| Predicted mutation | ||||||
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| MC JC | NC_000913 | 1,961,866 | Δ16,637 bp | IS1‑mediated | yecT–flhD | 16 genes yecT, flhE, flhA, flhB, cheZ, cheY, cheB, cheR, tap, tar, cheW, cheA, motB, motA, flhC, flhD |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| * | * | ÷ | NC_000913 | 1961866 | 1979089–1978503 | 16638–17224 | 69 [0] | [8] 13 | yecT–[insA‑5] | yecT,flhE,flhA,flhB,cheZ,cheY,cheB,cheR,tap,tar,cheW,cheA,motB,motA,flhC,flhD,insB‑5,[insA‑5] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1961865 | 0 (0.000) | 68 (1.470) | 48/426 | 0.1 | 100% | intergenic (+70/‑107) | argS/yecT | arginine‑‑tRNA ligase/protein YecT |
| ? | NC_000913 | 1978503 = | NA (NA) | noncoding (768/768 nt) | IS1 | repeat region | |||||
ACCTGTACGATCTGGCCGGTCTGTTCTCTGGCTTCTACGAGCACTGCCCGATCCTCAGCGCAGAAAACGAAGAAGTGCGTAACAGCCGTCTAAAACTGGCACAACTGACGGCGAAGACGCTGAAGCTGGGTCTGGATACGCTGGGTATTGAGACTGTAGAGCGTATGTAATCGATTTTTCGTGAGAGTGAAGCCTGATCAGGGTTAGCCGATCAGGCTTTTTTATTGCCATCTAAATGTATTCTGAAAATGGACATGCCATTGTTTTCTCACTGTTGGATAAGAGGCCAGAAGCGTAATATCCGGCCCCAGGGAAACGATAACGGTTGAATTTAAGGAATACCGCAGTGTTTAAATTTCTTGTATTAACATTAGGCATTATCTCTTGCCAGGCTTACGCAGAAGATACGGTTATAGTAAACGACCATGACATTTCAGCCATCAAAGATTGTTGGCAAAAAAATTCAGATGATGAT > NC_000913/1961626‑1962100 | aCCTGTACGATCTGGCCGGTCTGTTCTCTGGCTTCTACGAGCACTGCCCGATCCTCAGCGCAGAAAACGAAGAAGTGCGTAACAGCCGTCTAAAACTGGCACAACTGACGGCGAAGACGCTGAAGCTGGGTCTGGATACGCTGGGTATTGAGACTGTAGAGCGTATGTAATCGATTTTTCGTGAGAGTGAAGCCTGATCAGGGTTAGCCGATCAGGCTTTTTTATTGCCATCTAAATGTa > 1:93013/1‑240 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 19 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |