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Only 100 of 162 total aligned reads displayed.
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1:77519‑M1/1‑101 (MQ=255) acaTAAGGAAGAGGGGTATTCCCTGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGtctggtggtaatggtggtcggcgtggggtattcaatcctcaaccagttaccacagtttaatatgccccagtatttcgcacatggtgcagtgctaagtattttcgtcggtgccattctctggctggcgggtgcccgtgttgg < 1:47204‑M1/240‑142 (MQ=255) acaTAAGGAAGAGGGGTATTCCCTGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGtctggtggtaatggtggtcggcgtggggtattcaatcctcaaccagttaccacagtttaatatgccccagtatttcgcacatggtgcagtgctaagtattttcgtcggtgccattctctggctggcgggtgc < 2:120898‑M1/231‑133 (MQ=255) aaGGAAGAGGGGTATTCCCTGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGtctggtggtaatggtggtcggcgtggggtattcaatcctcaaccagttaccacagtttaatatgccccagtatttcgcacatggtgcagtgctaagtattttcgtcggtgccattctctggctggcgggtgcccgtgttggcggg > 1:629767‑M1/1‑95 (MQ=255) 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(MQ=255) aGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGtctggtggtaatggtggtcggcgtggggtattcaatcctcaaccagttaccacagtttaatatgccccagtatttcgcacatggtgcagtgctaagtattttcgtcggtgccattctctggctggcgggtgcccgtgttggcgggcatgaacaggtgtgcgac < 2:881141‑M1/224‑164 (MQ=255) ttCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGTtctggtggtaatggtggtcggcgtggggtattcaatcctcaaccagttaccacagtttaatatgccccagtatttcgcacatggtg < 1:115391‑M1/145‑87 (MQ=255) ccGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGtctggtggtaatggtggtcggcgtggggtattcaatcctcaaccagttaccacagtttaatatgccccagtatttcgcacatggtgcagtgctaagtattttcgtcggtgccattctctggctggcgggtgcccgtgttggcgggcatgaacaggtgtgcgaccgttactggtgggttcgcc > 1:809318‑M1/1‑57 (MQ=255) cGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATTGGtct < 2:345896‑M1/59‑4 (MQ=255) 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GCAGATAACGTAATAATTGCCTGAGTGGACTATTAGAAAGTCAAGGTGTTCAGGCGTTTATTTGTAAAGTTTTGTTGAAATAAGGGTTGTAATTGTGATCACGCCCGCACATAACCCACTGGGTGTTGTCTATACTTTACACATAAGGAAGAGGGGTATTCCCTGTTACAACCCAGAAAGTTCCGGAGGTGACATATGAAACGCAAAAACGCTTCGTTACTCGGTAACGTGCTCATGGGGTTGGGTCTGGTGGTAATGGTGGTCGGCGTGGGGTATTCAATCCTCAACCAGTTACCACAGTTTAATATGCCCCAGTATTTCGCACATGGTGCAGTGCTAAGTATTTTCGTCGGTGCCATTCTCTGGCTGGCGGGTGCCCGTGTTGGCGGGCATGAACAGGTGTGCGACCGTTACTGGTGGGTTCGCCACTATGACAAACGTTGCCGCCGTAGCGATAATCGCCGTCATAGCTAA > NC_000913/1258596‑1259069 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |