Predicted mutation | ||||||
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istA → istA → |
IS21 transposase IS21 transposase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | BN000925 | 36,655 | 0 | A | G | 99.7% | 1137.5 / NA | 287 | R116G (AGA→GGA) R108G (AGA→GGA) | istA istA | IS21 transposase IS21 transposase |
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Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.90e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 287 total aligned reads displayed.
CCTCAAATACCCTGAACCGCCAGCCAGAAAGACCCGCCACAAAATGGTTAAGCTGAAACCGTTTATGGATTACATCGACATGCGCCTGGCAGAGAATGTCTGGAATAGTGAGGTTATCTTTGCGGAGATTAAGGCAATGGGTTATACGGGCGGACGTTCCATGCTGCGTTACTACATCCAGCCCAAACGTAAAATGCGTCCGTCAAAAAGAACAGTTCGCTTCGAAACTCAGCCTAGATACCAGCTCCAGCACGACTGGGGCGAAGTTGAGGTGGAGGTTGCCGGGCAACGGTGCAAAGTTAACTTTGCGGTTAATACGCTGGGGTTCTCCCGCCGCTTCCATGTCTTCGCCGCACCAAAACAGGATGCTGAGCATACCTACGAATCACTGGTTCGCGCCTTCCGCTACTTCGGTGGTTGTGTGAAAACGGTGCTGGTTGATAACCAGAAGGCTGCGGTGCTGAAGAATAAC > BN000925/36420‑36891 | ccTCAAATACCCTGAACCGCCAGCCAGAAAGACCCGCCACAAAATGGTTAAGCTGAAACCGTTTATGGATTACATCGACATGCGCCTGGCAGAGAATGTCTGGAATAGTGAGGTTATCTTTGCGGAGATTAAGGCAATGGGTTATACGGGCGGACGTTCCATGCTGCGTTACTACATCCAGCCCAAACGTAAAATGCGTCCGTCAAAAAGAACAGTTCGCTTCGAAACTCAGCCTGGAt > 2:209797/1‑239 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |