| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,962,624 | Δ15,879 bp | IS1‑mediated | [flhE]–flhD | 15 genes [flhE], flhA, flhB, cheZ, cheY, cheB, cheR, tap, tar, cheW, cheA, motB, motA, flhC, flhD |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| New junction evidence | |||||||||||
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Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
TACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGTAACTCTGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGGTGGAATTAACCGCCCACCGCCTGGCACTTCCCAGATAAATCGCAACGGTTCTGCTGCCGCTATACCGGAAAAGGCCACGGTGGTTCCGCTCTGCCCCTCTAATTCGACACAACGAGATTGCGAACACAAGCGAACCCGCAGTCCTGAAGGTGTCGGGCCGATAAGCTGATAACGCCACGCTACCAGCGTCATCAATCCTGAAGCAGGTTGTCGCGTAGAAAGAGGCGCAGACGA > NC_000913/1962388‑1962858 | tACGCGAACTCGCCAGTTGCAGCTATACCGTAAGTCAGAAGATTTTTATCCAAGCCCTTTGACAAGAGGATAATTCACATCTTTTTGGCATGTTTTGTTGCAAGCTATTCCTGATAAATAATTGCAACAAGACATCGAGCCTTTTTCACTGAGTTATTAAACATACTCGCGAGCGCGTAATTTTTTTGTCCTTCAGCGATAATTCACAATCACTTCATTACGTTGTACCTTTAGCGggta > 1:422802‑M1/1‑236 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |