| Predicted mutation | ||||||
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| RA | BN000925 | 56,817 | Δ1 bp | coding (297/522 nt) | korF ← | KorF repressor protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
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| * | BN000925 | 56,817 | 0 | G | . | 100.0% | 1395.1 / NA | 291 | coding (297/522 nt) | korF | KorF repressor protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (167/124); total (167/124) | |||||||||||
Only 100 of 291 total aligned reads displayed.
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cccTCACCAGTTGTTCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATc > 2:618258/1‑240 (MQ=255) gttgttCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCAt < 1:569616/239‑1 (MQ=255) gttgttCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCAt < 1:855786/239‑1 (MQ=255) 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gccgccGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGGGGCAGTGCGCCGCGCCGGCGGCGTCGTGGATGGCTCGGGTTGGCTGGCCTGCGACGGCCGGCGAAAGGTGCGCAGCAGCTCGTTATCGACCGGCTGCGGCGTCGGGGCCGCCGCCTTGCGCTGCGGTCGGTGTTc < 1:237157/240‑1 (MQ=255) ccgccgGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGGGGCAGTGCGCCGCGCCGgcggcg < 2:586881/127‑1 (MQ=255) ccgccgGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGGGGCAGTGCGCCGCGCCGgcggcg > 1:586884/1‑127 (MQ=255) gccgGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGGGGCAGTGCGCCGCGCCGgcggcg < 2:20861/125‑1 (MQ=255) cgGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCC‑CCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGGGGCAGTGCGCCGCGCCGGCGGCGTCGTGGATGGCTCGGGTTGGCTGGCCTGCGACGGCCGGCGAAAGGTGCGCAGCAGCTCGTTATCGACCGGCTGCGGCGTCGGGGCCGCCGCCTTGCGCTGCGGTCGGTGTTCcttct < 1:770774/240‑1 (MQ=255) 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TTGTTCGTCAGTCATGGTCCGCCCTCACCAGTTGTTCGTATCGGTGTCGGACGAACTGAAATCGCAAGAGCTGCCGGTATCGGTCCAGCCGCTGTCCGTGTCGCTGCTGCCGAAGCACGGCGAGGGGTCCGCGAACGCCGCAGACGGCGTATCCGGCCGCAGCGCATCGCCCAGCATGGCCCCGGTCAGCGAGCCGCCGGCCAGGTAGCCCAGCATGGTGCTGTTGGTCGCCGCCGGCCACCAGGGCCGACGTGACGAAATCGCCGTCATTCCCTCTGGATTGTTCGCTGCTCGGCGGGGCAGTGCGCCGCGCCGGCGGCGTCGTGGATGGCTCGGGTTGGCTGGCCTGCGACGGCCGGCGAAAGGTGCGCAGCAGCTCGTTATCGACCGGCTGCGGCGTCGGGGCCGCCGCCTTGCGCTGCGGTCGGTGTTCCTTCTTCGGCTCGCGCAGCTTGAACAGCATGATC > BN000925/56585‑57051 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 20 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |