Predicted mutation | ||||||
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JC JC | NC_000913 | 1,567,085 | IS2 (+) +5 bp | coding (52‑56/1383 nt) | dosC ← | diguanylate cyclase DosC |
New junction evidence | |||||||||||
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* | ? | NC_000913 | 1567085 = | 0 (0.000) | 133 (1.500) | 71/426 | 0.1 | 100% | coding (56/1383 nt) | dosC | diguanylate cyclase DosC |
? | NC_000913 | = 1651548 | NA (NA) | noncoding (706/706 nt) | IS2 | repeat region |
CGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1469001‑1469240 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aCAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCTAATACAAATCCAGCATAC < NC_000913/1567089‑1566863 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2:851686/220‑1 ATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTAT < 1:350620/240‑1 TTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTAT > 1:239212/1‑240 AGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAG < 2:292266/239‑1 TCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGT < 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TAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTG < 2:492025/240‑1 TAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCA < 2:330186/177‑1 AGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGG > 1:893285/1‑240 TCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTATGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTGTATCGAAGTGTC > 2:871334/1‑160 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGATCAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGCGC > 2:280625/1‑215 AGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTG > 1:170395/1‑240 TTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTT < 2:198438/240‑1 CTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCC < 1:126014/239‑1 CACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCAAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCGGAAGAA > 2:683626/1‑160 ACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCC < 1:952381/234‑1 TATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCC < 2:103034/231‑1 ATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACG > 1:713476/1‑240 gtTATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGA < 2:80256/237‑1 GATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGA < 2:198240/239‑1 TATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGA < 2:63846/237‑1 ATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGG < 1:362006/240‑1 GGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCT < 2:96896/239‑1 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCTAATACA > 1:494609/1‑240 TCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCTAATAC < 1:359899/239‑1 GGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCTAATACAAAT < 1:964357/240‑1 GGAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCTAATACAAA > 2:410540/1‑239 GAGATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCTAATACAAA < 2:999021/238‑1 ATTCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCTAATACAAATCCAG > 1:66718/1‑240 TCAGGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCTAATACAAATCCAGCA < 1:30671/240‑1 GGGGGCCAGTCTACAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCTAATACAAATCCAGCATAC < 1:757646/240‑1 CGCCAGAGAAATAACTGGCTGGCTGCTACACCATGTTGCCGGGCAACGAGGGAGACCGTCATCCCCGGTTCAAAGCTCTGCTGAACAATTGCGATCTTTTCCTGTGTGGTACGCCGTCTGCGTTTCTCCGGCCCTAAGACATCAATCATCTGTTCTCCAATGACTAGTCTAAAAACTAGTATTAAGACTATCACTTATTTAAGTGATATTGGTTGTCTGGAGATTCAGGGGGCCAGTCTA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > NC_000913/1469001‑1469240 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aCAGGCAGATCCGCCCATTCGTGCTAAAGCCGCGGAAATTGCCGTTGCGCATGCTCATTATCTGAGTATCGAGTTTTATCGAATTGTCCGCATCGACCCGCATGCCGAAGAATTCTTGAGTAATGAACAAGTTGAGCGGCAGTTGAAGAGTGCGATGGAACGCTGGATTATTAACGTGCTTTCTGCCCAGGTTGACGATGTCGAAAGGCTAATACAAATCCAGCATAC < NC_000913/1567089‑1566863 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |