Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 1,258,727 | A→G | intergenic (‑214/‑64) | pth ← / → ychH | peptidyl‑tRNA hydrolase/stress‑induced protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 1,258,727 | 0 | A | G | 100.0% | 96.9 / NA | 27 | intergenic (‑214/‑64) | pth/ychH | peptidyl‑tRNA hydrolase/stress‑induced protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (10/17); total (10/17) |
AATTTAATCGTCACGTTTTTTTGTCCTGAGTGTGTACATAACTGGCGCGTAGTTTACTGGTTGCGGCCCCGCTTGACAAAAAACTGCGTATCAAATGCAGATAACGTAATAATTGCCTGAGTGGACTATTAGAAAGTCAAGGTGTTCAGGCGTTTATTTGTAAAGTTTTGTTGAAATAAGGGTTGTAATTGTGATCACGCCCGCACATAACCCACTGGGTGTTGTCTATACTTTACACATAAGGAAGAGGGGTATTCCCTGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCAT > NC_000913/1258500‑1258954 | aatTTAATCGTCACGTTTTTTTGTCCTGAGTGTGTACATAACTGGCGCGTAGTTTACTGGTTGCGGCCCCGCTTGACAAAAAACTGCGTATCAAATGCAGATAACGTAATAATTGCCTGAGTGGACTATTAGAAAGTCAAGGTGTTCAGGCGTTTATTTGTAAAGTTTTGTTGAAATAAGGGTTGTAATTGTGATCACGCCCGCACATAACCCACTGGGTGTTGTCTGTACTTTAcaca < 1:274217/239‑1 (MQ=255) tCGTCACGTTTTTTTGTCCTGAGTGTGTACATAACTGGCGCGTAGTTTACTGGTTGCGGCCCCGCTTGACAAAAAACTGCGTATCAAATGCAGATAACGTAATAATTGCCTGAGTGGACTATTAGAAAGTCAAGGTGTTCAGGCGTTTATTTGTAAAGTTTTGTTGAAATAAGGGTTGTAATTGTGATCACGCCCGCACATAACCCACTGGGTGTTGTCTGTACTTTACACATAAGGaa < 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NC_000913/1258500‑1258954 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |