| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1552320 = | NA (NA) | 1565 (10.860) | 230/432 | 0.0 | 93.2% | noncoding (27/29 nt) | other | REPv121b |
| ? | NC_000913 | = 1563331 | 115 (0.800) | intergenic (‑255/+3) | ddpX/dosP | D‑alanyl‑D‑alanine dipeptidase/oxygen‑sensing c‑di‑GMP phosphodiesterase DosP | |||||
Only 100 of 1565 total aligned reads displayed.
GACAGGAAAAGCAGCTTTGACGCCAGAAATGGCGATTAAACTTTCCGTGGTGATCGGCAGTTCGCCGCAAATGTGGCTGAATCTGCAAAACGCCTGGAGTCTGGCAGAGGCAGAAAAAACAGTGGATGTGTCGCGATTACGCCGTCTGGTTACGCAATAAAAAAATGGCACTTTATAAAGCGCCATTTAGAACTGATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1552557‑1552320‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCGCAGCAATTTTTGTCT < 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CATTTAGAACTGATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCT > 1:630603/1‑240 ATTTAGATCTGATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCCCTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACG < 1:1566999/181‑1 GATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCAT < 1:248444/240‑1 ATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATG > 1:915166/1‑240 ATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATG > 1:1049707/1‑240 ATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCT > 1:391253/1‑222 ATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATAAAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCAT > 1:197436/1‑239 ATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTA > 2:893534/1‑115 ATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACT < 2:441889/94‑1 TGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCAT < 1:97055/238‑1 CAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCAT < 1:829396/240‑1 CAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCAT < 1:1239336/240‑1 CAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCAT < 1:1134836/240‑1 AAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCAT > 1:1271863/1‑239 CGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAG < 2:536000/239‑1 CGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAG < 1:491910/239‑1 CGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAG < 2:1364872/239‑1 CGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAG < 2:1329247/239‑1 CAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGAT > 2:589158/1‑239 CAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCACGAGATC > 1:43688/1‑240 ACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCAT < 1:789845/232‑1 TGCGCTACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGC > 2:1066956/1‑190 TACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCG > 2:1302152/1‑239 TACGCTTATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCACGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCG > 2:1270258/1‑239 ATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACCAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCG > 2:1043583/1‑200 ATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCGCAGCAATT > 2:819523/1‑240 ATCAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAA < 2:202444/123‑1 CAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCGCAGCAATTT < 2:374810/239‑1 CAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCGCAGCAATTT < 2:254651/239‑1 CAGGCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCGCAGCAATTT < 2:1597794/239‑1 GCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATTTAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCC > 2:859503/1‑194 GCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCGCAGCCATTTT > 2:39733/1‑237 GCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCGCAGCAATTTTTGT > 1:468677/1‑240 GCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCGCAGCAATTTTTGT > 1:940775/1‑240 GCCAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTAC > 1:588811/1‑76 CAATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCGCAGCAATTTTTGTCT < 1:745763/240‑1 GACAGGAAAAGCAGCTTTGACGCCAGAAATGGCGATTAAACTTTCCGTGGTGATCGGCAGTTCGCCGCAAATGTGGCTGAATCTGCAAAACGCCTGGAGTCTGGCAGAGGCAGAAAAAACAGTGGATGTGTCGCGATTACGCCGTCTGGTTACGCAATAAAAAAATGGCACTTTATAAAGCGCCATTTAGAACTGATGACAAACGCAACATTGCCTGATGCGCTACGCTTATCAGGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1552557‑1552320‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑AATTCCTCTCGCCCGCACTCGCGGGTTTTCATTTAACGTGACACTGTCACTTAAATACTGTGATTTCAGCTACGATTCCGGGAGATTCCTTCCTTAACTTCCCCTCTTGCACCAAAACTGCACTACGCTGCACAAATGTTGATCAAAAGTTAAAAAATATAACTTTAAGCCAGCATTCTGGCGCTTATCCCGGCATGGCATGAGATCTGCATAAGCGGAAAGCGCAGCAATTTTTGTCT < NC_000913/1563331‑1563093 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |