| New junction evidence | |||||||||||
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| ? | NC_000913 | = 2643110 | 89 (1.520) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | transmembrane component of cytoskeleton/23S rRNA m(2)A2503 methyltransferase/tRNA m(2)A37 methyltransferase | |||||
| Rejected: Coverage evenness skew score above cutoff. | |||||||||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
AGAATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGGGTACGTTTCGTACGGTCGATAACATCGCCCGCCAACTGACCACAGGCAGCATCGATATCATCACCACGAGTTTTACGCACAATAGTGGTGAAACCGTAGCTCATCAGCACTTTTGAGAAACGGTCGATACGGCTGTTCGAGCTGCGTCCATACGGCG > NC_000913/2642867‑2643334 | agaATTGAGATGCCGGTGAACCATCATGCTCACCCACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATaa > 2:253876/1‑240 (MQ=255) 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ccACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 2:567429/1‑240 (MQ=255) ccACACCGCGAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCCTAATGTCTATCAGACTGc > 1:379209/1‑238 (MQ=255) cgAAACATCCGTTAAGTTAACCGTTATCATACAGTATAAGACCGTCTGTGTGCTCGTGACAAAGCCCACATTCACTAAGGCTAACTTACTGTTGCATCGTTACATACTGCCTTAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATgg > 1:304962/1‑218 (MQ=255) 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NC_000913/2642867‑2643334 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |