| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC JC | NC_000913 | 737,834 | IS1 (+) +9 bp | pseudogene (935‑943/1062 nt) | ybfL → | putative transposase YbfL |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | 257908 = | NA (NA) | 117 (0.960) | 65/428 | 0.6 | 99.1% | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 737834 = | 1 (0.010) | pseudogene (935/1062 nt) | ybfL | putative transposase YbfL | |||||
| * | ? | NC_000913 | = 258675 | NA (NA) | 114 (0.940) | 73/430 | 0.4 | 99.1% | noncoding (1/768 nt) | IS1 | repeat region |
| ? | NC_000913 | = 737842 | 1 (0.010) | pseudogene (943/1062 nt) | ybfL | putative transposase YbfL | |||||
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
GCGTGGCAGTCTCCTTTCGGTCAATAATAGCAGAACAAAAGAAAGAGCCAGAAATGACGGTCAGATATTATATCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCAGGGTTAAGACGTAAGATGCGAAAAGCAGCCATGGATAGAAACTATCTCGCGTCAGTCCTTGCGGGGAGCGGGCTTTCGTAATCTTTCCCTGCTTTTTGTACTAAATAATTCGCATTTTATGTTTAAAAATTGAGATATTCCTTATTACCTGAAGCTGTTTTTTATTGCTTATACATGATCAAATACTTCTTACATAATT > NC_000913/737606‑738079 | cGTGGCAGTCTCCTTTCGGTCAATAATAGCAGAACAAAAGAAAGAGCCAGAAATGACGGTCAGATATTATATCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGggtg > 1:45863‑M2/1‑236 (MQ=255) cAGTCTCCTTTCGGTCAATAATAGCAGAACAAAAGAAAGAGCCAGAAATGACGGTCAGATATTATATCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGggtgatgc > 2:284794‑M2/1‑231 (MQ=255) cggatggctggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAatat > 1:1035118‑M2/222‑240 (MQ=255) aGTCTCCTTTCGGTCAATAATAGCAGAACAAAAGAAAGAGCCAGAAATGACGGTCAGATATTATATCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGggtgatgctg > 2:1165759‑M2/1‑230 (MQ=255) ttCGGTCAATAATAGCAGAACAAAAGAAAGAGCCAGAAATGACGGTCAGATATTATATCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGggtgatgctgccaactta > 2:859747‑M2/1‑222 (MQ=255) tggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACg < 1:15237‑M2/26‑1 (MQ=255) ggccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGaa < 2:414939‑M2/28‑1 (MQ=255) ccgctgtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATg < 2:1011247‑M2/30‑1 (MQ=255) aaataataGCAGAACAAAAGAAAGAGCCAGAAATGACGGTCAGATATTATATCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGggtgatgctgccaacttactgatt > 2:1223883‑M2/2‑216 (MQ=255) gtatgaatcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATa < 1:636210‑M2/33‑1 (MQ=255) ataataGCAGAACAAAAGAAAGAGCCAGAAATGACGGTCAGATATTATATCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGggtgatgctgccaacttactgattta > 2:709200‑M2/1‑214 (MQ=255) atcccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTc > 1:843354‑M2/200‑240 (MQ=255) ccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAg < 2:198611‑M2/35‑1 (MQ=255) ccgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAg > 1:228450‑M2/197‑240 (MQ=255) cgcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAgg < 2:1055326‑M2/45‑1 (MQ=255) gcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAgg > 2:252522‑M2/195‑239 (MQ=255) gcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAgg > 1:10317‑M2/195‑239 (MQ=255) gcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAgg < 2:1083280‑M2/45‑1 (MQ=255) gcctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAg > 1:1010840‑M2/195‑238 (MQ=255) aCAAAAGAAAGAGCCAGAAATGACGGTCAGATATTATATCAGTTCTGCTGATTTAACCGCAGAAAAGTTCGCCACAGCAATCCGAAACCACTGGCACGTGGAGAATAAGCTGCACTGGCGTCTGGACGTGGTAATGAATGAAGACGACTGCAAAATAAGAAGAGGAAACGCCGCAGAATTATTTTCAGGGATACGGCACATCGggtgatgctgccaacttactgatttagtgtatgatgg < 2:772874‑M2/240‑38 (MQ=255) cctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGc < 2:409851‑M2/46‑1 (MQ=255) cctgaagggaaagctgcacgtaatcagcaagcgatatacgcagcgaattgagcggcataacctgaatctgaggcagcacctggcacggctgggacggaagtcgctgtcgttctcaaaatcggtggagctgcatgacaaagtcatcgggcattatctgaacataaaacactatcaataagttggagtcattaccGGCACATCGCTATTAATATTTTAACGAATGATAAGGTATTCAAGGCa < 2:469847‑M2/47‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |