| Predicted mutation | ||||||
|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
| JC | NC_000913 | 1,509,875 | (CGTCCA)1→2 | coding (368/417 nt) | hicB → | antitoxin of the HicA‑HicB toxin‑antitoxin system |
| New junction evidence | |||||||||||
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| * | ? | NC_000913 | = 1509869 | 0 (0.000) | 94 (0.860) +CGTCCA |
59/402 | 0.6 | 100% | coding (362/417 nt) | hicB | antitoxin of the HicA‑HicB toxin‑antitoxin system |
| ? | NC_000913 | 1509870 = | 0 (0.000) | coding (363/417 nt) | hicB | antitoxin of the HicA‑HicB toxin‑antitoxin system | |||||
GCTTTACTGACCGCATTTGATTTTTATTTTGAAGATAACGAGCTTATCCCTTTACCTTCGCCATTAAATAGTCACGATCACTTTATTGAAGTACCTTTGAGCGTCGCCTCTAAGGTATTGCTGTTAAATGCTTTTTTACAGTCAGAAATCACTCAGCAAGAGTTAGCCAGGCGAATTGGCAAACCTAAACAGGAGATTACTCGCCTATTTAACTTGCATCATGCGACAAAAATCGACGCCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTAACGAAAAGTTGTCATTTTTAACAACTGATATAGACTGCCGAATCATCTGCACATAATTACGATTCGATAATGAAAAAATACCAGCAGCTTGCAGAACAATTACGCGAGCAGATTGCGTCGGGTATCTGGCAACCCGGCGATCGTTTGCCTTCGTTGCGTGACCAGGTGGCGCTTT > NC_000913/1509631‑1510108 | ctgaccgcatttgatttttattttgaagataacgagcttatccctttaccttcgccattaaatagtcacgatcactttattgaagtacctttgagcgtcgcctctaaggtattgctgttaaatgcttttttacagtcagaaatcactcagcaagagttagccaggcgaattggcaaacctaaacaggagattactcgcctatttaacttgcatcatgcgacaaaaatcgacgccgtccac > 2:676624‑M2/240‑240 (MQ=255) 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2:120307‑M2/93‑239 (MQ=255) gcaagagttagccaggcgaattggcaaacctaaacaggtgattactcgcctatttaacttgcatcatgcgacaaaaatcgacgccgtccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTNACGAAAAg > 2:323847‑M2/91‑162 (MQ=255) agccaggcgaattggcaaacctaaacaggagattactcgcctatttaacttgcatcatgcgacaaaaatcgacgccgtccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGAt > 2:1028267‑M2/82‑129 (MQ=255) agccaggcgaattggcaaacctaaacaggagattactcgcctatttaacttgcatcatgcgacaaaaatcgacgccgtccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTAACGAAAAGTTGTCATTTTTAACAACTGATATAGACTGCCGAATCATCTGCACATAATTACGATTCGATAATGAAAAAATACcagc > 2:322173‑M2/82‑230 (MQ=255) aggcgaatnggcaaacctaaacaggagattactcgcctatttaacttgcatcatgcgacaaaaatcgacgccgtccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTAACGAAAAGTTGTCATTTTTaa < 2:489243‑M2/85‑1 (MQ=255) ggcgaattggtaaacctaaacaggagattacacgcatatttaacttgcatcatgcgacaaaaatcgacgccgtccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTATCGAAAAGTTGTCATTTTTaac < 2:562458‑M2/86‑1 (MQ=255) gcgaattggcaaacctaaacaggagattactcgcctatttaacttgcatcatgcgacaaaaatcgacgccgtccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTAACGAAAAGTTGTCATTTTTAACAACTGATATAGACTGCCGAATCATCTGCACATAATTACGATTCGATAATGAAAAAATaccaac > 2:3951‑M2/76‑222 (MQ=255) gcgaattggcaaacctaaacaggagattactcgcctatttaacttgcatcatgcgacaaaaatcgacgccgtccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTAACGAAAAGTTGTCATTTTTAACAACTGATATAGACTGCCGAATCATCTGCACATAATTACGATTCAAt > 1:634095‑M2/76‑207 (MQ=255) tggcaaacctaaacaggagattactcgcctatttaacttgcatcatgcgacaaaaatcgacgccgtccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTAACGAAAAGTTGTCATTTTTAACAACTGATATAGACTGCCGAATCATCTGCACATAATTACGATTCGATAATGAAAAAATACCAGCAGCTTGCAGAACAATTACGCGa < 2:101623‑M2/171‑1 (MQ=255) 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> 2:733255‑M2/25‑192 (MQ=255) tgcgacaaaaatcgacgccgtccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTAACGAAAAGTTGTCATTTTTAACAACTGATATAGACTGCCGAATCATCTGCACATAATTACGATTCGATAATGAAAAAATACCAGCAGCTTGCAGAACAATTACGCGAGCAGATTGCGTCGGGTATCTGGCAACCCGGCGATCGTTTGCCTTc > 1:237050‑M2/25‑240 (MQ=255) gcgacagaaaccgacgccggccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTAACGAAAAGTTGTCATTTTTaacaa < 2:42633‑M2/88‑1 (MQ=255) gccgccgtccaCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGt < 2:968858‑M2/35‑1 (MQ=255) aCGTCCAGCTCGCGGCAAAGGCGCTTGGCAAAGAGTTATCGCTGGTGATGGTTTAATTACAGTTAACGAAAAGTTGTCATTTTTAACAACTGATATAGACTGCCGAATCATCTGCACATAATTACGATTCGATAATGAAAAAATACCAGCAGCTTGCAGAACAATTACGCGAGCAGATTGCGTCGGGTATCTGGCAACCCGGCGATCGTTTGCCTTCGTTGCGTGACCAGGTGGCGCttt < 1:707994‑M2/239‑1 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 16 ≤ ATCG/ATCG < 31 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |