| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 471426 | 544 (0.780) | 27 (0.050) | 9/88 | NT | 5.2% | intergenic (+19/+12) | ybaY/ybaZ | outer membrane lipoprotein/excision repair protein, alkyltransferase‑like protein ATL |
| ? | CP009273 | = 471428 | 563 (1.020) | intergenic (+21/+10) | ybaY/ybaZ | outer membrane lipoprotein/excision repair protein, alkyltransferase‑like protein ATL | |||||
Only 100 of 341 total aligned reads displayed.
TCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/471348‑471426‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaccctctccgGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < CP009273/471428‑471362 TCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATAAAGCGACGTT < 1:3641689/68‑1 GACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCATTATTAAGCGACGTTAA < 1:44852487/68‑1 GACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA < 1:27792133/68‑1 GACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA < 1:36866447/68‑1 GACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA < 1:17893391/68‑1 ACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA > 1:19627366/1‑67 ACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA > 1:50179231/1‑67 ACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAA > 1:667093/1‑67 TCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCT < 1:2340263/68‑1 TCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCC > 1:52847144/1‑67 ACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTC > 1:36985353/1‑67 CCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCT > 1:18393021/1‑67 CAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCC > 1:7131431/1‑68 CAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCC > 1:15946514/1‑68 CAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCC > 1:22599621/1‑68 AACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCG < 1:46364557/68‑1 GCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCGCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCT > 1:28615218/1‑68 CTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCG > 1:22018108/1‑68 ACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGA > 1:56314453/1‑68 GCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTATCGTCGCTTAATATTGCGGAGGA > 1:26044643/1‑66 GCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGGTTAATATTGCGTAGGA > 1:55423829/1‑66 ATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGA > 1:45442906/1‑67 GCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTGATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCC > 1:54232075/1‑68 GCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGGGTAGGAGGTGGAACTGCC > 1:26842113/1‑68 GCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCC > 1:8399644/1‑68 GCGACGTTAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCC > 1:7653626/1‑68 TAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACG > 1:12083969/1‑68 TAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACG > 1:43533195/1‑68 TAACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACG > 1:44184701/1‑68 AACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGG < 1:34952641/68‑1 AACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGG < 1:4592144/68‑1 AACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGG < 1:47175077/68‑1 AACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGG < 1:10570860/68‑1 ACCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGA > 1:5366435/1‑68 ccgTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:51699143/4‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAATGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:42003505/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGATCTGCCGAAGACGGAT > 1:10971408/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGATCTCCCGAAGACGGAT > 1:54584114/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:9340798/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:41411694/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:45766294/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:46207316/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:46888877/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:48061955/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:50596654/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:52052836/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:52316731/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:55801304/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:57769950/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:8036902/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:8746877/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:35730537/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:31647318/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:16209990/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:27122374/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:13819709/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:37795385/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:35582880/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:22979638/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:3774949/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:29440405/1‑68 CCCTCTCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGAT > 1:19274096/1‑68 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TCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA > 1:21209373/1‑66 TCCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA > 1:40473169/1‑66 CCGGGCGGAGAGGGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACC < 1:32504125/68‑1 CCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA > 1:10246504/1‑65 CCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA > 1:25394290/1‑65 CCGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCA > 1:44666279/1‑65 CGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTG > 1:51582842/1‑68 CGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTG > 1:15520348/1‑68 CGGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTG > 1:30507333/1‑68 GGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:56810107/68‑1 GGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:27503116/68‑1 GGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:14625324/68‑1 GGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:33198713/68‑1 GGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:3346741/68‑1 GGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < 1:34318504/68‑1 GGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAAAATTGCGTAGGTGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACGTGA < 1:28310446/68‑1 TCGACTTCACCAACTCAGGTGAATCCGTCTTCGGCAGTTCCAGCTCCTACGCAATATTAAGCGACGTTAACCCTCTCCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/471348‑471426‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑taaccctctccgGGCGGAGA‑GGGTTAACGTCGCTTAATATTGCGTAGGAGCTGGAACTGCCGAAGACGGATTCACCTGA < CP009273/471428‑471362 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |