| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3202572 | 361 (0.690) | 22 (0.050) | 6/92 | NT | 8.0% | coding (1190/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte |
| ? | CP009273 | = 3202615 | 209 (0.480) | coding (1233/1464 nt) | ttdT | L‑tartrate/succinate antiporte | |||||
Only 100 of 493 total aligned reads displayed.
TCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCC > CP009273/3202505‑3202638 | gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:30102882/1‑67 (MQ=255) gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:16848088/1‑67 (MQ=255) gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:40457818/1‑67 (MQ=255) gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:39463654/1‑67 (MQ=255) gCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGcc > 1:36088538/1‑67 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:41460105/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:16341765/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:14834786/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:35038292/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:5770673/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACgg < 1:30641735/68‑1 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACg > 1:6535635/1‑67 (MQ=255) aaCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCACCGCCACgg < 1:15993925/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:20410229/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:31818924/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:22194588/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:31063295/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:41914385/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:15021311/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:29170501/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:4615999/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:27878368/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:5317666/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:11748315/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:8584285/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGGGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:43222976/68‑1 (MQ=255) aCGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGGGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:20130358/68‑1 (MQ=255) aCGAAGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGc < 1:18750044/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:2889936/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:23629812/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:27354950/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:37245886/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:22645139/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:41003795/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:14157450/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:5121247/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:10222009/68‑1 (MQ=255) gatggtgatggtGGCGTTGATTGTGGGGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGt < 1:30559027/68‑1 (MQ=255) ggtgatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGtata < 1:32277486/68‑1 (MQ=255) tgatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATAc < 1:29940256/67‑1 (MQ=255) gatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATAcc < 1:24999770/67‑1 (MQ=255) gatggtgGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATAcc < 1:28528657/67‑1 (MQ=255) tggtggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:14347139/1‑68 (MQ=255) gtggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTcc > 1:10430479/1‑66 (MQ=255) tggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGc > 1:40872639/1‑67 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:42501354/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:23839501/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:3894037/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:19389420/67‑1 (MQ=255) ggCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGct < 1:33985044/67‑1 (MQ=255) gTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCg < 1:29048112/68‑1 (MQ=255) tGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCa < 1:27576680/68‑1 (MQ=255) ttgttgTGTTTTATCTACTGCGCTTCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCAcc < 1:8140794/67‑1 (MQ=255) ttGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCAcc < 1:42895607/67‑1 (MQ=255) ttGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCg > 1:7451666/1‑68 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:16569745/68‑1 (MQ=255) tgtgGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCga < 1:35766082/68‑1 (MQ=255) gtggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgat < 1:38041035/68‑1 (MQ=255) gtggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgat < 1:13673451/68‑1 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga < 1:32828592/68‑1 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga < 1:26254095/68‑1 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga < 1:23052788/68‑1 (MQ=255) ggtgTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatga < 1:37514257/68‑1 (MQ=255) gtgtTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCgatgat > 1:33222613/1‑68 (MQ=255) tttATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGAtt < 1:9315944/68‑1 (MQ=255) tttATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGAtt > 1:42328891/1‑68 (MQ=255) tttATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGAtt < 1:21124853/68‑1 (MQ=255) tttATCTACTGCGCTACCTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGAtt < 1:26639936/68‑1 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCTGCTCTCGCACCGATGATGATtgct < 1:34532270/68‑1 (MQ=255) aTCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGAtt > 1:13202153/1‑65 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgggagagcggaggtatacgccgt > 1:38605201‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgt > 1:15440969‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgt > 1:25590717‑M1/1‑26 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:1279213/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:24567798/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:23311245/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:40096882/1‑66 (MQ=255) cTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgct > 1:11163608/1‑66 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtg > 1:3040378‑M1/1‑24 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtg > 1:21934116‑M1/1‑24 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:37916956/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:16106978/1‑67 (MQ=255) aCTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATtgctgct > 1:11589193/1‑67 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:21428600‑M2/1‑66 (MQ=255) cTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgc > 1:12030533‑M2/1‑66 (MQ=255) gcTACTTTTTCGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctg > 1:24772941‑M1/1‑19 (MQ=255) tACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggc > 1:17300361‑M2/1‑60 (MQ=255) tACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctgg > 1:8786748‑M2/1‑60 (MQ=255) aCTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTgcgctggcg > 1:9090131‑M2/1‑59 (MQ=255) tttttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGAt > 1:39122771/1‑68 (MQ=255) ttttCGCCAGCGCagcagcactcatcatcggggcgagagcggaggtttacgccgtggcggtggcgaaa > 1:18566137‑M1/1‑13 (MQ=255) tttCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGc < 1:1798687/68‑1 (MQ=255) tCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCg < 1:7763777/68‑1 (MQ=255) cGCCAGCGCagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagt > 1:1243492‑M1/1‑9 (MQ=255) cGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCgg > 1:31397183/1‑68 (MQ=255) gCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGa < 1:22278360/68‑1 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgcag > 1:26014673‑M1/1‑2 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgcag > 1:33707377‑M1/1‑2 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgtggcgctggcgaaaaagtagcgcag > 1:35234194‑M1/1‑2 (MQ=255) gcagcagcaatcatcatcggtgcgagagcggaggtatacgccgaggcgctggcgaaaaagtagagcag > 1:6342325‑M1/1‑2 (MQ=255) | TCGCCAACGATGGTGATGGTGGCGTTGATTGTGGTGTTTTATCTACTGCGCTACTTTTTCGCCAGCGCCACGGCGTATACCTCCGCTCTCGCACCGATGATGATTGCTGCTGCGCTGGCGATGCCGGAAATCCC > CP009273/3202505‑3202638 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |