Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 169,409 | G→A | V642V (GTG→GTA) | fhuA → | ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 169,409 | 0 | G | A | 100.0% | 256.5 / NA | 66 | V642V (GTG→GTA) | fhuA | ferrichrome outer membrane transporter/phage receptor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (30/36); total (30/36) |
CGTCCGATTGTAGTTACTGGTGCCGTGTATAATCTCACTAAAACCAACAACCTGATGGCGGACCCTGAGGGTTCCTTCTTCTCGGTTGAAGGTGGCGAGATCCGCGCACGTGGCGTAGAAATCGAAGCGAAAGCGGCGCTGTCGGCGAGTGTTAACGTAGTCGGTTCTTATACTTACACCGATGCGGAATACACCACCGATACTACCTATAAAGGCAATACGCCTGCACAGGTGCCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGAT > NC_000913/169176‑169637 | cGTCCGATTGTAGTTACTGGTGCCGTGTATAATCTCACTAAAACCAACAACCTGATGGCGGACCCTGAGGGTTCCTTCTTCTCGGTTGAAGGTGGCGAGATCCGCGCACGTGGCGTAGAAATCGAAGCGAAAGCGGCGCTGTCGGCGAGTGTTAACGTAGTCGGTTCTTATACTTACACCGATGCGGAATACACCACCGATACTACCTATAAAGGCAATACGCCTGCACAGGTACCaaaa > 2:493500/1‑240 (MQ=255) tCCGATTGTAGTTACTGGTGCCGTGTATAATCTCACTAAAACCAACAACCTGATGGCGGACCCTGAGGGTTCCTTCTTCTCGGTTGAAGGTGGCGAGATCCGCGCACGTGGCGTAGAAATCGAAGCGAAAGCGGCGCTGTCGGCGAGTGTTAACGTAGTCGGTTCTTATACTTACACCGATGCGGAATACACCACCGATACTACCTATAAAGGCAATACGCCTGCACAGGTACAAAAac > 1:676700/1‑239 (MQ=255) ccGATTGTAGTTACTGGTGCCGTGTATAATCTCACTAAAACCAACAACCTGATGGCGGACCCTGAGGGTTCCTTCTTCTCGGTTGAAGGTGGCGAGATCCGCGCACGTGGCGTAGAAATCGAAGCGAAAGCGGCGCTGTCGGCGAGTGTTAACGTAGTCGGTTCTTATACTTACACCGATGCGGAATACACCACCGATACTACCTATAAAGGCAATACGCCTGCACAGGTACCAAAaca < 2:624524/239‑1 (MQ=255) tGTAGTTACTGGTGCCGTGTATAATCTCACTAAAACCAACAACCTGATGGCGGACCCTGAGGGTTCCTTCTTCTCGGTTGAAGGTGGCGAGATCCGCGCACGTGGCGTAGAAATCGAAGCGAAAGCGGCGCTGTCGGCGAGTGTTAACGTAGTCGGTTCTTATACTTACACCGATGCGGAATACACCACCGATACTACCTATAAAGGCAATACGCCTGCACAGGTACCAAAACACATGGc > 1:616982/1‑240 (MQ=255) tACTGGTGCCGTGTATAATCTCACTAAAACCAACAACCTGATGGCGGACCCTGAGGGTTCCTTCTTCTCGGTTGAAGGTGGCGAGATCCGCGCACGTGGCGTAGAAATCGAAGCGAAAGCGGCGCTGTCGGCGAGTGTTAACGTAGTCGGTTCTTATACTTACACCGATGCGGAATACACCACCGATACTACCTATAAAGGCAATACGCCTGCACAGGTACCAAAACACATGGCt < 2:519285/235‑1 (MQ=255) 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acCTATAAAGGCAATACGCCTGCACAGGTACCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCa < 1:535283/239‑1 (MQ=255) acCTATAAAGGCAATACGCCTGCACAGGTACCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCa > 2:265508/1‑239 (MQ=255) cAATACGCCTGCACAGGTACCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCt > 2:484626/1‑133 (MQ=255) cAATACGCCTGCACAGGTACCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCt < 1:484635/133‑1 (MQ=255) cAATACGCCTGCACAGGTACCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAAcc > 1:329730/1‑239 (MQ=255) cAATACGCCTGCACAGGTACCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAAcc > 1:192796/1‑239 (MQ=255) aCGCCTGCACAGGTACCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTc > 1:165366/1‑240 (MQ=255) ccTGCACCGGTACCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCa < 2:179673/221‑1 (MQ=255) cTGCACAGGTACCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGAt > 2:555299/1‑239 (MQ=255) caGGTACCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCa < 2:148385/215‑1 (MQ=255) | CGTCCGATTGTAGTTACTGGTGCCGTGTATAATCTCACTAAAACCAACAACCTGATGGCGGACCCTGAGGGTTCCTTCTTCTCGGTTGAAGGTGGCGAGATCCGCGCACGTGGCGTAGAAATCGAAGCGAAAGCGGCGCTGTCGGCGAGTGTTAACGTAGTCGGTTCTTATACTTACACCGATGCGGAATACACCACCGATACTACCTATAAAGGCAATACGCCTGCACAGGTGCCAAAACACATGGCTTCGTTGTGGGCTGACTACACCTTCTTTGACGGTCCGCTTTCAGGTCTGACGCTGGGCACCGGTGGTCGTTATACTGGCTCCAGTTATGGTGATCCGGCTAACTCCTTTAAAGTGGGAAGTTATACGGTCGTGGATGCGTTAGTACGTTATGATCTGGCGCGAGTCGGCATGGCTGGCTCCAACGTGGCGCTGCATGTTAACAACCTGTTCGAT > NC_000913/169176‑169637 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |