| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3614886 | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/104 | NT | NA | coding (2335/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3615091 | NA (NA) | coding (2540/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3614817‑3614886‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caggTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCA < CP009273/3615091‑3615025 ACGGTGCATCCCCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:17011407/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACCTGCGTACAACGCGCA > 1:42680558/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACACCGCGCA > 1:34024959/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:33843730/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:21897863/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:41554489/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:4136192/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:40862722/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:39643589/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:23003215/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:25152585/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:25246464/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:3527777/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:26217624/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:3885235/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:38768826/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:28775614/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:2916777/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:29481824/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:36723162/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:30357778/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:4740563/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:6757411/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:8376865/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:1380410/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:11974582/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:14849249/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:9539520/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:17672474/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:18251582/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:11065516/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:18373355/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:4709745/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:19286971/1‑68ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTATGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:2071389/1‑68ACGGTACATCCCCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:20319017/1‑68ACGATGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCA > 1:38925968/1‑68 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGCCATGCGTACAACGCGCAGG > 1:10682192/1‑68 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG > 1:33415684/1‑68 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG < 1:38282142/68‑1 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG < 1:34903343/68‑1 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG < 1:3508690/68‑1 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG > 1:35362270/1‑68 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG > 1:36722718/1‑68 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG < 1:13564387/68‑1 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG > 1:36743200/1‑68 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG < 1:37863919/68‑1 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG < 1:27626598/68‑1 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG < 1:27104526/68‑1 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG > 1:1544703/1‑68 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG > 1:15533498/1‑68 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG < 1:5281877/68‑1 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG < 1:39790122/68‑1 GGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG > 1:20426551/1‑68 ACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGGTGCTGGCT < 1:32619910/68‑1 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC > 1:41648221/1‑68 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC > 1:23296684/1‑68 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC < 1:27003434/68‑1 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC < 1:38493800/68‑1 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC > 1:22421230/1‑68 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC > 1:6518146/1‑68 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC < 1:20115183/68‑1 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC > 1:888164/1‑68 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC < 1:31716940/68‑1 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC < 1:21281911/68‑1 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC > 1:11724222/1‑68 CAGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC > 1:34623470/1‑68 CAGGGGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC < 1:29680626/68‑1 AGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC > 1:31164345/1‑67 AGGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGC > 1:40324732/1‑67 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:4221186/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:42794285/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:4740244/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:17068016/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:17118944/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:5064203/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:9627797/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:5830660/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:6416765/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:13485115/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:12067791/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:8950938/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:33929547/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:37967435/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:33856250/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:10370829/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:36441606/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:30214408/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:28947348/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:37564719/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:28741975/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:21670049/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:38414042/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:26809537/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:22014316/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:21834560/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:41198537/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTCCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:33233568/1‑68 GGTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGAGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGC > 1:18982504/1‑68 GTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCTTGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCA < 1:27157854/68‑1 ACGGTGCATCACCCGCAGACGGAAGCACTGCTCTGGCAGCATGAGACCAGACATGCGTACAACGCGCAGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3614817‑3614886‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑caggTGCTGGCTCTGTAACTGCCCGGCAGGGGTATAAGCGGTGGTGAGTTCATAACGGCCGAAGCTGCGCA < CP009273/3615091‑3615025 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |