ=255) gggTTCTTTTTGGTATTTCCCGGGCGGCCTTTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGACCCTGTCGTACTTTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTGGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAcccacc < 2:1517042/140‑1 (MQ=255) ggttttttttGTTTTTTCCCTGGCGGCCATTGGGGGGCTGTTTATCAAGCTTTT‑CCCGGACCCTGTCGTATTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAAGGGTGGTGGTCGGTAACTTACCCGACGGTGCTTTAAAACCCAccg < 2:1523850/135‑1 (MQ=255) gtgtTTTTTGTTTTTTCCGGGGCGGCCTTTGGGGGGCTGTTTATCAAGCCTTT‑CCGGGACCCTGTCTTCTTGTTAATTGCGGTTGCTGCCTCAAGGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCTTTAAAAACCAccgc < 2:725060/140‑1 (MQ=255) gCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCAccgccg > 2:1163554/1‑140 (MQ=255) gTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGc > 1:1340230/1‑140 (MQ=255) tttCCCTGGCGCCCATTGGGGGGCTGTTTATCAAGCCTTT‑CCCGGACCCTGTCTTACTGTAAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGGGGTCGGTAACTTATCCGCCGGTGCTTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGt < 2:1217420/140‑1 (MQ=255) tttCCCGGGCGGCCTTTGGGGGGTTGTTTATCAACCCTTC‑CCGGGACCTTGTCTTCTTTTTATTTGCTGTTGCGCCCTCAAGGGTGGTGGTTGTTAATTTACCCGGGGGTGTTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGt < 2:389931/140‑1 (MQ=255) tttACTTGGCGGCTTTTGTGGGGCTGTTTATCAAGCCTTT‑CCGGGACCCTTTCGTATTGTTAATTGCCGTTGCTGCCACAATGGGGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGt < 2:867344/140‑1 (MQ=255) tttACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGt > 1:1023175/1‑140 (MQ=255) ttACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGtt > 2:1011440/1‑140 (MQ=255) tcccTGGGGGCCTTTGGGGGGCTGGTTATCAAGCTTTT‑CCGGGACCCTGTCGTATTGTTATTTGCCGTTGCTGCCTCAAGGGTGGTGGTCGGTAACTTCCCCGACGGTGCTTTAAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTa < 2:188100/138‑1 (MQ=255) gcggcCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTc > 1:165011/1‑140 (MQ=255) cggcCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCa > 2:619138/1‑140 (MQ=255) ccttgggggggTTGTTTATCAAGCTTTC‑CCGGGAACTTGTCGTATTTTTACTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAATTTATCCGAGGGTGCTTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGt < 2:546740/133‑1 (MQ=255) ggggCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACct > 2:476404/1‑140 (MQ=255) gCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCAACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggc > 2:1375807/1‑140 (MQ=255) ggTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACctggctgg > 2:658696/1‑140 (MQ=255) caaccTTTCCCCGGACCCTGTCTTATTTTTAATTGCCGTGGCTGCCTCAGTGGTGGTGGTCGGTAATTTACCCGAGGGTGTTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTtct < 2:1547371/137‑1 (MQ=255) ccTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCTGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGc > 1:1329728/1‑140 (MQ=255) cTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCg > 1:266007/1‑140 (MQ=255) ttccccGGACCCTGTCTTCTTTTTATTGGCCGTTGCTCCCTAAAGGGTGGTGTTCGTTAATTTACCCGGCGGGGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGt < 2:1570179/137‑1 (MQ=255) tGTCGTTTTGTTAATGGCCGTTGCTGCCTAAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGAGGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAgcg < 2:165011/140‑1 (MQ=255) ttCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAgcgc < 1:804792/139‑1 (MQ=255) gTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAgcgc > 2:707830/1‑140 (MQ=255) tgttACTTTTAATTCCCTTTCCTGCCTCAGTGGTGGTGGTCGTTAATTTACCCGGGGGTGTTTTAAAACCCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgcc < 2:611390/137‑1 (MQ=255) tCGTATTGTTAATTGCCGTGGCTGCCTCAGTGGGGGTGGTCGGTAATTTATCCGGGGGTGGTTTTAAACCCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGcgcc < 2:1340230/140‑1 (MQ=255) tACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCa > 2:398075/1‑140 (MQ=255) aCTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCAt > 1:1571761/1‑140 (MQ=255) tGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCAttt > 1:1538697/1‑140 (MQ=255) ttAATTGCCTTGGCTGCCTGACTGGGGGTGGGGGGTAGTTTCCGCGAGGGGGCGTTTAAACCCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtgt < 2:266007/140‑1 (MQ=255) ttAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtgt < 1:903328/140‑1 (MQ=255) ttAATTGCCGTTGCTGCCTAAATGGTGGTGGTCGGTAACTTACCCGAGGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTtgt < 1:367727/140‑1 (MQ=255) atttGCCGTTGCTCCCTCAAGGGTGGTGGTGGGTAATTTACCCGGCGGTGCGTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGa < 2:965008/138‑1 (MQ=255) aaTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGa > 2:418980/1‑140 (MQ=255) aaTTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGa > 1:357013/1‑140 (MQ=255) tGCCGTTGCTCCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAATTTATCCGGCGGTGGTTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGacca < 1:238371/140‑1 (MQ=255) ggcggTTGCTCCCTCAAGGGTGGTGGTCGGTACTTTACCGGACGGTGCGTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGacca < 1:391443/136‑1 (MQ=255) ggCCGTTGCTGCCTCAATGGGGGTGGTCGGTAATTTACCCGCCGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGacca < 1:1106615/139‑1 (MQ=255) gCCGTTCCTCCCTAATGGGGGGTGGCCGTCAATTAACCCGGCGGTCCTTTTAAAACCTCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGaccac < 2:179876/140‑1 (MQ=255) ccggTTGCCGCTCCAATGGTGGTGGTCGTTATTTTACCCGCCGGTGGTTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGaccac < 1:1163554/137‑1 (MQ=255) cGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCg > 1:783698/1‑140 (MQ=255) ttGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGt > 2:1284637/1‑140 (MQ=255) ttGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGt > 1:752405/1‑140 (MQ=255) ttGCTGCCTAAGTGGTGGTGGTCGGTAACTTACCCGCGGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGt < 2:1045402/140‑1 (MQ=255) ctgcCTCAATGGTGGTGGTCGGTAATTTATCCGACGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTa < 1:1011440/140‑1 (MQ=255) ctgcCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTa > 1:946309/1‑140 (MQ=255) ccTAAAGGGGGGTGGTCGGTAACTTACCCGACGGTGCTTTAAAACCCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGt < 1:68374/140‑1 (MQ=255) ctaaaTGGTGGGGGTCGGTAACTTACCCGACGGTGCTTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTa < 1:1277519/137‑1 (MQ=255) cacAATGGTGGTGGTGGTTAACTTACCCGAGGGTGCTTTAAAACCCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTa < 2:1023175/138‑1 (MQ=255) ttggggggggTCGGTACCTTCTCCGGGGGTCGTTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACg < 2:870946/139‑1 (MQ=255) ggggggtggtCGTTATCTTATCCGGCGGTGCTTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACAACCGGTTTAGGTAAACGt < 2:255201/136‑1 (MQ=255) gtggtgggCGTTATCTTATCCGACGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTAt < 2:1271840/140‑1 (MQ=255) ggtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTg > 2:1493566/1‑140 (MQ=255) ggtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTg > 1:150583/1‑140 (MQ=255) ggtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTg > 2:1192930/1‑140 (MQ=255) gtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGc > 1:651350/1‑140 (MQ=255) gtggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGc > 1:1511372/1‑140 (MQ=255) tggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGcc > 1:1310677/1‑140 (MQ=255) tggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGcc > 1:136022/1‑140 (MQ=255) tggtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGcc < 1:935939/140‑1 (MQ=255) gtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTa > 1:102326/1‑140 (MQ=255) gtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTa > 2:401214/1‑140 (MQ=255) gtCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTa > 2:653057/1‑140 (MQ=255) gTAACTTATCCAACGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctg < 1:1375807/140‑1 (MQ=255) atttACCCGAGGGTGCGTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgctg < 2:518461/138‑1 (MQ=255) aTCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTg > 2:65438/1‑140 (MQ=255) aTCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTg > 1:1453919/1‑140 (MQ=255) ccGAGGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGt < 2:136022/140‑1 (MQ=255) gACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaa > 2:574130/1‑140 (MQ=255) ggggTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaaa < 2:420405/138‑1 (MQ=255) ggggTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTaaa < 2:1352018/138‑1 (MQ=255) aCGGTGCTTTAAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTACTGATTGGTaaa < 1:82996/140‑1 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgctg < 1:434450/128‑1 (MQ=255) gTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATctgctg > 2:434450/1‑128 (MQ=255) tttttAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGt < 1:1563682/138‑1 (MQ=255) cGTTTAAACCCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGt < 1:241115/140‑1 (MQ=255) taaaacCCCCCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAac < 2:1571761/138‑1 (MQ=255) accaccGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAAcaccac > 1:1145356/1‑140 (MQ=255) accaccGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAAcaccac > 2:1066383/1‑140 (MQ=255) | GCGTGGGTGCTTTTTGGTATTTACCTGGCGGCCATTGTGGGGCTGGTTATCAAGCCTTT‑CCCGGAACCTGTCGTACTGTTAATTGCCGTTGCTGCCTCAATGGTGGTGGTCGGTAACTTATCCGACGGTGCGTTTAAAACCACCGCCGTATTAAGCGGTTACTCTTCAGGTACCACCTGGCTGGTGTTCTCGGCGTTTACCTTAAGCGCCGCATTTGTGACCACCGGTTTAGGTAAACGTATTGCCTATCTGCTGATTGGTAAAATCGGTAACACCAC > NC_000913/801980‑802257 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |