| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3538010 | 391 (0.740) | 21 (0.050) | 14/94 | NT | 5.7% | coding (194/771 nt) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase |
| ? | CP009273 | = 3538051 | 363 (0.820) | coding (153/771 nt) | bioH | pimeloyl‑ACP methyl ester carboxylesterase | |||||
Only 100 of 143 total aligned reads displayed.
GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3537937‑3538010‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggcttcggGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCACC < CP009273/3538051‑3537986 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:10389805/1‑67GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:37406271/1‑67GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:1503756/1‑67GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:6786040/1‑67GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:27791674/1‑67GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGACTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:31873215/1‑67 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:38200651/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:40734467/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:30901708/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGG < 1:14171756/67‑1 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:5343008/1‑66 CTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACG > 1:29014728/1‑66 TTGCCACCAGCCCGCCCGGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:20895907/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCACATGGCGTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:36592445/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCT > 1:36950625/1‑68 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:9188417/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:35100666/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:20219082/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:10214878/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:19516393/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:2364413/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:2377354/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:25126818/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:26393520/67‑1 TTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGC < 1:6734314/67‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTACCCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:1341901/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:24927314/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:26057967/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:36069304/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:31936126/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:26654056/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:28913684/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:38735597/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:39351335/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:885572/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:17668914/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:13208757/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:6615679/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:42116603/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:15790184/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG < 1:21800394/68‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG < 1:15253399/67‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:10308199/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:33918542/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:8002867/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:27279045/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:4136326/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG < 1:36361271/67‑1 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:18731412/1‑67 CACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCG > 1:19224453/1‑67 ACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG > 1:3118056/1‑67 CTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCCCGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGC > 1:11338438/1‑66 CTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGGGTCGGGCGGAGCCGGGGATTTTGTGggg > 1:16336473/1‑65 CCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTGGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTg > 1:35534975/1‑67 CAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCGGGGGATTTGGTGCGCTGTC > 1:26210755/1‑67 TGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTGGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTG > 1:9580930/1‑68 TCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCCCTTGCTGATATG > 1:31090869/1‑68 TCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATG > 1:31135599/1‑68 CAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCGGCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGGTATG > 1:23030169/1‑67 AGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGGTGCCGGGGATTTGGTGCGCTGGCACTTGCTGGTTTGG > 1:40494653/1‑67 TGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGGCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGA > 1:15305489/1‑68 GCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAA > 1:42704154/1‑68 GCCTGTTGCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACGTGCTGATATTGCCGAA > 1:3748287/1‑68 TGCCGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGT > 1:3751272/1‑67 GCAGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGGGC > 1:24599944/1‑68 AGCACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCT > 1:31334099/1‑67 CACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:32623457/1‑68 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:572003/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:13104741/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:6993472/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:39887259/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:12081918/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:3271927/1‑67 ACGGCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCA > 1:24286620/1‑67 GCTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAG > 1:42280191/1‑68 CTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAG < 1:19484109/67‑1 CTTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAG < 1:2030658/67‑1 TTCGGGCGTTGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTCCTGCAACAGGC < 1:4388595/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:17371051/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:11440691/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:33149663/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:12640644/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:7106857/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:12771052/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:35020078/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:5890843/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:4818263/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:43340163/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:40091200/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC < 1:16080200/68‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:16874325/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:40786544/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGC > 1:37019684/1‑68 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGG < 1:14892401/67‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGG > 1:17711043/1‑67 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGG < 1:34728400/67‑1 TTCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGG < 1:12197355/67‑1 TCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA < 1:20030113/68‑1 TCGGGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA < 1:35870436/68‑1 GGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCA > 1:26516162/1‑65 GCTTGCCACCAGCCCGCCCAGACTCCAGCCTAACCAAATGGCTTTATCAGGTGCCTGTTGCAGCACGGCTTCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3537937‑3538010‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cggcttcggGCGTAGCCGGGGATTTGGTGCGCTGTCACTTGCTGATATGGCCGAAGCCGTGCTGCAACAGGCACC < CP009273/3538051‑3537986 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |