New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | BN000925 | = 41125 | 273 (1.030) | 8 (0.030) | 8/422 | 17.9 | 2.9% | coding (1485/2241 nt) coding (2430/3186 nt) |
traC2 traC1 |
TraC DNA primase TraC DNA primase and ssDNA binding protein |
? | BN000925 | = 41183 | 261 (0.990) | coding (1427/2241 nt) coding (2372/3186 nt) |
traC2 traC1 |
TraC DNA primase TraC DNA primase and ssDNA binding protein |
|||||
Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. |
Only 100 of 273 total aligned reads displayed.
GCAGGGCCTCGGCAACAGCCTGTAGGTTGCCGGAATCGAACGCGGCGACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCTTCGTGCTGGCGTTCTTGTTCCTCGGCACGCGCGGCCAGCTTGGCCGCCGCCTCGGCCTGCATCTTGGCCTTCTCGGCGGGGTCCA > BN000925/40890‑41363 | gTAGGTTGCCGGAATCGAACGCGGCGACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAg < 2:130751/239‑1 (MQ=255) tAGGTTGCCGGAATCGAACGCGGCGACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAgg > 2:418699/1‑239 (MQ=255) tGCCGGAATCGAACGCGGCGACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCt > 1:452119/1‑240 (MQ=255) gCCGGAATCGAACGCGGCGACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTc > 2:369761/1‑238 (MQ=255) gCCGGAATCGAACGCGGCGACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCt < 1:108334/239‑1 (MQ=255) cctgAATCGAACGCGGCGACAGTCGCGTGCCCGAGCGCTTATGCCGCTGTGGCGGCGGTGGCATATCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCTACCGACGACATGTAAGTATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGTGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCTTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTgg < 2:237465/237‑1 (MQ=255) ccGGAATCGAACGCGGCGACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGGTGTAGGTTTTCTgg > 2:568312/1‑240 (MQ=255) ccGGAATCGAACGCGGCGACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTgg < 1:443444/240‑1 (MQ=255) cgACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTaa > 2:79765/1‑240 (MQ=255) gACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTaa < 1:125835/239‑1 (MQ=255) aGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGt < 2:125432/209‑1 (MQ=255) gcgTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGcc > 2:550513/1‑239 (MQ=255) gCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCg < 2:500939/239‑1 (MQ=255) gCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCg < 1:220992/239‑1 (MQ=255) ccccAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCTGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTg < 1:238362/240‑1 (MQ=255) ccccAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTg < 1:204146/240‑1 (MQ=255) ccccAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTg < 1:227998/240‑1 (MQ=255) cccAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGc < 2:219050/240‑1 (MQ=255) cAGCGATTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGtttt < 1:86239/204‑1 (MQ=255) aGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTgg < 1:505225/207‑1 (MQ=255) aGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCAc < 1:402368/239‑1 (MQ=255) cgcTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTg < 1:382405/240‑1 (MQ=255) gcTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGc < 2:456487/234‑1 (MQ=255) cTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTa > 1:215643/1‑240 (MQ=255) cGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACTAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGa < 1:362776/239‑1 (MQ=255) cGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGAc > 1:107074/1‑240 (MQ=255) cACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCt < 2:102987/239‑1 (MQ=255) aCTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCtt > 2:361904/1‑239 (MQ=255) ggcggcGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTcgcg < 2:183793/240‑1 (MQ=255) gTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTa > 2:423198/1‑239 (MQ=255) gTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTAc > 1:340277/1‑240 (MQ=255) ttCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAgg > 2:389583/1‑226 (MQ=255) ttCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGAATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACg > 2:37474/1‑230 (MQ=255) tCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTg < 2:428559/200‑1 (MQ=255) cGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTgg < 2:519753/170‑1 (MQ=255) cGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTgg > 1:519756/1‑170 (MQ=255) cGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGAcc > 1:467344/1‑211 (MQ=255) cGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCg > 2:87044/1‑231 (MQ=255) cGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTcc < 1:292564/239‑1 (MQ=255) gATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGAt < 1:73429/240‑1 (MQ=255) aTCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGAt < 2:200411/239‑1 (MQ=255) aTCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGAt < 2:168335/239‑1 (MQ=255) tCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATgg > 1:283516/1‑240 (MQ=255) cgcCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAg > 1:162284/1‑240 (MQ=255) ccGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCACCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAgg > 2:264965/1‑239 (MQ=255) gAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTcgcg < 2:226125/192‑1 (MQ=255) gcATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGTCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCg < 1:296543/240‑1 (MQ=255) gcATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTg < 2:67483/167‑1 (MQ=255) aTCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCg < 2:283404/238‑1 (MQ=255) cccccGACGACATGAAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGTTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGt < 1:34965/188‑1 (MQ=255) ccACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGAtgcgctg < 2:513601/239‑1 (MQ=255) cgacgaCATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGcc > 2:17077/1‑239 (MQ=255) acATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCt < 1:248418/240‑1 (MQ=255) 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tccttcctTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCTTCGTGCTGGCg > 1:563120/1‑240 (MQ=255) ccttccttGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCg < 2:249248/210‑1 (MQ=255) ttGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCTTCGTGCTGGCGTTCTTg < 2:343889/239‑1 (MQ=255) tGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGt < 1:240769/163‑1 (MQ=255) 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aGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGAt > 1:367535/1‑157 (MQ=255) aGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCTTCGTGCTGGCGTTCTTGTTCCTCGGCACGCGCGGcc > 1:213127/1‑239 (MQ=255) aGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCTTCGTGCTGGCGTTCTTGTTCCTCGGCACGCGCGGcc > 1:136467/1‑239 (MQ=255) aGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCTTCGTGCTGGCGTTCTTGTTCCTCGGCACGCGCGGcc > 2:106859/1‑239 (MQ=255) 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ttgcttgcCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCTTCGTGCTGGCGTTCTTGTTCCTCGGCACGCGCGGCCAGCTTGGCCGCCGCCTCGGCCTGCATCTTGGCCTTCTcggc < 1:436067/240‑1 (MQ=255) tgcttgcCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCTTCGTGCTGGCGTTCTTGTTCCTCGGCACGCGCGGCCAGCTTGGCCGCCGCCTCGGCCTGCATCTTGGCCTTCTcggcg < 1:187942/240‑1 (MQ=255) gcttgcCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGTGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCTTCGTGCTGGCGTTCTTGTTCCTCGGCACGCGCGGCCAGCTTGGCCGCCGCCTCGGCCTGCATCTTGGCCTTCTcggcg < 1:53709/239‑1 (MQ=255) 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GCAGGGCCTCGGCAACAGCCTGTAGGTTGCCGGAATCGAACGCGGCGACAGTCGCGTGCCCCAGCGCTTCGGCCACTGTGGCGGCGGTGGCATAGCCTTCGCCGATCACCAGCGCCGGCGCGGCCGCGAGCGCATCCATGCCACCGACGACATGGAAGCATCCTTCCTTGCGGCTGTCCTTGGCGAAGCGCTTGGTGCCGTCCTCCTGGATGTACTGCATGGTCCATTGCTTGCCGTCGGCGTCGTAGGCCGGGATGTAGGTTTTCTGGCCCTCCTGGTCGGTAAGGACGCCGGCGTGCACCTGTAGACCCTTGTCGCGCAGGTACGGCGTCGGTTCCGTGATGGGAACCAGGCTTTGCGCCTGGCGGCCGATGCGCTGCGCCGTGGCTTCGTGCTGGCGTTCTTGTTCCTCGGCACGCGCGGCCAGCTTGGCCGCCGCCTCGGCCTGCATCTTGGCCTTCTCGGCGGGGTCCA > BN000925/40890‑41363 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 23 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |