| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| MC JC | NC_000913 | 3,366,751 | Δ295 bp | IS5‑mediated | yhcE–[yhcF] | yhcE, [yhcF] |
| Missing coverage evidence... | ||||||||||
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| seq id | start | end | size | ←reads | reads→ | gene | description | |||
| * | * | ÷ | NC_000913 | 3365725–3366753 | 3367045 | 293–1321 | 12 [10] | [0] 58 | [insH‑10]–[yhcF] | [insH‑10],yhcE,[yhcF] |
| New junction evidence | |||||||||||
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| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_000913 | = 3366750 | NA (NA) | 58 (1.250) | 46/426 | 0.1 | 100% | noncoding (1/1195 nt) | IS5 | repeat region |
| ? | NC_000913 | 3367046 = | 0 (0.000) | coding (121/717 nt) | yhcF | DUF1120 domain‑containing protein YhcF | |||||
AGCGGTAAAAGCGTTAGCCTCACACTGACAATGGCTCCAGCTTTTAAGGATGAAGGGGAACTAACCGACATGACAGATATTACAGGCAATCTGACGGTCCTGGTGGAGGCAAAATGAACAATGTAAAATTACTGATTGCCGGAAGTGCCTTTTTTGCCATGTCAGCGCAAGCCGCTGATAGAGTATCAATTGACGTTAAGGTGACTCTGGAAGCTGCAGCTTGTACTCCAATACTAAGCAACGGCGGAGTTGTTAACTTCGGTAGTCATTCAGTCAATAGACTTTCAACGCAGCACTACACACAGATTGGAACACGTAATATTAATATGACTATAACTTGCGAATCCGCTACCGGCATTGCGATTACCGCTCGTGATACACGAATGGATAGTATGACCACCGGAAAAGATAGTGGGGGTCAGAGTGGTGTAAAATATACCTTAAATGGCGGAGGTTA > NC_000913/3366813‑3367269 | ataaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagggacttgttcgcaccttccCTAAGc > 2:178887‑M2/234‑239 (MQ=255) aaggtcgccggccattaccagccttggggtaaaacggctcgatgacttccaccatgttttgccatggcagaatctgctccatgcgggacaagaaaatctcttttctggtctgacggcgcttactgctgaattcactgtcggcgaaggtaagttgatgactcatgatgaaccctgttctatggctccagatgacaaacatgatctcatatcagtgacttgttcgcaccttccCTAAGCaa > 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |