New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 725724 | NA (NA) | 26 (0.060) | 14/94 | NT | NA | coding (686/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
? | CP009273 | = 725738 | NA (NA) | coding (700/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
Only 100 of 383 total aligned reads displayed.
CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/725649‑725724 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccggtgaTTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCA < CP009273/725738‑725673 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:21082714/68‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:22596555/68‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:37158870/68‑1 CGCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCC < 1:6456557/68‑1 GCCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG < 1:36158611/68‑1 CCGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCG > 1:17078663/1‑67 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:9204969/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:8868302/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:10067935/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:26277084/68‑1 CGTACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCC < 1:13731998/68‑1 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGCCCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCCCCGCGAAGCCGCCGG > 1:30701318/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:25409752/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:33940509/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:27848456/1‑68 TACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG > 1:12445126/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGg > 1:15210697/1‑67 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:13809196/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:26601546/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGT > 1:33395518/1‑68 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:2368329/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:34501860/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:24315770/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:35463037/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:10135682/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:33175497/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:31246341/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:8095693/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:42685584/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:8710365/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:16511268/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:43587221/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:17395002/67‑1 ACCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGG < 1:18183898/67‑1 CCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTG < 1:31735594/68‑1 CCGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTG > 1:591463/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:7766549/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:6335885/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA > 1:12009866/1‑68 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGA < 1:2571832/68‑1 CGGGTACTGACCGGGCTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGCTGA < 1:8369519/68‑1 CTGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAAT < 1:23048012/67‑1 TGGTGGACCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTC < 1:39313739/68‑1 CCGCTTCGGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGC < 1:2032116/67‑1 GGGCGCACACAGACGTTCCACCGCGAAGCCGCCGGTGATTGCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGC < 1:7007526/68‑1 tGACGTTCCCCCGCGAAGCCGCCGGTGATTGCGCCGCTGAATTCCCCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGT < 1:29495917/67‑1 GTTCCACCGCGCAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGT > 1:8522347/1‑68 CACCGCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCGGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGACCGTCTGTGTGC > 1:22330633/1‑68 GCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCC > 1:41866538/1‑68 GCGAAGCCGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCC > 1:15909955/1‑68 CGCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCGCCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:18542034/1‑68 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:5309198/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:32856306/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:38958925/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:40224444/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:28775712/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:3153711/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:13157319/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:15674241/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:19232870/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:21867122/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT < 1:2407086/68‑1 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:40037553/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:14645958/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:16717367/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:17657761/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:1895947/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:43233655/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:19566348/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:397324/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:33075037/1‑67 GCCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGAGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGG > 1:12775822/1‑67 CCGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGT > 1:27544630/1‑67 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CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:2586290/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:23463689/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:36781870/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTC < 1:11415144/67‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTC < 1:35686152/67‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTC < 1:10325648/67‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTC < 1:38708826/67‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGGCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:11031056/68‑1 CGGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTGCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCC < 1:20670445/68‑1 GGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:2742336/68‑1 GGTGATTTCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCA < 1:1333145/68‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |