| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 910575 = | 101 (0.190) | 6 (0.010) | 5/98 | NT | 6.8% | intergenic (‑262/+233) | ybjE/aqpZ | putative transporter/aquaporin Z |
| ? | CP009273 | = 2222782 | 75 (0.160) | intergenic (+238/+135) | yohP/dusC | uncharacterized protein/tRNA‑dihydrouridine synthase C | |||||
Only 100 of 174 total aligned reads displayed.
TGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGC > CP009273/2222717‑2222849 | tGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcg > 1:147761‑M2/1‑66 (MQ=255) gcgGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAAGATCCCTGTAAATcgcg < 1:39916067‑M2/67‑5 (MQ=255) gcgGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTTAAAcgcg < 1:4830399‑M2/67‑5 (MQ=255) gcgGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcg < 1:8894097‑M2/67‑5 (MQ=255) gcgGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcg < 1:5412785‑M2/67‑5 (MQ=255) gcgGTGCCCTCGGCTTATCCCTTAAGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcg < 1:29994482‑M2/67‑5 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgccc > 1:9556722‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgccc > 1:25127883‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgccc > 1:252613‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgccc > 1:29558256‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcc > 1:1865311‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcc > 1:40535249‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcc > 1:12251402‑M2/1‑61 (MQ=255) ggTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgc < 1:27616683‑M2/66‑6 (MQ=255) gCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCa > 1:32350527/1‑68 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAg < 1:22159264/67‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAg < 1:13747536/67‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:25592559/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:20126197/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:19423672/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:16993881/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:11155408/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:12924726/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:42389048/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:42162123/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:16866201/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:37469115/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:38738933/68‑1 (MQ=35) ccTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGc < 1:34247790/68‑1 (MQ=35) cTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGGCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcccgacccg > 1:24266457‑M2/1‑55 (MQ=255) tCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc < 1:15490173/68‑1 (MQ=35) tCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc < 1:30934953/68‑1 (MQ=35) tCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc < 1:18905765/68‑1 (MQ=35) cGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc > 1:23124741/1‑67 (MQ=35) cGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc > 1:8020102/1‑67 (MQ=35) cGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc > 1:11162985/1‑67 (MQ=35) cGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc > 1:33695889/1‑67 (MQ=35) cGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGccc > 1:34208256/1‑67 (MQ=35) ggCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcac < 1:27217942/68‑1 (MQ=33) ggCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcac < 1:33227774/68‑1 (MQ=33) ggCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcac < 1:10166369/68‑1 (MQ=33) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:13562746/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:5781587/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:38275489/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:6198858/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:23328101/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:15248312/1‑68 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCca > 1:30161125/1‑66 (MQ=31) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCGGTAAAACGCGCCCTCAGCCccca > 1:22976530/1‑68 (MQ=255) gCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCGGTAAAACGCGCCCTCAGCCcaca > 1:24673368/1‑68 (MQ=14) gCTTATCCCGTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCcact > 1:41709597/1‑67 (MQ=9) aTCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcccgacccggtagccgt > 1:28354212‑M2/1‑47 (MQ=255) cTTCCGGCTACCGGGGCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcccgacccggtagccgtaagg > 1:43099834‑M2/1‑43 (MQ=255) cTTACGGCTACCGGGGCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAAcgcgcccgacccggtagccgtaagg > 1:15954056‑M2/1‑43 (MQ=255) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:10246055/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:38660428/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:38049702/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:41932140/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:16022435/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:11636264/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:26373939/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:25521477/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCa > 1:23727521/1‑68 (MQ=31) tCCCTGTAAAACGCG‑CCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:7328578/1‑68 (MQ=255) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:7982350/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:11379140/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:17636662/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:37053002/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:26863646/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:28633861/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:29591263/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:18141966/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:30472963/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCaa > 1:20567089/1‑68 (MQ=33) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCGTCAGGGAACGCCGCGGCaa > 1:432472/1‑68 (MQ=255) cccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATACATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGCACGCCTCGGCaa > 1:14551422/1‑68 (MQ=11) cacTGTAAAACGCGCCCTCAGCCAACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGCACGCCTCGGCaa > 1:7137392/3‑68 (MQ=11) ccTGTAAAAcgcgcccgacccggtagccgtaagggataagtcgagggcaccgcgcagcggcgattttg < 1:24585889‑M2/68‑60 (MQ=255) ccTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAAt > 1:32914283/1‑68 (MQ=35) gTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAAtttt > 1:42972706/1‑68 (MQ=35) gTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGAGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAAtttt > 1:31193389/1‑68 (MQ=25) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGGACGCCTCGGCAATTTTg > 1:17919031/1‑67 (MQ=25) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:31062479/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:37657699/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:23811746/1‑67 (MQ=35) aaaaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTg > 1:34672837/1‑67 (MQ=35) aaCGCGCCCTCAGCCCACCTCCATGTGGGCTGCCCCGGGCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGAc > 1:21196393/1‑67 (MQ=11) aaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGAc > 1:22258629/1‑67 (MQ=35) aaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGAc > 1:278209/1‑67 (MQ=35) aaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGAc > 1:32570927/1‑67 (MQ=35) aaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGAc > 1:14200173/1‑67 (MQ=35) aaCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGAc > 1:14249723/1‑67 (MQ=35) acgcgcccgacccggtagccgtaagggataagtcgagggcaccgcgcagcggcgattttgttcgccag < 1:10791427‑M2/68‑68 (MQ=255) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACg > 1:39593190/1‑67 (MQ=35) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACg > 1:21259347/1‑67 (MQ=35) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACg > 1:34567629/1‑67 (MQ=35) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACg > 1:24416232/1‑67 (MQ=35) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACg > 1:22843510/1‑67 (MQ=35) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACg > 1:17875734/1‑67 (MQ=35) aCGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACg > 1:30624398/1‑67 (MQ=35) | TGCGCGGTGCCCTCGGCTTATCCCTTACGGCTACCGGGTCGGGCGCGAGGTAACATCCCTGTAAAACGCGCCCTCAGCCCACATCCATGTGGGCTGCCCCGGCCTTCAGGGAACGCCTCGGCAATTTTGACGC > CP009273/2222717‑2222849 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |