| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2402276 | NA (NA) | 12 (0.030) | 5/96 | NT | NA | noncoding (6/19 nt) | REP167 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP167 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | CP009273 | = 2402283 | NA (NA) | noncoding (13/19 nt) | REP167 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP167 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | |||||
CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2402203‑2402276‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgccggaTGCAATCTCCGGCAGTGAAATTAAGATTACAGCTGATGATAACCAGAAAGGAAACGCGCGAACTTGC < CP009273/2402283‑2402217 CGATCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:33240096/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATGATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:25828283/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTATTTTCACT < 1:16620981/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:38566814/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:19988171/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:19672350/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:18986961/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:39062381/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:18393478/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:33096052/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:17026391/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:15893529/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:4410211/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:15305019/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:2671828/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:12175484/68‑1CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACT < 1:8404199/68‑1 AGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTG > 1:42138059/1‑67 AGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTG > 1:28313926/1‑67 AGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTG > 1:7927658/1‑67 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:27787446/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:27264329/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:26902948/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:26562615/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:26473249/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:40500037/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:38095863/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:39622489/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:1198690/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:40564051/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:41393515/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:4900052/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:5076447/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:5142178/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:6822625/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:7143096/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:9837512/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:18687971/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:10288726/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:12872731/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:13382856/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:1565114/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:16750597/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:17450055/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:2626090/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:21186374/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:21484110/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:23576719/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:2324595/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:24983758/1‑68 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:28690887/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:40374182/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:39032736/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:43468030/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:13626936/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:3380825/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:33325907/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:33145000/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:23105077/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:3213564/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:12175122/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGC < 1:25453794/67‑1 GCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATAATAAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC > 1:34716398/1‑68 CTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCCG > 1:29583291/1‑68 TGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCCGG > 1:7912098/1‑68 TGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCCGG > 1:13786541/1‑68 TGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCCGG < 1:16828135/68‑1 TGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCCGG > 1:1772379/1‑68 TGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCCGG > 1:29571803/1‑68 TGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCCGG < 1:31636214/68‑1 TGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCCG < 1:4040189/67‑1 TGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC < 1:14952633/66‑1 TGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCC < 1:27670282/66‑1 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ATGCAATCTCCGGCAGTGAAATTAAG‑TTACAGCTGATGATAACCAGAAAGGAAACGCGCGAACTTGC < 1:4322642/67‑1 CGAGCTGTCTTTGAGCAAGTTCGCGCGTTTCCTTTCTGGTTATCATCAGCTGTAATCTTAATTTCACTGCCGGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2402203‑2402276‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ctgccggaTGCAATCTCCGGCAGTGAAATTAAGATTACAGCTGATGATAACCAGAAAGGAAACGCGCGAACTTGC < CP009273/2402283‑2402217 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |