| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 222376 = | NA (NA) | 5 (0.010) | 3/98 | NT | NA | noncoding (131/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon |
| ? | CP009273 | 222394 = | NA (NA) | noncoding (149/2904 nt) | rrlH | 23S ribosomal RNA of rrnH operon | |||||
Only 100 of 1171 total aligned reads displayed.
TTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/222449‑222376‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acacactATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAGG > CP009273/222394‑222460 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:40287009/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:7927560/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC < 1:7417669/68‑1 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:22384965/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:5835949/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:13964938/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:39515544/1‑68 TAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:35901173/1‑68 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:36240679/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:2875441/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:30048994/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:22766105/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:4554075/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:23646215/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:5546652/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:24698700/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:6939753/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACA < 1:3650752/68‑1 AGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAAC > 1:2790316/1‑67 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:26242959/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:25255221/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:34594018/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:21453950/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:20005270/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:41140327/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:42228495/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:18779517/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:33725755/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:43450390/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:15326181/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:14947217/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:519981/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:13618093/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:12128284/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:100463/1‑68 GATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:10501308/1‑68 ATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:16151795/1‑67 TGTTTCAGTTCCCCCGTTTCGCCTCATTAACCTATGAATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA < 1:20597780/67‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTTATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:31255216/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA < 1:26526114/67‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA < 1:28356413/67‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA < 1:18189209/67‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACA > 1:17843427/1‑67 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:37704703/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:37894985/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:34903811/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:40463231/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:34275861/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:34066215/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:42601741/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:43110431/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:963360/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:19166195/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:23345556/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:24094143/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:23114777/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:2596514/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:17384141/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:29566423/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:29750071/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:16853634/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:16587782/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:14342540/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC < 1:11341576/66‑1 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:1095279/1‑66 TGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGAAAGTGTGTCGAAACAC > 1:39870632/1‑66 GTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:41684969/1‑65 GTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:307929/1‑65 GTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAC > 1:38469650/1‑65 TTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACTtg < 1:21039868/68‑3 TCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACAAACTcgg > 1:37123008/1‑65 ACACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTAC > 1:19737687/1‑67 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC < 1:32730055/67‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC > 1:15819476/1‑67 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC < 1:30363342/67‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC < 1:29162557/67‑1 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC > 1:2740002/1‑67 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC > 1:32087827/1‑67 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC > 1:3527886/1‑67 CACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACC > 1:9142525/1‑67 ACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:35742653/1‑68 ACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:25004279/1‑68 ACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:12640339/1‑68 ACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:38161439/1‑68 ACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:66764/1‑68 ACACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCC > 1:6274489/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGGGGCGAA < 1:41407921/37‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:8264265/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:857329/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA < 1:31570709/68‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA < 1:13031581/68‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:14663270/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:4852293/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA < 1:33409871/68‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:42000423/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA < 1:21986041/68‑1 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:26934213/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGA > 1:39071351/1‑68 ACTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGT > 1:40738313/1‑61 CTATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAG > 1:11892047/1‑68 TTAGATGTTTCAGTTCCCCCGGTTCGCCTCATTAACCTATGGATTCAGTTAATGATAGTGTGTCGAAACACACT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/222449‑222376‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acacactATCATTAACTGAATCCATAGGTTAATGAGGCGAACCGGGGGAACTGAAACATCTAAGTACCCCGAGG > CP009273/222394‑222460 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |