| Predicted mutation | ||||||
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| JC JC | NC_000913 | 1,258,873 | IS1 (–) +8 bp | coding (83‑90/279 nt) | ychH → | stress‑induced protein |
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| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
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GTTCAGGCGTTTATTTGTAAAGTTTTGTTGAAATAAGGGTTGTAATTGTGATCACGCCCGCACATAACCCACTGGGTGTTGTCTATACTTTACACATAAGGAAGAGGGGTATTCCCTGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGACAAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAACAAATAATGCAGTTTGCTGACCAGTCAGTTTGCGCTGACTGGTCAATCT > NC_000913/1258643‑1259118 | tatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCAATCCTCaa > 1:794215‑M2/231‑240 (MQ=255) 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1:1659645‑M1/1‑25 (MQ=255) ggtCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattac > 2:103006‑M1/1‑25 (MQ=255) gtCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagcc > 2:36047‑M1/1‑24 (MQ=255) ggcagcatcaccCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGc > 2:1408720‑M2/13‑112 (MQ=255) tGGGGTATTCAATCCTCggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtc > 1:240746‑M1/1‑17 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |