| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1070400 | NA (NA) | 7 (0.020) | 3/98 | NT | NA | coding (3939/3963 nt) | putA | fused DNA‑binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase |
| ? | CP009273 | = 1070404 | NA (NA) | coding (3935/3963 nt) | putA | fused DNA‑binding transcriptional regulator/proline dehydrogenase/pyrroline‑5‑carboxylate dehydrogenase | |||||
Only 100 of 742 total aligned reads displayed.
TAAAGATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAGGATAT > CP009273/1070334‑1070467 | tAAAGATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGt < 1:33162323/68‑1 (MQ=255) aGATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTa > 1:30611823/1‑67 (MQ=255) aGATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTa > 1:6594438/1‑67 (MQ=255) gATGCCGGATGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:6976328‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:7189143‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:7420383‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:27735914‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:41832336‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:34338429‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:42573592‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:13275083‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:34038343‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:19936612‑M2/68‑2 (MQ=255) gATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGGCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:37888212‑M2/68‑2 (MQ=255) aTGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:15748196‑M2/67‑2 (MQ=255) aTGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACc < 1:42316186‑M2/67‑2 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTTTTAAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:40204194/68‑1 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:1212695/68‑1 (MQ=255) gTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTa < 1:2481506/68‑1 (MQ=255) tAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTAt > 1:6258338/1‑68 (MQ=255) aCATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:22488960/1‑68 (MQ=255) aCATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:16613812/1‑68 (MQ=255) aCATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:25021076/1‑68 (MQ=255) cATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:37184910/1‑67 (MQ=255) cATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:20134663/1‑67 (MQ=255) cATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:25410226/1‑67 (MQ=255) cATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTc > 1:26566201/1‑67 (MQ=255) cctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTcac > 1:19510038‑M2/9‑66 (MQ=255) cctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTcac > 1:1174958‑M2/9‑66 (MQ=255) cctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGATACCGCCAGCCGCAGCGGTATTcac > 1:5127727‑M2/9‑66 (MQ=255) cctccggcGACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCacac > 1:27467661‑M2/9‑68 (MQ=255) ctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCacac > 1:17213489‑M2/8‑67 (MQ=255) ctccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACt < 1:39463055‑M2/61‑1 (MQ=255) tccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTc > 1:31586282‑M2/7‑68 (MQ=255) tccggcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGATGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTc > 1:38693028‑M2/7‑68 (MQ=255) gcTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCg > 1:42084208‑M2/3‑68 (MQ=255) cTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGa > 1:9375175‑M2/2‑68 (MQ=255) aCCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAAc > 1:2137018/1‑68 (MQ=255) tGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGCACGc > 1:17684186/1‑67 (MQ=255) gTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTc > 1:41066479/1‑68 (MQ=255) gTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTc < 1:26019127/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat > 1:22941105/1‑68 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:36128701/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:365514/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:38295763/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:11965772/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:15223122/68‑1 (MQ=255) tAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCACCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGat < 1:19040500/68‑1 (MQ=255) aaCCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGata > 1:31221485/1‑68 (MQ=255) aaCCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGata > 1:1442323/1‑68 (MQ=255) aaCCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGata < 1:28260702/68‑1 (MQ=255) aCCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCTAACGCTCGatat > 1:16195254/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGAtata > 1:13821321/1‑67 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:29251698/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:8328392/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:26783825/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:40529096/1‑68 (MQ=255) cTATAGTCATTAAGCAGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATAc > 1:39798757/1‑68 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCCGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGACCGCTCGATATACAGcc > 1:35775607/1‑68 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGcc > 1:10048364/1‑68 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGcc > 1:22219692/1‑68 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGcc > 1:30140652/1‑68 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGcc > 1:3486500/1‑68 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGcc > 1:35109249/1‑68 (MQ=255) aGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGcc < 1:11515878/68‑1 (MQ=255) gTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCg > 1:435174/1‑68 (MQ=255) gTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCg > 1:43300498/1‑68 (MQ=255) gTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCg > 1:12650972/1‑68 (MQ=255) tCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGt > 1:24470014/1‑68 (MQ=255) tCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGt > 1:18580728/1‑68 (MQ=255) tCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGt > 1:5278293/1‑68 (MQ=255) cATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGtt < 1:11011385/68‑1 (MQ=255) cATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGtt < 1:18040529/68‑1 (MQ=255) cATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGtt < 1:8889329/68‑1 (MQ=255) cATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGt > 1:10286465/1‑67 (MQ=255) ttAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTcc > 1:23229639/1‑68 (MQ=255) aGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACCCTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGa > 1:7812402/1‑68 (MQ=255) aGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGa > 1:24177807/1‑68 (MQ=255) aGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGa < 1:5952095/68‑1 (MQ=255) aGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGa > 1:1688421/1‑68 (MQ=255) cTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAg > 1:2967818/1‑68 (MQ=255) cTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAg > 1:14840034/1‑68 (MQ=255) tGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAgg < 1:2080461/68‑1 (MQ=255) tGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAg < 1:37443784/67‑1 (MQ=255) ggCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAGGa < 1:26998296/68‑1 (MQ=255) cGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAGGata > 1:28972157/1‑68 (MQ=255) ggtaacgccagcttaatgactataggttaaacaggtagccggaggatgttacaacctcctcctgcatc < 1:21890473‑M1/68‑68 (MQ=255) ggtaacgccagcttaatgactataggttaaacaggtagccggaggatgttacaacctcctccggcatc < 1:4825334‑M1/68‑68 (MQ=255) 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ggtaacgccagcttaatgactataggttaaacaggtagccggaggatgttacaacctcctccggcatc < 1:10908080‑M1/68‑68 (MQ=255) ggtaacgccagcttaatgactataggttaaacaggtagccggaggatgttacaacctcctccggcatc < 1:9697697‑M1/68‑68 (MQ=255) | TAAAGATGCCGGAGGAGGTTGTAACATCCTCCGGCTACCTGTTTAACCTATAGTCATTAAGCTGGCGTTACCGCCAGCGGCAGCGGTATTCACACTCAGCGAACGCTCGATATACAGCCGTTCCAGAAGGATAT > CP009273/1070334‑1070467 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |