| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 610426 | 260 (0.490) | 18 (0.040) | 5/96 | NT | 6.4% | coding (814/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| ? | CP009273 | = 610453 | 304 (0.670) | coding (841/3882 nt) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent | |||||
Only 100 of 571 total aligned reads displayed.
GATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTT > CP009273/610360‑610492 | gagttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:35786160/65‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg > 1:23528806/1‑68 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:19808962/68‑1 (MQ=255)gATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCGGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCgg < 1:25022686/68‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGa < 1:10968637/67‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGa < 1:13676963/67‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGa < 1:14351549/67‑1 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:1796413/1‑68 (MQ=255) tttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAt > 1:1650406/1‑68 (MQ=255) ttAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGAtt > 1:26065499/1‑68 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:22018091/1‑66 (MQ=255) cccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTa > 1:3251500/1‑66 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:11860614/66‑1 (MQ=255) ccTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTAt < 1:14558106/66‑1 (MQ=255) ccTTCCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCt < 1:519064/68‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCGTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATg < 1:37964914/67‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATg < 1:42475050/67‑1 (MQ=255) gcTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGc > 1:35252677/1‑68 (MQ=255) tGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCg < 1:28469085/67‑1 (MQ=255) tGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCg < 1:10025948/67‑1 (MQ=255) ctgCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCg < 1:7686370/65‑1 (MQ=255) cAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTTTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCg < 1:39750827/67‑1 (MQ=255) aGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGa < 1:18529888/67‑1 (MQ=255) ttGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTgg > 1:4939793/1‑67 (MQ=255) tgtgGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGc < 1:10533804/68‑1 (MQ=255) ggCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:5331366‑M2/68‑3 (MQ=255) gCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:17409476‑M2/67‑3 (MQ=255) gCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcg < 1:6886920‑M2/67‑3 (MQ=255) cTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc < 1:26891021‑M2/68‑5 (MQ=255) tGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggc > 1:20818011‑M2/1‑63 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:39482094‑M2/1‑62 (MQ=255) ggggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcgg > 1:8054229‑M2/1‑62 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGCCTGGGCTcggcggc > 1:34928956‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:33630598‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:29661076‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:3406155‑M2/67‑8 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:27651331‑M2/1‑60 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:28691293‑M2/67‑8 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:20320423‑M2/67‑8 (MQ=255) ggCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc > 1:21584240‑M2/1‑60 (MQ=255) gCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcg > 1:30142093‑M2/1‑59 (MQ=255) gCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:12872588‑M2/66‑8 (MQ=255) gCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggc < 1:13251478‑M2/66‑8 (MQ=255) cGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTCGGCGgcgc < 1:43248095/67‑1 (MQ=255) gATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtag > 1:16906970‑M2/1‑57 (MQ=255) gATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtag > 1:16812979‑M2/1‑57 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:37456763‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:28993690‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:11961386‑M2/1‑55 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:29483518/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGa < 1:19709175/67‑1 (MQ=255) ttGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGGCGACTGGGCTcggcggcgtagt > 1:22618490‑M2/1‑55 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:38380321‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtcc > 1:29874628‑M2/1‑54 (MQ=255) tgtgCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACg > 1:39213967/1‑68 (MQ=255) gCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCt < 1:9215420/68‑1 (MQ=255) ccAATCGCATGGACTACGCCCCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGc < 1:28272661/66‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:30767745/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:10862211/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:7213683/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:25786687/67‑1 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa > 1:33199674/1‑67 (MQ=255) aaTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTa < 1:17211660/67‑1 (MQ=255) aTCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTAcc < 1:41881991/68‑1 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:6324532/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCgg > 1:32899025/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCGcggcggcgtagtccatacgatt > 1:474040‑M2/1‑46 (MQ=255) gTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGa < 1:34554168/68‑1 (MQ=255) aTGGACTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgc > 1:2319932‑M1/1‑16 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGagcccagtcgccgcttaaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcaca > 1:16146888‑M1/1‑14 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:18318328/1‑68 (MQ=255) ggACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCg > 1:2240721/1‑68 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacca > 1:31427159‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:35994980‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaa > 1:33110642‑M1/1‑12 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt < 1:36519518/67‑1 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:26597771/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:19513662/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:41129093/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:20263233/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:42992551/1‑67 (MQ=255) aCTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGt > 1:24647945/1‑67 (MQ=255) cTACGCCGCCGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatc > 1:15369777‑M1/1‑11 (MQ=255) cTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGc < 1:40454496/68‑1 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:3032408‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:8787553‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:23887542‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:12724324‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgc < 1:11782911‑M1/66‑60 (MQ=255) gccgccGagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgc < 1:15683413‑M1/66‑60 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgacgcataaagataattgcggcggcctagtgcatacgatagcacattcgcccc > 1:3111325‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcgggcgtagtccatacgattgcacaatcgcc > 1:11141665‑M1/1‑6 (MQ=255) ccgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:4473387/1‑68 (MQ=255) ccgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAAc > 1:38802601/1‑68 (MQ=255) ccgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGGGCTCAAc > 1:14966805/1‑68 (MQ=255) cgccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACg < 1:31741912/68‑1 (MQ=255) gccgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccag < 1:21298321‑M1/68‑65 (MQ=255) gccgGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTcggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccag > 1:39005768‑M2/1‑31 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagcc < 1:24164781‑M1/68‑67 (MQ=255) cgagcccagtcgacgcataaagataaatccggcggcgtagtccatacgattgcacaatcgccccagc < 1:36995788‑M1/67‑66 (MQ=255) | GATTTAGCCCTTGCGCTGGCAGCCTTGTGGCTGGGGCGATTGTGCAATCGTATGGACTACGCCGCCGGATTTATCTTTATGCGTCGACTGGGCTCGGCGGCGCTGACGGCTACCGGACCCGTGCTCAACGTTT > CP009273/610360‑610492 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |