| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,366,751 | Δ295 bp | IS5‑mediated | yhcE–[yhcF] | yhcE, [yhcF] |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3365727–3366750 | 3367045 | 296–1319 | 14 [12] | [0] 61 | [insH‑10]–[yhcF] | [insH‑10],yhcE,[yhcF] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3366750 | NA (NA) | 60 (1.130) | 49/430 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3367046 = | 0 (0.000) | coding (121/717 nt) | yhcF | DUF1120 domain‑containing protein YhcF | |||||
GTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTCCAGCTTTTAAGGATGAAGGGGAACTAACCGACATGACAGATATTACAGGCAATCTGACGGTCCTGGTGGAGGCAAAATGAACAATGTAAAATTACTGATTGCCGGAAGTGCCTTTTTTGCCATGTCAGCGCAAGCCGCTGATAGAGTATCAATTGACGTTAAGGTGACTCTGGAAGCTGCAGCTTGTACTCCAATACTAAGCAACGGCGGAGTTGTTAACTTCGGTAGTCATTCAGTCAATAGACTTTCAACGCAGCACTACACACAGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATATACCTTAAATGGCGGAGGTTATAT > NC_000913/3366817‑3367272 | ggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAAGCAAcgg < 1:470390‑M2/11‑1 (MQ=255) cgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAAGCAAcggcg < 2:159280‑M2/13‑1 (MQ=255) gccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAAGCAAcgg < 2:571757‑M2/11‑1 (MQ=255) cggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccccgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAAGCAACGGCGGAgt > 1:456882‑M2/224‑240 (MQ=255) cagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAAGCAACGGCGGAGTTGTTAACTTc < 2:364816‑M2/27‑1 (MQ=255) 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ggacttgttcgcaccttccCTAAGCAACGGCGGAGTTGTTAACTTCGGTAGTCATTCAGTCAATAGACTTTCAACGCAGCACTACACACAGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATATACCTTAAATGGCGGAgg > 1:55363‑M2/20‑240 (MQ=255) tgttcgcaccttccCTAAGCAACGGCGGAGTTGTTAACTTCGGTAGTCATTCAGTCAATAGACTTTCAACGCAGCACTACACACAGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATATACCTTAAATgg > 2:189088‑M2/15‑229 (MQ=255) gttcgcaccttccCTAAGCAACGGCGGAGTTGTTAACTTCGGTAGTCATTCAGTCAATAGACTTTCAACGCAGCACTACACACAGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATATACCTTAAATGGCGGAGGTTatat > 1:240815‑M2/14‑240 (MQ=255) cTAAGCAACGGCGGAGTTGTTAACTTCGGTAGTCATTCAGTCAATAGACTTTCAACGCAGCACTACACACAGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATATACCTTAAATGGCGGAgg < 1:408749/221‑1 (MQ=255) | GTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTCCAGCTTTTAAGGATGAAGGGGAACTAACCGACATGACAGATATTACAGGCAATCTGACGGTCCTGGTGGAGGCAAAATGAACAATGTAAAATTACTGATTGCCGGAAGTGCCTTTTTTGCCATGTCAGCGCAAGCCGCTGATAGAGTATCAATTGACGTTAAGGTGACTCTGGAAGCTGCAGCTTGTACTCCAATACTAAGCAACGGCGGAGTTGTTAACTTCGGTAGTCATTCAGTCAATAGACTTTCAACGCAGCACTACACACAGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATATACCTTAAATGGCGGAGGTTATAT > NC_000913/3366817‑3367272 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |