| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
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| RA | BN000925 | 56,817 | Δ1 bp | coding (297/522 nt) | korF ← | KorF repressor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | BN000925 | 56,817 | 0 | G | . | 100.0% | 1135.2 / NA | 243 | coding (297/522 nt) | korF | KorF repressor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (122/121); total (122/121) | |||||||||||
Only 100 of 243 total aligned reads displayed.
TTGTTCGTCAGTCATGGTCCGCCCTCACCAGTTGTTCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCCGCCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGGGGCAGTGCGCCGCGCCGGCGGCGTCGTGGATGGCTCGGGTTGGCTGGCCTGCGACGGCCGGCGAAAGGTGCGCAGCAGCTCGTTATCGACCGGCTGCGGCGTCGGGGCCGCCGCCTTGCGCTGCGGTCGGTGTTCCTTCTTCGGCTCGCGCAGCTTGAACAGCATG > BN000925/56585‑57048 | ttGTTCGTCAGTCATGGTCCGCCCTCACCAGTTGTTCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGcc < 1:341547/238‑1 (MQ=255) cagtcaTGGTCCGCCCTCACCAGTTGTTCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGcc < 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cTCACCAGTTGTTCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATc > 2:606366/1‑238 (MQ=255) cTCACCAGTTGTTCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATc > 1:133857/1‑238 (MQ=255) gttgttCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTc < 1:530860/237‑1 (MQ=255) 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< 1:632860/238‑1 (MQ=255) gtCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGGGGCAGTgcgccg < 2:459479/210‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGTGGCAGTGCGCCGCGCCGGCGGCGTCGTGGATGGCTCGGGtt < 1:333856/237‑1 (MQ=255) cGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGGGGCAGTGCGCCGCGCCGGCGGCGTCGTGGATGGCTCGGGtt < 1:180306/237‑1 (MQ=255) 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TTGTTCGTCAGTCATGGTCCGCCCTCACCAGTTGTTCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCCGCCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGGGGCAGTGCGCCGCGCCGGCGGCGTCGTGGATGGCTCGGGTTGGCTGGCCTGCGACGGCCGGCGAAAGGTGCGCAGCAGCTCGTTATCGACCGGCTGCGGCGTCGGGGCCGCCGCCTTGCGCTGCGGTCGGTGTTCCTTCTTCGGCTCGCGCAGCTTGAACAGCATG > BN000925/56585‑57048 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |