New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3613160 | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/96 | NT | NA | coding (609/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
? | CP009273 | = 3613240 | NA (NA) | coding (689/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
Only 100 of 592 total aligned reads displayed.
CCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3613086‑3613160 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgctgAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTA < CP009273/3613240‑3613174 GCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCG > 1:58103759/1‑67 CAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCC > 1:33460988/1‑68 GGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGC > 1:6113689/1‑68 GGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCC > 1:18265395/1‑66 GGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCC > 1:42899301/1‑66 GGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCC > 1:38917978/1‑66 GGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGATGAGGTGCTGCCTGCGCC > 1:35783632/1‑66 GGATGAGGTGCTGCCTGCGCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCC < 1:49714767/66‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:34308749/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:13115236/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:27634233/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:41825582/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:43613479/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:26205434/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:25669443/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:41008914/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:38540691/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:22076498/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:19186839/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:51575822/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:7310735/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG > 1:32520617/1‑68 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:35261134/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:53007390/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:14884721/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:6842830/68‑1 GCCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:57298545/68‑1 CCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG > 1:37325949/1‑67 CCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG > 1:44205716/1‑67 CCGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG > 1:25347991/1‑67 CGCTGACTTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGGCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGT < 1:9101409/67‑1 CGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTC < 1:37876072/68‑1 CGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTC < 1:46251586/68‑1 CGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTC < 1:27125778/68‑1 CGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTC < 1:51145034/68‑1 CGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTC < 1:16713098/68‑1 CGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTC < 1:15841808/68‑1 CGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGT < 1:45432722/67‑1 CGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGT < 1:46013501/67‑1 CGCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGT < 1:10398901/67‑1 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GCTGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCA > 1:11339104/1‑68 TGAATTCCCCGGCGGCTTCGCGGGGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:26513926/68‑1 TGAATTCAGCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:54206099/68‑1 TGAATTCACCGGCGGCTTCGCTGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCTAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:42248347/68‑1 TGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:54993421/68‑1 TGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:29830791/68‑1 TGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:19818055/68‑1 TGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:31021034/68‑1 TGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:52132802/68‑1 TGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:17291903/68‑1 TGAATTCACCGGCGGCTTCGCGGTGGAACGTCTGTGTGCGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:15455043/68‑1 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |