| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,972,641 | Δ5,862 bp | IS1‑mediated | [tar]–flhD | [tar], cheW, cheA, motB, motA, flhC, flhD |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
Only 100 of 107 total aligned reads displayed.
GTTTTCCTGGCGCTATCGAGCAATTCAACTTTGGCGTTACTTTGTTGATTGGAGGAATCCATCATCATCCGTACCGCTGAACGACTCAGGTTAATGCGCGTTTGCAGCATTAAATCCCAGGTTGACGTCAGCTCGCCCTGCTGTTCCCGTAATTGATTGGAAACCACAAAGCTCTTCTGGCTATGGTGAAGGGAAGAAAAAAACAGACTGCCGGAAATAAGCTGTAACAGTGCGAATACCCCCAGCACCATTACCAACAGCGTGACTACGCGGATACGGTTAATCATAAGGCACCTTCCTGAAAACAAGTTGATCTCGTTATCGGCAAGGAGGGGGGAAACTTTATTGCTGATGCCACCCGCCGCGAAATTGAAATAAAAAACCCGATGCGCAGATCATCGGGTTCATTTCAATTGAGGAAATCGGGAGAATTACGCCACTTCTGACGCCGCGCTATCTAACAGCGCCATC > NC_000913/1972405‑1972875 | gTTTTCCTGGCGCTATCGAGCAATTCAACTTTGGCGTTACTTTGTTGATTGGAGGAATCCATCATCATCCGTACCGCTGAACGACTCAGGTTAATGCGCGTTTGCAGCATTAAATCCCAGGTTGACGTCAGCTCGCCCTGCTGTTCCCGTAATTGATTGGAAACCACAAAGCTCTTCTGGCTATGGTGAAGGGAAGAAAAAAACAGACTGCCGGAAATAAGCTGTAACAGTGCGAAggta < 1:971659‑M1/240‑5 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |