Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
JC JC | NC_000913 | 486,043 | IS1 (–) +9 bp | coding (283‑291/648 nt) | acrR → | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 155 (1.080) | 82/430 | 0.4 | 100% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | = 486051 | 0 (0.000) | coding (291/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR | |||||
* | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 153 (1.060) | 83/432 | 0.4 | 100% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
? | NC_000913 | 486043 = | 0 (0.000) | coding (283/648 nt) | acrR | DNA‑binding transcriptional repressor AcrR |
Only 100 of 306 total aligned reads displayed.
GATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAAGCAGCTGGCGTTACGCGCGGTGCAATCTACTGGCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGCGGATTTAATGACGCGTCGCGCAGCAATTATTATGCGCGGCTATATTTCCGGCCTGATGGAAA > NC_000913/485812‑486289 | tatcaatgattttctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaattgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTg > 2:137604‑M2/231‑240 (MQ=255) cGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAAGCAGCTGGCGTTACGCGCGGTGCAATCTACTGGCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactcc < 1:155397‑M2/240‑13 (MQ=255) tctggtgcgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTg > 1:576498‑M2/219‑239 (MQ=255) cgtaccgggttgagaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACagaag > 1:1335752‑M2/212‑239 (MQ=255) agaagcggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCg > 2:1538504‑M2/200‑237 (MQ=255) ggtgtaagtgaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacattaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGAt < 1:1523427‑M2/47‑1 (MQ=255) aCCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAAGCAGCTGGCGTTACGCGCGGTGCAATCTACTGGCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagata < 2:1203009‑M2/240‑43 (MQ=255) gaactgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATta < 2:348269‑M2/55‑1 (MQ=255) gCTGGGCGAGATTGCAAAAGCAGCTGGCGTTACGCGCGGTGCAATCTACTGGCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcc < 1:1128819‑M2/240‑48 (MQ=255) ctgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGatta > 2:168417‑M2/182‑223 (MQ=255) ctgcagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATAtt > 1:1418868‑M2/182‑240 (MQ=255) gCGAGATTGCAAAAGCAGCTGGCGTTACGCGCGGTGCAATCTACTGGCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatg > 1:350551‑M2/1‑188 (MQ=255) cagttgccatgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCca < 1:481829‑M2/62‑1 (MQ=255) gagaTTGCAAAAGCAGCTGGCGTTACGCGCGGTGCAATCTACTGGCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatga > 2:1117500‑M2/1‑186 (MQ=255) ttGCAAAAGCAGCTGGCGTTACGCGCGGTGCAATCTACTGGCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttg > 2:155397‑M2/1‑182 (MQ=255) atgttttacggcagtgagagcagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCg > 1:587682‑M2/171‑240 (MQ=255) cagagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGc < 1:471618‑M2/89‑1 (MQ=255) agagatagcgctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCtg > 1:1091180‑M2/150‑240 (MQ=255) agagatagcgctgatgtccggcggtgcgtttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAAt < 2:621717‑M2/73‑1 (MQ=255) ggTGCAATCTACTGGCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGG‑AACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaac < 1:1492419‑M2/240‑86 (MQ=255) gTGCAATCTACTGGCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTAGGAACAGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTtgtattgactccaacttattgctagtgtttta > 2:325816‑M2/1‑155 (MQ=255) gctgatgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAAc < 2:551128‑M2/100‑1 (MQ=255) tgtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGc < 2:104761‑M2/104‑1 (MQ=255) gtccggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGcac < 1:167256‑M2/106‑1 (MQ=255) gCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc < 2:1332824‑M2/240‑99 (MQ=255) gCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttcc < 1:7738‑M2/240‑99 (MQ=255) cggcggtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACaa > 2:1339201‑M2/132‑239 (MQ=255) ttttAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgctttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtc < 1:621717‑M2/240‑102 (MQ=255) gtgcttttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCg > 2:782338‑M2/127‑164 (MQ=255) aaaGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccag > 1:194385‑M2/1‑135 (MQ=255) ttgccgttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCtctgt < 2:926792‑M2/120‑1 (MQ=255) gttacgcaccaccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTgg < 2:898789‑M2/124‑1 (MQ=255) caccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGa < 2:1091178‑M2/134‑1 (MQ=255) caccccgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGa < 2:1065464‑M2/134‑1 (MQ=255) tGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagat > 1:381358‑M2/1‑112 (MQ=255) tGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagat < 2:753867‑M2/240‑129 (MQ=255) cgtcagtagctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGca < 2:601137‑M2/105‑1 (MQ=255) agaTCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagatt < 1:1572749‑M2/239‑130 (MQ=255) tCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcagg < 2:1263802‑M2/240‑134 (MQ=255) gctgaacaggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACa < 2:646508‑M2/146‑1 (MQ=255) aaCTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatg > 1:1212169‑M2/1‑101 (MQ=255) tGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgc < 1:1597875‑M2/240‑143 (MQ=255) tGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgc < 1:1070267‑M2/240‑143 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacgccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTa < 1:1173506‑M2/153‑1 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTa < 2:691482‑M2/153‑1 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTa < 2:46006‑M2/153‑1 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTa < 1:140183‑M2/153‑1 (MQ=255) aggagggacagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTa < 2:846992‑M2/153‑1 (MQ=255) gAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaat < 1:523659‑M2/240‑148 (MQ=255) ccAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgc > 1:858875‑M2/1‑89 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTc < 2:141168‑M2/78‑1 (MQ=255) acagctgatagaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACAt > 1:1158706‑M2/80‑238 (MQ=255) aaTATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgct > 2:381943‑M2/1‑87 (MQ=255) atatTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgc < 2:1367645‑M2/240‑155 (MQ=255) gTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatat < 2:291517‑M2/240‑161 (MQ=255) gTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatat < 1:1238085‑M2/240‑161 (MQ=255) agaaacagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGa < 2:1308945‑M2/134‑1 (MQ=255) aaCTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgacttcgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattagctgcgtatatcg < 1:848399‑M2/239‑163 (MQ=255) cagaagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGTTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTTTGTCTGGTAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACa > 2:1188259‑M2/66‑223 (MQ=255) gagCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgc < 2:1492505‑M2/239‑168 (MQ=255) agCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgact > 2:1003755‑M2/1‑71 (MQ=255) aagccactggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGaa > 2:203906‑M2/63‑230 (MQ=255) gCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctga < 2:1101737‑M2/240‑171 (MQ=255) tGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgatt < 1:495536‑M2/239‑173 (MQ=255) ctggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTg < 1:212758‑M2/184‑1 (MQ=255) tggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGc < 2:922977‑M2/185‑1 (MQ=255) ggagcacctcaaaaacaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGc < 2:1574054‑M2/185‑1 (MQ=255) aaTTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatg > 2:1432563‑M2/1‑53 (MQ=255) acaccatcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGCGGATTTAATGAcgcg < 1:1191466‑M2/200‑1 (MQ=255) ccTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcg > 2:488730‑M2/1‑48 (MQ=255) caccatcatacactaactcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAAtc < 2:213157‑M2/115‑1 (MQ=255) tGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggc > 1:410635‑M2/1‑46 (MQ=255) ggCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggc > 1:69642‑M2/1‑45 (MQ=255) catcatacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAgaagaa < 1:924678‑M2/30‑1 (MQ=255) gCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgg > 2:1597872‑M2/1‑44 (MQ=255) cGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgg > 1:659305‑M2/1‑43 (MQ=255) catacactaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGCGGATTTAATGACGCGTCgcgc < 1:387423‑M2/206‑1 (MQ=255) aTCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggat < 1:1006123‑M2/240‑200 (MQ=255) tctaaatcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCtctgtct < 2:658523‑M2/122‑1 (MQ=255) atcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGa < 2:528771‑M2/134‑1 (MQ=255) atcagtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGCGGATTTAATGACGCGTCGCGCAGCAattatt > 2:1453928‑M2/24‑239 (MQ=255) tATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggc < 1:305752‑M2/240‑212 (MQ=255) agtaagttggcagcatcaccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGCGGATTTAATGACGCGTCGCGCAGCAattattattc > 1:807695‑M2/21‑238 (MQ=255) tAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcg < 2:578403‑M2/176‑151 (MQ=255) aaGAGAGATATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagc < 2:408986‑M2/240‑216 (MQ=255) agagaTATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccat > 1:1345208‑M2/1‑22 (MQ=255) gagaTATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccat > 1:753867‑M2/1‑21 (MQ=255) gaTATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatcc < 1:647123‑M2/239‑221 (MQ=255) gaTATTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagc > 2:1139677‑M2/1‑19 (MQ=255) atatTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccg > 2:1230626‑M2/1‑18 (MQ=255) atatTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccg > 1:1613034‑M2/1‑18 (MQ=255) tatTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtc > 1:1148020‑M2/1‑17 (MQ=255) tatTAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtc > 2:1468584‑M2/1‑17 (MQ=255) ttAATTCATGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcat > 1:1307259‑M2/1‑15 (MQ=255) caccCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGCGGATTTAATGACGCGTCGCGCAGCAATTATTATGCGCGGCTATATTTCCg < 1:547453‑M2/235‑1 (MQ=255) tGTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatc < 1:734728‑M2/239‑233 (MQ=255) gTTCTTggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcac < 1:2360‑M2/240‑235 (MQ=255) gTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGCGGATTTAATGACGCGTCGCGCAGCaa < 2:868878/208‑1 (MQ=255) cTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACACCGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGCGGATTTAATGACGCGTCGCGCAGCAATTATTATGCGCGGCTATATTTCCGGCCTGATGGaa > 2:702193/1‑240 (MQ=255) tggtaatgactccaacttattgatagtgttttatgttcagataatgcccgatgactttgtcatgcagctccaccgattttgagaacgacagcgacttccgtcccagccgtgccaggtgctgcctcagattcaggttatgccgctcaattcgctgcgtatatcgcttgctgattacgtgcagctttcccttcaggcgggattcatacagcggccagccatccgtcatccatatcaccacg < 1:276943‑M2/239‑239 (MQ=255) | GATGTGGCTCTACGTCTTTTCTCACAGCAGGGGGTATCATCCACCTCGCTGGGCGAGATTGCAAAAGCAGCTGGCGTTACGCGCGGTGCAATCTACTGGCATTTTAAAGACAAGTCGGATTTGTTCAGTGAGATCTGGGAACTGTCAGAATCCAATATTGGTGAACTAGAGCTTGAGTATCAGGCAAAATTCCCTGGCGATCCACTCTCAGTATTAAGAGAGATATTAATTCATGTTCTTGAATCCACGGTGACAGAAGAACGGCGTCGATTATTGATGGAGATTATATTCCACAAATGCGAATTTGTCGGAGAAATGGCTGTTGTGCAACAGGCACAACGTAATCTCTGTCTGGAAAGTTATGACCGTATAGAACAAACGTTAAAACATTGTATTGAAGCGAAAATGTTGCCTGCGGATTTAATGACGCGTCGCGCAGCAATTATTATGCGCGGCTATATTTCCGGCCTGATGGAAA > NC_000913/485812‑486289 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |