| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | 1560067 = | 2046 (14.200) | 13 (0.090) | 10/414 | 9.3 | 0.66% | coding (863/1023 nt) | ddpB | putative D,D‑dipeptide ABC transporter membrane subunit DdpB |
| ? | NC_000913 | 1560214 = | 1963 (14.220) | coding (716/1023 nt) | ddpB | putative D,D‑dipeptide ABC transporter membrane subunit DdpB | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 215 total aligned reads displayed.
TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1560314‑1560067‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctggcccggGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGATG > NC_000913/1560214‑1560452 TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 1:471561/240‑1TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 2:752263/240‑1TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 2:624159/240‑1TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 1:163741/240‑1TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 1:1345138/240‑1TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 2:320792/240‑1TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 1:503073/240‑1TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 1:116412/240‑1TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCGCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 1:830559/240‑1 TACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 1:1433673/239‑1 TACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 2:1097741/239‑1 ACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCT > 1:581823/1‑239 ACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCT > 2:558269/1‑239 ACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCT > 2:1475739/1‑239 ACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCT > 1:269363/1‑239 ACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCT > 1:19691/1‑239 ACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCT > 1:95700/1‑239 ACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCT > 2:123582/1‑239 ACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCT > 1:1503651/1‑239 CCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGG < 1:497009/240‑1 CCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGG > 1:1563628/1‑240 CCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGG > 2:1101505/1‑240 CGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGC < 1:1338699/240‑1 CGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGGTTTTGCCTG > 1:231635/1‑238 GGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCC < 1:1425973/240‑1 GGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCC < 1:415758/240‑1 GGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCC < 1:748230/240‑1 GGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCC < 1:1116226/240‑1 CATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCG < 1:223841/240‑1 CATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCG > 1:806133/1‑240 CATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCG > 1:1484101/1‑240 CATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCC > 2:132364/1‑239 CATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 1:1474264/233‑1 CATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 2:350832/233‑1 CATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 1:484398/233‑1 ATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCGG > 2:828206/1‑240 TTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCGGG < 1:181773/240‑1 TTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 2:1600903/231‑1 TAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCGGGC < 1:1510774/240‑1 ACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 1:1004087/228‑1 GGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCC > 1:319665/1‑228 CTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC < 2:207674/210‑1 CTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCG > 1:1063442/1‑204 CTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCC < 1:1100885/189‑1 TGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCGGGCGGTA < 1:1399163/190‑1 CTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCC > 2:159298/1‑174 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TGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCC > 2:919237/1‑90 TGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCC < 1:919239/90‑1 GGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCGGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACG > 1:1079190/1‑240 TGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCC > 2:1246438/1‑36 TGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCC < 1:1246441/36‑1 TGGCCCGGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTT > 1:103107/1‑240 GGCCCGGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTT > 2:274370/1‑239 GGCCCGGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGG < 1:539106/195‑1 GGCCCGGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGACGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTTACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAACCGGTAAC > 2:701093/1‑186 CCCGGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCA < 2:90467/240‑1 CCCGGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCA < 1:29255/240‑1 CCGGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAG < 1:251631/240‑1 CCGGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCC < 1:75997/88‑1 CCGGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAAGTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAG < 2:286604/240‑1 CGGGCGGTACGAATCTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCG < 2:1249165/100‑1 GGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTTCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGAT < 2:665070/240‑1 GGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGTAGAATTTGCAGAT < 2:965698/240‑1 GGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGAT < 2:375597/240‑1 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GGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGAT < 2:939766/240‑1 GGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGAT < 2:239699/240‑1 GGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGAT < 2:22428/240‑1 GGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGAT < 2:1402482/240‑1 GGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGAT < 2:179569/240‑1 GGGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGAT < 1:600516/240‑1 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GGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGGAGAATTTGCAGATG > 1:1591964/1‑240 GGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGATG > 2:872614/1‑240 GGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGATG > 1:1273327/1‑240 GGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGATG > 1:68744/1‑240 GGCCGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCA < 2:1385186/157‑1 TTACCGGCATTAACGCTGGCGTTCGTTCACCTGGGAATTGTCGCTCGCCAGATCCGCTCAGCGATGCTGGAACAATTGAGTGAAGACTACATTCGTACCGCCCGGGCCAGCGGCTTGCCCGGCTGGTATATCGTTTTATGTTATGCGCTACCCAATGCGTTGATCCCATCGATTACCGTATTGGGTTTGGCGCTGGGCGATTTGTTGTATGGCGCAGTGCTCACCGAAACCGTTTTTGCCTGGCCCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < NC_000913/1560314‑1560067‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctggcccggGCGGTACGAATGTAGTCTTCACTCAATTGTTCCAGCATCGCTGAGCGGATCTGGCGAGCGACAATTCCCAGGTGAACGAACGCCAGCGTTAATGCCGGTAAGATGAGATGTTGCAACGCATTGAAGAAGACTTCACCGTTGCCTTCAAGCAGCGCATCGAGCAGATAAAAGCCGGTAACGTGCGTTGGTGGATCCAGCCAGTCATCAAGCCTTCCGCCGCCGGGAAGAATTTGCAGATG > NC_000913/1560214‑1560452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |