Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 3,101,039 | (C)7→8 | coding (585/720 nt) | yggN ← | putative EcfF |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 3,101,032 | 1 | . | C | 100.0% | 128.5 / NA | 36 | L198V (CTG→GTG) | yggN | putative EcfF |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (14/22); total (14/22) |
ACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑CCCCCCCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACTAATTGCTGGCCTTCGGCGCGAACCTGATCAATGGCTTTATAGTGAAACGTCAGGCCATCGCTGCGCGTTTCAATAATGCGGTTCATCTGCTCTTTCAGCTGCGCATCAAGTTTG > NC_000913/3100803‑3101261 | aCAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑cccccccca < 2:566174/239‑3 (MQ=255) aaCGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑ccccccccagg < 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ACAACGTGAATATATTTTGGAGATCTACAAAGTTAGAGGCAGGTAACAAAACGAAGAATTAAACGGCATAAAAAAGTATTATGCCGTCTTAAAATAGAGGATTATTTTAAATTCCCGACCAGGGCTTTGCGGCTATCTTCCAGAGTCACAACGCGGCTACAAACATCTTTGCCAAACTGCTGGAAATCTTTTTCCTGCTTTTTCCACTCGGTTTGGATTGAGGATTGCAG‑CCCCCCCAGGCTTCCCAGCACATTCTGTAATGGGTTACCGCCGCTTTTCAGCACCGCTTTCGCGCCCATTTCATTAATGCTGTCCTGTAAAATTCCACCCATTGCCTGATTCACTAATTGCTGGCCTTCGGCGCGAACCTGATCAATGGCTTTATAGTGAAACGTCAGGCCATCGCTGCGCGTTTCAATAATGCGGTTCATCTGCTCTTTCAGCTGCGCATCAAGTTTG > NC_000913/3100803‑3101261 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |