Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,027,491 | G→T | G124V (GGC→GTC) | ghxQ → | guanine/hypoxanthine transporter GhxQ |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,027,491 | 0 | G | T | 99.0% | 372.5 / ‑6.4 | 95 | G124V (GGC→GTC) | ghxQ | guanine/hypoxanthine transporter GhxQ |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (41/53); minor base A (0/1); total (41/54) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
ATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTT > NC_000913/3027260‑3027722 | aTTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCt > 2:995878/1‑240 (MQ=255) aTTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCt > 1:1238980/1‑240 (MQ=255) tCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTc < 1:1038221/240‑1 (MQ=255) gTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCAcc > 1:700506/1‑240 (MQ=255) ttATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCa > 2:572633/1‑237 (MQ=255) ttATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCAcc > 2:944183/1‑239 (MQ=255) tcgtcgTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACTGCCa < 1:1138809/240‑1 (MQ=255) tcgtcgTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCa > 1:924979/1‑240 (MQ=255) tcgtcgTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCa < 2:498214/240‑1 (MQ=255) gtTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTcc > 1:220402/1‑240 (MQ=255) ttCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTcc > 2:1180700/1‑239 (MQ=255) tCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGt < 1:449565/240‑1 (MQ=255) ccGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTa < 2:859050/240‑1 (MQ=255) tGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGgt < 1:944189/239‑1 (MQ=255) cTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGgtgt > 2:23037/1‑239 (MQ=255) cTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGtgtg < 2:690436/240‑1 (MQ=255) aGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCt > 2:133693/1‑239 (MQ=255) gTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGCCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGGGCGTACCTGGATCt > 1:351804/1‑240 (MQ=255) cccGCAGCTGTGTTTGTTTCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAAt < 1:190768/240‑1 (MQ=255) gCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCAcc < 2:418789/192‑1 (MQ=255) gttgCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGtgtg < 1:487791/204‑1 (MQ=255) ccACCGGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCt < 2:183486/239‑1 (MQ=255) cACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCt > 2:1104697/1‑238 (MQ=255) cACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTc > 1:777315/1‑239 (MQ=255) cACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCa < 1:23042/240‑1 (MQ=255) aCCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCAc < 2:461548/240‑1 (MQ=255) tCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTa < 1:20690/239‑1 (MQ=255) tGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCt < 1:226395/230‑1 (MQ=255) tGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCt > 2:226389/1‑230 (MQ=255) tGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTa < 2:1263983/237‑1 (MQ=255) cgcgGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtat < 1:133698/240‑1 (MQ=255) cgGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcg > 1:1240385/1‑240 (MQ=255) ggtcTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTAGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCt < 1:1107839/220‑1 (MQ=255) cGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGtatcggtatcgg > 2:963997/1‑240 (MQ=255) gCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGtatcggtatcgg < 2:776671/238‑1 (MQ=255) tCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCt < 2:1159494/213‑1 (MQ=255) ttGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGttt < 2:207755/240‑1 (MQ=255) tGATGGGATTATGGTCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTctg < 1:1104715/239‑1 (MQ=255) tGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTctg < 2:691327/239‑1 (MQ=255) ggATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTctgctgctg > 2:630812/1‑240 (MQ=255) aTTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAggtatcggta > 2:223835/1‑218 (MQ=255) aTTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGa < 1:1249691/239‑1 (MQ=255) tATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGAtt > 2:1125594/1‑239 (MQ=255) tGGGCTAATTTTCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCTCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTa < 2:461831/190‑1 (MQ=255) tGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTc < 1:669841/143‑1 (MQ=255) tGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTc > 2:669835/1‑143 (MQ=255) cTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTgctgct < 2:904812/239‑1 (MQ=255) tAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGc > 1:93649/1‑176 (MQ=255) tAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTaa > 1:604326/1‑240 (MQ=255) tAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTaa > 1:84691/1‑240 (MQ=255) tttGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCt < 2:608662/187‑1 (MQ=255) ttGCCAATTGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgt < 2:515859/240‑1 (MQ=255) ttGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgt < 1:725861/240‑1 (MQ=255) ttGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGTCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGgt < 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ATTCCGTTATCGTCGTTCCGGGAATGCTGGGCAAAGCAGGTTTTCCTCCCGCAGCTGTGTTTGTTGCCACCTGTCTGGTCGCGGGCTTCGGCTCGTTGCTGATGGGATTATGGGCTAATTTGCCAATGGCGATTGGTTGCGCGATTTCCTTGACGGCGTTTACCGCATTCAGTCTGGTACTCGGGCAACAAATTAGCGTTCCTGTCGCACTGGGCGCGGTATTTCTGATGGGCGTCATCTTCACCGCCATTTCCGTAACCGGTGTGCGTACCTGGATCTTACGTAATTTGCCGATGGGTATCGCTCACGGTACAGGTATCGGTATCGGGCTGTTTCTGCTGCTGATTGCTGCTAACGGTGTGGGTATGGTTATCAAAAACCCGATTGAAGGCTTGCCAGTGGCGCTCGGTGCGTTTACCTCCTTCCCGGTGATGATGAGCTTGCTGGGGCTGGCGGTCATCTT > NC_000913/3027260‑3027722 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |