Predicted mutation | ||||||
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RA | NC_000913 | 368,328 | A→G | G31G (GGT→GGC) | mhpR ← | DNA‑binding transcriptional activator MhpR |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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* | NC_000913 | 368,328 | 0 | A | G | 100.0% | 643.6 / NA | 167 | G31G (GGT→GGC) | mhpR | DNA‑binding transcriptional activator MhpR |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (55/112); total (55/112) |
Only 100 of 168 total aligned reads displayed.
ATCTGTCGGCCATACCACTTCGCGCAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCACCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCACGGTTTTGTATTCCGTCTGCTCATTGTTCTGCATATTAATTGACATTTCTATAGTTAAAACAACGTGGTGCACCTGGTGCACATTCGGGCATGTTTTGATTGTAGCCGAAAACACCCTTCCTATACTGAGCGCACAATAAAAAATCATTTACATGTTTTTAACAAAATAAGTTGCG > NC_000913/368094‑368562 | aTCTGTCGGCCATACCACTTCGCGCAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCCGCCCGACGCTGGCgccgcc > 2:1484153/1‑240 (MQ=255) tCGGCCATACCACTTCGCGCAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCa > 2:817808/1‑239 (MQ=255) gCCATACCACTTCGCGCAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGtt > 1:1593243/1‑240 (MQ=255) cATACCACTTCGCGCAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGttt > 2:791700/1‑239 (MQ=255) cTTCGCGCAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTAAc < 1:1472251/239‑1 (MQ=255) cTTCGCGCAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTAACa < 1:708850/240‑1 (MQ=255) cTTCGCGCAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTAACa < 2:1475838/240‑1 (MQ=255) tCGCGCAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTAACata > 1:1090057/1‑240 (MQ=255) cgcAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTAACATAttt > 1:1243493/1‑240 (MQ=255) cgcAACAGATCGCCCAGCAGTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTAACATAttt > 1:646252/1‑240 (MQ=255) 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cagcagTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGAcc < 1:591856/240‑1 (MQ=255) cagTGGGGCCGCCAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGtttatt < 2:212732/213‑1 (MQ=255) gccAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTaa > 1:1426501/1‑206 (MQ=255) gccAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTaa < 2:1426499/206‑1 (MQ=255) gccAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAg < 1:1683104/237‑1 (MQ=255) gccAGTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGcc > 2:1323962/1‑239 (MQ=255) gTGCAGAAATCCACTGTTCGTCACGAAATCCTTCGCTTAATTGCCGCACTTTGATGGTCAGTCGAAAACTATCATCGGAGGGGCTACGGCGGACATATCCCTCTTCCTGCAGCGTCTCCAGCAGTCGCCGCACAGTGGTGCGATGCAGGCCGCTGAGTTCCGCCAGCAGCCCGACGCTGGCGCCGCCATCAAGTTTATTTAACATATTTAATAACATTAGACCGCGGGTTAAGCCGCGCa < 1:848330/240‑1 (MQ=255) 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |