| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 728285 = | NA (NA) | 13 (0.020) | 11/108 | NT | NA | coding (3247/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | 728314 = | NA (NA) | coding (3276/4194 nt) | rhsC | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
Only 100 of 789 total aligned reads displayed.
AACCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTGGAAAGT > CP009273/728218‑728350 | aaCCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTg > 1:32040410/1‑68 (MQ=33)aaCCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTg > 1:29647751/1‑68 (MQ=33) aCCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTgg < 1:21040234/68‑1 (MQ=35) aCCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTgg < 1:14035852/68‑1 (MQ=35) aCCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTg > 1:6313773/1‑67 (MQ=33) aCCGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTg > 1:16785665/1‑67 (MQ=33) ccGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGc > 1:401730/1‑68 (MQ=35) ccGCCACCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGc < 1:51769167/68‑1 (MQ=35) aCCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGa < 1:46412082/68‑1 (MQ=35) aCCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGa < 1:22083049/68‑1 (MQ=35) aCCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGa < 1:23351451/68‑1 (MQ=35) aCCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGa < 1:56174697/68‑1 (MQ=35) aCCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGa < 1:28233769/68‑1 (MQ=35) aCCGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGa < 1:53867138/68‑1 (MQ=35) cGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACg < 1:25721025/68‑1 (MQ=35) cGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACg < 1:15288546/68‑1 (MQ=35) cGGTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACg < 1:10886590/68‑1 (MQ=35) ggTGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACgg > 1:24357416/1‑68 (MQ=35) gctGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTCGCGGATACCCATAAGCAGTCCGGTGGCGAAGACgg > 1:2777368/3‑68 (MQ=11) tGAGCTGGCGAAATCGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTGCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGt < 1:9618079/67‑1 (MQ=11) tGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGt < 1:54629866/67‑1 (MQ=35) tGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGt < 1:13106962/67‑1 (MQ=35) tGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGt < 1:14282997/67‑1 (MQ=35) tGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGt < 1:5021818/67‑1 (MQ=35) tGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGt < 1:24879470/67‑1 (MQ=35) tGAGCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTg > 1:19727907/1‑68 (MQ=35) tGAGCGGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGt < 1:55141328/67‑1 (MQ=25) gCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGc < 1:26929100/67‑1 (MQ=35) gCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCa > 1:49391497/1‑68 (MQ=35) gCTGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCa > 1:33529686/1‑68 (MQ=35) tGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGTAGACGGTGGCAg < 1:44298144/67‑1 (MQ=25) tGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAgt < 1:425091/68‑1 (MQ=35) tGGCGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAgt < 1:2041140/68‑1 (MQ=35) cGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAgtgt < 1:16401941/67‑1 (MQ=35) cGAAAACGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAgtgt < 1:7549089/67‑1 (MQ=35) aCGCAGCGCCGCAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGgtgt > 1:43035108/1‑67 (MQ=35) gccgcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccgccg > 1:12596563/1‑68 (MQ=35) gccgcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccg < 1:1006907/65‑1 (MQ=35) gccgcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccg < 1:32680447/65‑1 (MQ=35) gccgcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGAAGGCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCccg < 1:45872337/65‑1 (MQ=255) cgcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt < 1:17876011/68‑1 (MQ=35) cgcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt < 1:55661491/68‑1 (MQ=35) cgcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt < 1:41388175/68‑1 (MQ=35) cgcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGt < 1:39270924/68‑1 (MQ=35) gcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTg < 1:38904891/68‑1 (MQ=35) gcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTg < 1:38489513/68‑1 (MQ=35) gcAGCCTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGAGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTg < 1:21580641/68‑1 (MQ=255) ccTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTgg > 1:43858475/1‑68 (MQ=35) cTGGCGGATACCGTTCAGCAGTCCGGTGGCGATGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGt < 1:40794743/68‑1 (MQ=255) cTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGt < 1:31339063/68‑1 (MQ=35) cTGGCGGATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGt > 1:15644476/1‑68 (MQ=35) ggATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGa > 1:12076193/1‑68 (MQ=35) ggATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGa > 1:33103588/1‑68 (MQ=35) ggATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGa > 1:8977435/1‑68 (MQ=35) ggATACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGa > 1:30260721/1‑68 (MQ=35) aTACCCTTCAGCAGTCGGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGAt < 1:52558653/67‑1 (MQ=25) aTACCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGAt < 1:3606413/67‑1 (MQ=35) aCCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGc > 1:11738608/1‑67 (MQ=35) aCCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGc > 1:13468068/1‑67 (MQ=35) aCCCTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGc > 1:50769574/1‑67 (MQ=35) cccTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTc > 1:11233308/1‑68 (MQ=35) ccTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCg > 1:43592209/1‑68 (MQ=35) ccTTCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCg < 1:36481858/68‑1 (MQ=35) ttCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGa > 1:39788375/1‑67 (MQ=35) tCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGccc > 1:35709186/1‑68 (MQ=25) tCAGCAGTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGAcc > 1:57423793/1‑68 (MQ=35) cagcagTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCg < 1:37558776/68‑1 (MQ=35) cagcagTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCg < 1:34927423/68‑1 (MQ=35) gcagTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGCCCg > 1:17120490/1‑66 (MQ=25) gcagTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCg > 1:35417254/1‑66 (MQ=35) 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1:46974806/1‑66 (MQ=35) gcagTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCACGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCg > 1:48358056/1‑66 (MQ=255) gcagTCCGCTGGCGAAGACGGTGTCAGTGTTCTCTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGCTGCTCGACCGGc > 1:6824735/1‑68 (MQ=11) agTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGc < 1:8521832/66‑1 (MQ=35) agTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGc < 1:44566619/66‑1 (MQ=35) agTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGc < 1:58099296/66‑1 (MQ=35) agTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTg > 1:45279615/1‑68 (MQ=35) agTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTg > 1:10550544/1‑68 (MQ=35) agTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTg > 1:55909483/1‑68 (MQ=35) agTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTg > 1:30926378/1‑68 (MQ=35) agTCCGGTGGCGAAGACGGTGGCAGTGTGGTGTTCCCGCCGGTGCTGGTGCAGATGCTCGACCGGCTg > 1:54207792/1‑68 (MQ=35) 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CP009273/728218‑728350 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |