| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3614228 | NA (NA) | 7 (0.020) | 6/90 | NT | 100% | coding (1677/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3614368 | 0 (0.000) | coding (1817/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 277 total aligned reads displayed.
GCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAG > CP009273/3614317‑3614435 | ctgaccGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaa > 1:4300840‑M2/1‑14 (MQ=255) gccgccgtCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:14762608‑M2/2‑11 (MQ=255) acgGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:9419688‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcctaacgggttacataaccggaccagtcggtgaa < 1:23195841‑M2/65‑55 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:34808340‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:22895597‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:17979167‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:24315186‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:17365832‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:24744368‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:24847850‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:27348206‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:27525640‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:30563218‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:31758188‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:39513780‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:41514923‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:43271190‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:12323409‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:5491308‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc < 1:7691842‑M2/67‑57 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc < 1:10514197‑M2/67‑57 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:38285527‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc < 1:38831862‑M2/67‑57 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:8294543‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc < 1:4841213‑M2/67‑57 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc < 1:17258256‑M2/67‑57 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:1613451‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:18943846‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:18740178‑M2/1‑11 (MQ=255) ccgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctc < 1:1844859‑M2/68‑59 (MQ=255) ccgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct < 1:23466393‑M2/67‑58 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:25690103‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:23750727‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:11234999‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:10246726‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgGCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:32311043‑M2/1‑9 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:16058169‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:15411197‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:15728336‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:5217127‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:34397457‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:34966957‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:16675497‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:36571339‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:6861090‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:10975633‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:8948853‑M2/67‑60 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacatatccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:35632909‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:1189981‑M2/68‑63 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:24639234‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:32132962‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:4384181‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:33461204‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:36886404‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:38366074‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:31300500‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:13180559‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:8611002‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:28018925‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:26463794‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:21081011‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:6650256‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcgggcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:14363855‑M2/1‑6 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:2539437‑M2/65‑63 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcaacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:30880415‑M2/1‑3 (MQ=255) aTctgccagaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaacag < 1:26064888‑M2/68‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcatatcgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:39920162‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataactggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:13202013‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagctactga > 1:37830851‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:41070477‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:40521854‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:40703875‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:12016415‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:33067945‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:12961776‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:42413235‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:42946506‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:2955864‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:19384865‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:21939340‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:25846958‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:27151766‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:39367035‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:30086580‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:30282381‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:3183731‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:14877721‑M2/1‑1 (MQ=255) 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tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:20092671‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:13695243‑M2/67‑67 (MQ=255) | GCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAG > CP009273/3614317‑3614435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |