| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4607857 = | 614 (1.170) | 13 (0.030) | 7/96 | NT | 2.4% | coding (718/780 nt) | deoC | 2‑deoxyribose‑5‑phosphate aldolase, NAD(P)‑linked |
| ? | CP009273 | 4607913 = | NA (NA) | coding (774/780 nt) | deoC | 2‑deoxyribose‑5‑phosphate aldolase, NAD(P)‑linked | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 685 total aligned reads displayed.
GCGCTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTACCCGT > CP009273/4607846‑4607979 | ttacttagtagctgctggcgctcttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagc < 1:28245374‑M2/1‑1 (MQ=255) cgcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCagcagc < 1:37306535/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:9570360/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:11742041/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:41696723/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct > 1:35875324/1‑67 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:25850302/67‑1 (MQ=255) gcTTCAAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCGGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:7717214/67‑1 (MQ=255) ttCCCGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:43003571/67‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTCAGAGCGCCAGCAGctac < 1:19243980/67‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctact < 1:2223429/68‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:29748115/67‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:2387638/67‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa < 1:41929771/68‑1 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:40892067/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:22412860/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:12948106/1‑68 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCGTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:3388467‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCAGGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:2641178‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaag < 1:36793002‑M1/68‑1 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:1462886‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:23346937‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:41393983‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:39766646‑M1/1‑65 (MQ=255) TGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGc > 1:2723238‑M1/1‑68 (MQ=255) TGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGc > 1:11196293‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:26874090‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:12205538‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:26180613‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:253647‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:1085270‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:21389753‑M1/1‑68 (MQ=255) CAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCtt > 1:34504586‑M1/1‑67 (MQ=255) CAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCtt > 1:13402121‑M1/1‑67 (MQ=255) tcttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:36491473‑M2/22‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:16958977/66‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:18324009/66‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg > 1:8909939/1‑66 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGcc < 1:24957123/68‑1 (MQ=255) tgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCt < 1:22759134/68‑1 (MQ=255) ccggcgccgtgaccccgcgctttcagcaggcttgccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTAACGCCTGa < 1:2951977‑M2/27‑1 (MQ=255) tgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAt > 1:1412582/1‑68 (MQ=255) tgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAt > 1:16411862/1‑68 (MQ=255) aaGCGCTGGGTCACGTCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgc < 1:27918883/67‑1 (MQ=255) aaGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgc < 1:17442618/67‑1 (MQ=255) aaGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgc < 1:37926550/67‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgc > 1:6190574/1‑65 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:30752679/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:4954602/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:22006641/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:26620854/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:8023648/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:6751381/68‑1 (MQ=255) ggggCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGCTGCTTTACGCCTGATgcgctgcgct < 1:19740857/68‑1 (MQ=255) gggTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATgcgctgcgct < 1:31577009/68‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:38168757/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:3857953/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:15070016/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:42743728/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa > 1:33039202/1‑67 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa < 1:39118884/67‑1 (MQ=255) cGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAg < 1:42279417/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTGCGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:38803499/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:21781365/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:17813250/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:28816428/68‑1 (MQ=255) gCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg > 1:18047792/1‑67 (MQ=255) gCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg > 1:20836351/1‑67 (MQ=255) cGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg > 1:35192895/1‑66 (MQ=255) cGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGc < 1:3256994/67‑1 (MQ=255) ggTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACg > 1:30078101/1‑68 (MQ=255) tAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACga < 1:20474195/67‑1 (MQ=255) aaGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACgaga < 1:1264187/68‑1 (MQ=255) aaGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACgaga < 1:18718806/68‑1 (MQ=255) aaGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACgag < 1:40261263/67‑1 (MQ=255) agagCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGAc > 1:33684139/1‑68 (MQ=255) agagCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGAc > 1:6066922/1‑68 (MQ=255) agCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt > 1:4378782/1‑68 (MQ=255) tcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:31970456/66‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACg < 1:37521276/66‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:41551370/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:8435188/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:24350998/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:13741250/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:5621259/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:10085567/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:30362782/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:31050688/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:15620642/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:32245808/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:34140762/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:37148848/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa > 1:16009959/1‑68 (MQ=255) cgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa > 1:43216985/1‑67 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa < 1:14418173‑M2/58‑1 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa < 1:6907438‑M2/58‑1 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTAt < 1:64113‑M2/59‑1 (MQ=255) gcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAc > 1:19426572‑M2/5‑67 (MQ=255) cagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAccc > 1:17197295‑M2/4‑68 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAcc < 1:20188055‑M2/64‑1 (MQ=255) | GCGCTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTACCCGT > CP009273/4607846‑4607979 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |