| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4306574 = | 249 (0.470) | 17 (0.040) | 12/98 | NT | 8.3% | coding (462/1137 nt) | phnM | ribophosphonate triphosphate hydrolase |
| ? | CP009273 | 4306632 = | 160 (0.350) | coding (404/1137 nt) | phnM | ribophosphonate triphosphate hydrolase | |||||
GCACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4306646‑4306574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagcgcAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT > CP009273/4306632‑4306696 GCACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTG < 1:32368601/67‑1 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCCCACCACGCTGCCGCTGTTTGCAAAACTGGTGCc > 1:27344773/1‑66 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCA > 1:8171191/1‑67 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCA > 1:12356777/1‑67 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:25372813/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:40623087/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:22418287/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:39192973/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:38080643/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:37279097/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:6923164/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:13819810/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:13809477/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:35788045/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:3569812/68‑1 CGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCG < 1:24965823/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:13336204/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:6486043/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:7914096/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:22854778/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:22804281/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:42473/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:29488798/68‑1 CATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGAT > 1:39846231/1‑67 ATCTGCGCTGCTAACTGCCGCATCACACCCCGCTGCCGCTGTTTTAAAAACTGGTGCAGCGCAGATG < 1:29295601/67‑1 ATCTGCGCTGCGAACTGCCGAATCACACCACGCTGCCGCTGTTTTAAAAACTGGTGCAGCGCAGATG < 1:24757946/67‑1 TCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCA > 1:33896243/1‑68 GCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGAC < 1:22219777/68‑1 GCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGAC < 1:12721258/68‑1 GCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGAC < 1:20542200/68‑1 GCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCGGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGAC < 1:28966863/68‑1 CGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACCCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGAC < 1:25364550/67‑1 GCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCTGATGCAGACGG > 1:33530184/1‑68 GCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGG > 1:23233540/1‑68 GAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTC > 1:42500648/1‑68 ATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTG > 1:32603979/1‑68 ACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGAC > 1:42703122/1‑67 ACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCG > 1:33025268/1‑68 CGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGT > 1:35967491/1‑68 GCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:42884008/1‑68 CTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:6201400/1‑67 GCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGCCGCCGCGTTTCTGCG > 1:12351702/1‑68 AAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGAT > 1:11013139/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:7960803/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:11982420/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:11011664/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:3191618/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:13739483/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:2385097/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:42762150/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:22840405/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:21155095/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:21203940/1‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTT > 1:1474680/1‑66 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATC > 1:25949196/1‑68 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:26654554/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:20796692/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:2294428/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:15019441/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:26706543/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:10444724/67‑1 GCGCAGCTGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCAGCGTTTCTGAGTCTCTTAGATGGCGTAGATCA > 1:30351575/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:17238040/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:22153703/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:18498905/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:23726019/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:2764777/1‑68 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:16462794/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:28182550/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:22074604/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:41682187/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:19720154/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:22857683/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:13278600/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:43050821/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:17974525/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:11949993/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:10998510/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:21601001/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:32129290/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:37821085/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:37625078/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:25497981/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:3583361/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:26925098/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:33705253/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:32966208/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:30868268/1‑66 GCACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4306646‑4306574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagcgcAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT > CP009273/4306632‑4306696 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |