Predicted mutation | ||||||
---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_000913 | 2,656,737 | A→G | intergenic (‑1/+11) | iscX ← / ← fdx | accessory iron‑sulfur cluster assembly protein IscX/reduced ferredoxin |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_000913 | 2,656,737 | 0 | A | G | 98.0% | 165.7 / ‑3.8 | 50 | intergenic (‑1/+11) | iscX/fdx | accessory iron‑sulfur cluster assembly protein IscX/reduced ferredoxin |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base G (23/26); total (24/26) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.80e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.25e-01 |
CCAACGCATCTGCGGCGTGAAGCATGACGCGGAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCA > NC_000913/2656501‑2656970 | ccAACGCATCTGCGGCGTGAAGCATGACGCGGAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTa > 1:588783/1‑240 (MQ=255) gCATCTGCGGCGTGAAGCATGACGCGGAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACct < 1:341621/239‑1 (MQ=255) tGCGGCGTGAAGCATGACGCGGAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGtt > 1:260979/1‑239 (MQ=255) cATGACGCGGAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACgcgc < 1:188934/240‑1 (MQ=255) cATGACGCGGAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACgcgc < 1:496034/240‑1 (MQ=255) aTGACGCGGAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACgcgc < 1:582765/239‑1 (MQ=255) aTGACGCGGAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACgcgc < 1:192930/239‑1 (MQ=255) gACGCGGAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATg < 2:645315/240‑1 (MQ=255) ggAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGa < 1:92713/240‑1 (MQ=255) ggCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAAcgc < 2:210947/240‑1 (MQ=255) ggCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAAcgc < 1:550412/240‑1 (MQ=255) aaCAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTaaa < 1:557039/239‑1 (MQ=255) aaTCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACgcgc < 1:660965/197‑1 (MQ=255) gCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCCGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACCACTAAATCTTCGTCgg > 1:414713/1‑240 (MQ=255) ggATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACgcgc < 1:361347/173‑1 (MQ=255) cTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACgg > 2:196531/1‑240 (MQ=255) gtcgtcgtcGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTcc < 1:370663/240‑1 (MQ=255) gtcgtcgAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCgg > 1:602607/1‑239 (MQ=255) tcgtcgAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGc > 1:686035/1‑239 (MQ=255) tcgAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCa < 2:528699/240‑1 (MQ=255) cAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTACCGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTcccccg > 2:70060/1‑228 (MQ=255) atCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGc > 1:461214/1‑240 (MQ=255) gTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAg > 2:284340/1‑220 (MQ=255) aaTCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCtt > 1:353789/1‑228 (MQ=255) aCCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTcc > 1:169601/1‑239 (MQ=255) ttCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCt > 2:126834/1‑166 (MQ=255) aaGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGc > 2:61563/1‑188 (MQ=255) tCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTc < 2:173006/190‑1 (MQ=255) aCGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCacgaa < 1:157861/239‑1 (MQ=255) cGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGCGCTTTCCGGCAGTTAGTCAAAACCTTCacgtac > 2:394501/1‑239 (MQ=255) gCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCacgaacg < 1:590979/239‑1 (MQ=255) gTACAGTGCTTCGCCAATTTTGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAg > 1:149310/1‑240 (MQ=255) gTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGc > 2:422915/1‑210 (MQ=255) cAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTgg < 2:425545/240‑1 (MQ=255) cTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAggt > 1:721461/1‑240 (MQ=255) ttCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAggtg > 1:378188/1‑240 (MQ=255) cGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATGGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAggtgg > 2:252393/1‑239 (MQ=255) cGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAggtgg > 1:470396/1‑239 (MQ=255) cGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAggtgg > 1:691301/1‑239 (MQ=255) aTTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAg > 1:317125/1‑240 (MQ=255) tttCGCGGCTATCGGTCCACGTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAg < 2:235037/184‑1 (MQ=255) gcgGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACgcgc < 2:604099/53‑1 (MQ=255) gCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTGGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCt < 2:517837/147‑1 (MQ=255) aTCGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAggt < 2:363543/221‑1 (MQ=255) cGGTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATgtcg < 2:562608/157‑1 (MQ=255) ggTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTca < 1:337778/240‑1 (MQ=255) ggTCCACTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTca < 2:569354/240‑1 (MQ=255) aCTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGca < 1:530046/223‑1 (MQ=255) aCTTAAGTCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGAttttt > 2:20992/1‑233 (MQ=255) tCCCATGCTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCa > 2:12692/1‑240 (MQ=255) | CCAACGCATCTGCGGCGTGAAGCATGACGCGGAAATTATTCGGCCTCGTCCAGCCAGACTAACAAAATCGCTTCGAGGATTTTCTCGTTGGATGCCTGCGGGTCGTCGTCGAAATCTTCCAGATCGCAAATCCACTGATGCATATCGGTGAATCGAACCGTTTTCGGATCAAGATCGGGATACGCATCGTACAGTGCTTCGCCAATTTCGCGGCTATCGGTCCACTTAAGTCCCATACTAACCTCTGTTAATGCTCACGCGCATGGTTGATAGTGTAACGCGGGATTTCGACTACTAAATCTTCGTCGGTAACGCGCGCCTGGCAGCTTAAACGGCTTTCCGGCTCCAGTCCCCAGGCTTTGTCCAGCATGTCGTCTTCCTGCTCTGAGCTTTCCGGCAGTGAGTCAAAACCTTCACGAACGATGCAGTGGCAGGTGGTGCAAGCACAGGATTTTTCACAGGCGTGTTCA > NC_000913/2656501‑2656970 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 38 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |