New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | = 484317 | 150 (0.980) | 6 (0.040) +AACGATCTCCGCCTC |
3/248 | 10.7 | 3.5% | coding (87/3150 nt) | acrB | multidrug efflux pump RND permease AcrB |
? | NC_000913 | 3415176 = | 217 (1.420) | coding (144/3105 nt) | acrF | multidrug efflux pump RND permease AcrF | |||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 217 total aligned reads displayed.
AAACTTTTTTATTCGACGACCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAGCGTGACAATTACCCTTACCTTC > NC_000913/3415038‑3415314 | aaaCTTTTTTATTCGACGACCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACt > 2:2258391/1‑140 (MQ=255) tttATTCGACGACCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCggg > 1:2268845/1‑140 (MQ=255) ttCGACGACCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCt < 2:1413303/140‑1 (MQ=255) ttCGACGACCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCt < 1:1305871/140‑1 (MQ=255) gacgacCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGAt > 1:740277/1‑140 (MQ=255) gacgacCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGAt > 1:1380698/1‑140 (MQ=255) gacgacCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGAt > 1:1888558/1‑140 (MQ=255) gacgacCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGAt > 2:2044754/1‑140 (MQ=255) cgacCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATgc < 2:1665743/140‑1 (MQ=255) gacCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATgcg < 1:1186366/140‑1 (MQ=255) ccGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGGGCACTGGCGATCCCACAATTGCCCGTCGTCCAGTATCCAAAAATTTCACCGCCGGCGGTTTTTGTTTTAGCAAACTATCCCGGCGCCGATtcgcc > 2:1062142/1‑139 (MQ=255) gATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCaaa < 1:302363/140‑3 (MQ=255) gATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGa < 1:1136978/140‑1 (MQ=255) gATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGa < 2:1189320/140‑1 (MQ=255) gATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGa < 2:2136836/140‑1 (MQ=255) gATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGa < 1:1613751/140‑1 (MQ=255) gATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGa < 2:675777/140‑1 (MQ=255) ttGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTg < 2:2365515/140‑1 (MQ=255) ttGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTg < 2:777931/140‑1 (MQ=255) gCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCa < 2:1691850/140‑1 (MQ=255) tGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGa < 1:805175/140‑1 (MQ=255) tGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGa < 1:1410850/140‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATa > 1:311449/1‑140 (MQ=255) ggTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATa < 2:1832229/140‑1 (MQ=255) ggTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATa < 2:1209119/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCATTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATAc < 1:522866/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATAc < 1:1880334/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATAc < 1:2466310/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATAc < 2:1035873/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATAc < 1:485526/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATAc < 1:1481032/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATAc < 2:2568944/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATAc < 2:740277/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATAc < 2:807073/140‑1 (MQ=255) gTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATAc < 2:94474/140‑1 (MQ=255) tGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACg < 1:2373554/140‑1 (MQ=255) tGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACg < 1:212298/140‑1 (MQ=255) cTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGt > 1:896586/1‑140 (MQ=255) ttattCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAg > 2:82535/1‑140 (MQ=255) tattCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAgg < 1:654115/140‑1 (MQ=255) tCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTa < 2:311449/140‑1 (MQ=255) tCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTa < 2:390758/140‑1 (MQ=255) cTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTAt < 2:1319421/140‑1 (MQ=255) tgatgaTGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCGACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATc > 1:345425/1‑140 (MQ=255) tgatgGCGGGCGCCCTGGCGATCCTACAATTGCACGTCGCTCAGTATCAAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGaa < 2:1973588/140‑1 (MQ=255) tgatgGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGaa < 1:1258812/140‑1 (MQ=255) tgatgGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGaa < 1:505613/140‑1 (MQ=255) gatgGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAAc < 2:146026/140‑1 (MQ=255) gatgGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAAc < 1:665593/140‑1 (MQ=255) atgGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACa > 1:1752984/1‑140 (MQ=255) tgGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAg < 2:2423945/140‑1 (MQ=255) tgGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAg < 1:1573711/140‑1 (MQ=255) ggcgggcgCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGa > 1:2071020/1‑140 (MQ=255) ggcgggcgCACTGGCGATACTACAATTGCCCGTCGCCCAGTATCCAACAATTGCCCCGCCCGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCCGGTGCTGATGCGCCGACCGTGCAGGATACGGTGACGGCTGTTATCGAACAGa > 2:2496979/1‑140 (MQ=255) cgcACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGa < 2:1142155/140‑1 (MQ=255) gcACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGaa < 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< 1:684723/140‑1 (MQ=255) ccTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATa < 1:2034922/140‑1 (MQ=255) ccTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATa < 2:2268845/140‑1 (MQ=255) cccgaaTTGCCCGTGGCTCAGTATCCAACAATTGCGCCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGATCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCAAACAGAATATGAACGGTATCGATaa < 2:501125/136‑1 (MQ=37) cTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATaa < 1:115256/140‑1 (MQ=255) cTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATaa > 1:2283904/1‑140 (MQ=255) tACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAAc < 1:1992862/140‑1 (MQ=255) tACAATTGCCCGTCCCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAAc < 1:1062142/140‑1 (MQ=255) aCAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCGGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAAcc < 2:1380698/140‑1 (MQ=255) aCAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAAcc < 2:1888558/140‑1 (MQ=255) cAATTGCCGGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCt < 1:1639705/140‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTg < 2:1809300/140‑1 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(MQ=255) cGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGtata < 2:240650/140‑1 (MQ=255) cGTCGCTCAATATCCAAAAAATCCCCCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTTATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGtata < 1:220681/140‑1 (MQ=25) cAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGtcccg < 1:380029/140‑3 (MQ=255) aGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGtcctcc > 2:463009/1‑140 (MQ=255) aTCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTccacc < 1:82535/140‑1 (MQ=255) ttGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCTGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTcc > 1:698955/1‑140 (MQ=255) ttGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTcc > 1:1849048/1‑140 (MQ=255) ttGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTcc > 1:1053650/1‑140 (MQ=255) gCACCGCCTGCGGCTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTccgc > 1:27544/1‑140 (MQ=255) cACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTccgcc > 2:2077392/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAg > 2:647726/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAg > 1:1241986/1‑140 (MQ=255) ccTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAg > 2:1661145/1‑140 (MQ=255) gCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAGCGt < 2:186748/140‑1 (MQ=255) gCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAGCGt < 2:2179817/140‑1 (MQ=255) tttCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAGCGTGACa < 2:1230787/140‑1 (MQ=255) ttCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAGCGTGACaa < 2:261771/140‑1 (MQ=255) ttCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAGCGTGACAATTAccc < 2:393506/140‑1 (MQ=255) aGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAGCGTGACAATTACCCTTa > 1:325064/1‑140 (MQ=255) aGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAGCGTGACAATTACCCTTa > 2:1613942/1‑140 (MQ=255) aCTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAGCGTGACAATTACCCTTACCTTc < 1:446864/140‑1 (MQ=255) | AAACTTTTTTATTCGACGACCGATATTTGCATGGGTGCTGGCCATTATTCTGATGATGGCGGGCGCACTGGCGATCCTACAATTGCCCGTCGCTCAGTATCCAACAATTGCACCGCCTGCGGTTTCTGTTTCAGCAAACTATCCGGGCGCTGATGCGCAGACCGTGCAGGATACGGTGACGCAGGTTATCGAACAGAATATGAACGGTATCGATAACCTGATGTATATGTCCTCCACCAGCGATTCCGCCGGTAGCGTGACAATTACCCTTACCTTC > NC_000913/3415038‑3415314 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |