| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| MC JC | NC_000913 | 1,965,595 | Δ12,908 bp | IS1‑mediated | [flhB]–flhD | [flhB], cheZ, cheY, cheB, cheR, tap, tar, cheW, cheA, motB, motA, flhC, flhD |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 1965595 | 1979175–1978503 | 12909–13581 | 107 [0] | [47] 48 | [flhB]–[insA‑5] | [flhB],cheZ,cheY,cheB,cheR,tap,tar,cheW,cheA,motB,motA,flhC,flhD,insB‑5,[insA‑5] |
| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 1965594 | 0 (0.000) | 107 (0.780) | 74/432 | 0.5 | 100% | coding (598/1149 nt) | flhB | flagellar biosynthesis protein FlhB |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
ACTGCAACGCTACCGAATAGTGGGTCGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1965360‑1965594‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCC > NC_000913/1978503‑1978729 ACTGCAACGCTACCGAATAGTGGGTCGGGTTATTGACAATTACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGTATGACGGTA < 1:451406/239‑1 CAACGCTACCGAATAGTGGGTCGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATATGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGA > 2:484687/1‑239 CAACGCTACCGAATAGTGGGTCGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGA > 1:63275/1‑239 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CCGAATAGTGGGTCGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTT > 1:1161461/1‑240 TAGTGGGTCGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGA > 2:1102119/1‑240 GTGGGTCGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGAT < 1:933406/239‑1 GGTCGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTG > 1:499037/1‑240 TCGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTT > 2:160136/1‑240 CGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT > 1:426784/1‑240 CGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTT > 1:302975/1‑240 ATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:1014686/240‑1 TTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCATGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTT < 1:684212/239‑1 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> 1:727871/1‑240 TCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCC < 2:416601/239‑1 CCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGA < 2:727868/240‑1 CCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCG > 2:768501/1‑239 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CTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCG < 1:208912/240‑1 CATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGC < 2:1416288/239‑1 ATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCT < 1:1312267/239‑1 ATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCT < 1:138135/239‑1 TCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGAAGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATACAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGC > 1:641232/1‑240 TCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGC > 1:885962/1‑240 TCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGC > 2:873714/1‑240 TCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCG < 2:1284850/239‑1 TCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCG < 2:1546597/239‑1 CTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCT < 2:63274/198‑1 CCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCGCCATTGGAATGCCGGTAATGACTACAACTTATTGATAGTGTTTTATGTGCAGATAATGCGCGATGACTTTGTCATGAAGCTTCACCGTATTTGAGAACGACAGCGCGTTCCGTC > 1:1245471/1‑173 CCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCGGCCGTGCCAGGTGCTGCCTC > 2:765495/1‑196 CCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCT > 1:1088585/1‑240 CCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGACGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCT > 1:1066489/1‑240 CGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCG < 2:793354/221‑1 TGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGAT > 2:373243/1‑240 GACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTG > 2:855181/1‑234 ACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTG < 1:768504/240‑1 ACGCAGCGTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTG < 2:448005/240‑1 AGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGC > 2:1056321/1‑240 CTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGC > 2:1362436/1‑238 CTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGT > 2:911782/1‑233 CAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCATCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATGCGCTGCGTATAT < 2:195217/211‑1 GGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGTCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGC < 1:664524/240‑1 GGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGC < 1:888930/240‑1 GGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGC < 2:277876/240‑1 GGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGC < 1:758561/240‑1 GGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGG > 2:912387/1‑239 GCTGAATATTTGGAAAAAGACGCCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGC > 2:95286/1‑239 CTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGG > 1:1180326/1‑240 CTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGACGGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCGCAATTCGCTG > 2:45731/1‑197 TGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGG < 2:1221290/239‑1 TGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGG < 1:979317/239‑1 AATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCTACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGAT < 2:665937/240‑1 GGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACA > 2:1239291/1‑240 AAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGC < 1:1408802/240‑1 CGTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCGTACAGCGGCCAGC < 1:671273/240‑1 GTCAAATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGAGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCC < 1:637533/240‑1 ATCCCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCG < 1:506879/240‑1 CCACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCA < 1:988903/240‑1 CACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCAT < 1:1131469/240‑1 ACCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCGGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCAT < 2:109950/239‑1 CCATTGGAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCC > 1:588521/1‑240 GAATGACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGC < 2:497127/201‑1 ACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGC < 2:1119994/108‑1 ACGGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGC > 1:1119998/1‑108 ACTGCAACGCTACCGAATAGTGGGTCGGGTTATTGACAATGACATCCGCTTTCGGCACATCGGCCATCATCCGACGCCGTGCAGCAGCTCGCTGCATCTGACGGATCCGCCCTTTAACATGAGGGTCACCTTCGCTTTGTTTGAACTCATCACGAATATCCTGCCGTGACATACGCAGCTTTTTCAGGTGGCTGAATATTTGGAAAAAGACGTCAAATCCCACCATTGGAATGAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1965360‑1965594‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑GGTAATGACTCCAACTTATTGATAGTGTTTTATGTTCAGATAATGCCCGATGACTTTGTCATGCAGCTCCACCGATTTTGAGAACGACAGCGACTTCCGTCCCAGCCGTGCCAGGTGCTGCCTCAGATTCAGGTTATGCCGCTCAATTCGCTGCGTATATCGCTTGCTGATTACGTGCAGCTTTCCCTTCAGGCGGGATTCATACAGCGGCCAGCCATCCGTCATCC > NC_000913/1978503‑1978729 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |