| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | BN000925 | 45093 = | 176 (1.100) | 3 (0.020) | 3/404 | 14.0 | 1.7% | coding (951/2214 nt) | traE | TraE putative helicase |
| ? | BN000925 | 45154 = | 181 (1.170) | coding (890/2214 nt) | traE | TraE putative helicase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 186 total aligned reads displayed.
AAACCTTGGACGAGTTGAAGGCGCGGCTCTTGATCGTCGGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAGCGGCGCAGCCGCTTCCTTCGCCTTGGTGGTCACGGACACGATGCGGGCGGGTTGGCCGCTCACGGCGGCCGCGATGCCCTCGGCGTGCTCCTTGTTGCTGAGGCGGCCTTTCTCGTCCACCGGATCGCCGTCGGCGACCTGGTAACGGGCCGGGAACTGAATGCCCTCGACCTCGAACTGGCCGTTCACCAGGTAGTAGT > BN000925/44918‑45388 | aaaCCTTGGACGAGTTGAAGGCGCGGCTCTTGATCGTCGGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCg < 2:14388/239‑1 (MQ=255) ccTTGGACGAGTTGAAGGCGCGGCTCTTGATCGTCGGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCggc > 2:308109/1‑236 (MQ=255) ccTTGGACGAGTTGAAGGCGCGGCTCTTGATCGTCGGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTcc > 1:320916/1‑239 (MQ=255) ccTTGGACGAGTTGAAGGCGCGGCTCTTGATCGTCGGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTcc > 1:153514/1‑239 (MQ=255) aGGCGCGGCTCTTGATCGTCGGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTcagca < 1:278094/240‑1 (MQ=255) ggCGCGGCTCTTGATCGTCGGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTcagca < 1:135066/239‑1 (MQ=255) ggCGCGGCTCTTGATCGTCGGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTcagca < 1:153191/239‑1 (MQ=255) cgGCTCTTGATCGTCGGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAg > 2:3750/1‑227 (MQ=255) cgGCTCTTGATCGTCGGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGtt > 2:212522/1‑239 (MQ=255) tcgGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAgcggcg > 2:239335/1‑240 (MQ=255) cgGATTGGCGCGCTGCGCAGCAGCGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAgcggcg < 1:303074/239‑1 (MQ=255) 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cGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAGCGGCGCAGCCGCTTCCTTCGCCTtggtgg > 1:281590/1‑240 (MQ=255) cGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAGCGGCGCAGCCGCTTCCTTCGCCTtggtgg > 1:350294/1‑240 (MQ=255) cGGCCAGCATGGGGGCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAGCGGCGCAGCCGCTTCCTTCGCCTtggt > 2:356543/1‑238 (MQ=255) 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gggCCGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAGCGGCGCAGCCGCTTCCTTCGCCTTGGTGGTCACGGACACGa > 1:254448/1‑240 (MQ=255) ccGTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAGCGGCGCAGCCGCTTCCTTCGCCTTGGTGGTCACGGa < 2:230602/232‑1 (MQ=255) gTCTGTGCGATGGCCGCCAGCACGCCCGGCGCATCGCCGTGCTGTTCCTCGCTCAAGTATTCGCAGTCGGAACGGTTGTAGGTGATGAGCTTGTGCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAGCGGCGCAGCCGCTTCCTTCGCCTTGGTGGTCACGGACACGATgcgg > 2:273488/1‑240 (MQ=255) 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tgCTTCTCGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAGCGGCGCAGCCGCTTCCTTCGCCTTGGTGGTCACGGACACGATGCGGGCGGGTTGGCCGCTCACGGCGGCCGCGATGCCCTCGGCGTGCTCCTTGTTGCTGAGGCGGCCTTTCTCGTCCACCGGATCGCCGTCGGCGAcc > 1:338161/1‑240 (MQ=255) ctcGCGCAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAGCGGCGCAGCCGCTTCCTTCGCCTTGGTGGTCACGGACACGATGCGGGCGGGTTGGCCGCTCACGGCGGCCGCGATGCCCTCGGCGTGCTCCTTGTTGCTGAGGCGGCCTTTCTCGTCCACCGGATCGCCGTCGGCGACCTGGTa > 1:199657/1‑240 (MQ=255) gcgcAGGGCCTGCGTAATGTCCTTCACCTGGTCCGGCTTGAAGCCGAACTTGCGCGAGGCGTCCATTTGCAGTTTCAGCAGGTTGTAGGGCAGCGGCGCAGCCGCTTCCTTCGCCTTGGTGGTCACGGACACGATGCGGGCGGGTTGGCCGCTCACGGCGGCCGCGATGCCCTCGGCGTGCTCCTTGTTGCTGAGGCGGCCTTTCTCGTCCACCGGATCGCCGTCGGCGACCTGGTAAc < 1:40859/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |