| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4607857 = | 749 (1.070) | 12 (0.020) | 8/96 | NT | 1.8% | coding (718/780 nt) | deoC | 2‑deoxyribose‑5‑phosphate aldolase, NAD(P)‑linked |
| ? | CP009273 | 4607913 = | NA (NA) | coding (774/780 nt) | deoC | 2‑deoxyribose‑5‑phosphate aldolase, NAD(P)‑linked | |||||
| Rejected: Frequency below/above cutoff threshold. | |||||||||||
Only 100 of 954 total aligned reads displayed.
CGCTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTACCCG > CP009273/4607847‑4607978 | cgcTTCCAGCCTGCTGGCCAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTCAGAGCGCCagcagc < 1:54058942/67‑1 (MQ=255)cgcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCagcagc < 1:33087355/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGcta < 1:50221180/68‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:28567220/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:20801610/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:7669093/67‑1 (MQ=255) gcTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCGGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGct < 1:43581036/67‑1 (MQ=255) ttagtagctgctggcgctcttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagctact < 1:16190571‑M2/5‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:51978004/67‑1 (MQ=255) ttCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGctac < 1:53623993/67‑1 (MQ=255) ccAGCCTGTTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa > 1:36640661/1‑68 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACTGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa < 1:42226295/68‑1 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa > 1:55687577/1‑68 (MQ=255) ccAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaa > 1:15884870/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:29256923/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:37176367/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:22355461/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:587864/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagtaa > 1:20250796/1‑68 (MQ=255) ccTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAACAGCGCCAGCAGCTTCtaagtaa > 1:18623996/1‑68 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:1251655‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:44750151‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:21816617‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:33522212‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACtaagt > 1:34124932‑M1/1‑65 (MQ=255) CTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGAt < 1:31364690‑M1/67‑1 (MQ=255) ggcgctcttaccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACTAAGTAAGATGCt < 1:19315864‑M2/17‑1 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:11435467‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:29667232‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:36297788‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:27306556‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:26773734‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:4613285‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:24033362‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCt > 1:15505951‑M1/1‑68 (MQ=255) CAAGCCTGCTGATAGGGCTGGGTCACTGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCtt > 1:40321543‑M1/1‑67 (MQ=255) CAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCttt < 1:6488853‑M1/68‑1 (MQ=255) aGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTAc > 1:32848877/1‑68 (MQ=255) aGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTAc > 1:53318589/1‑68 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:16549806/66‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:31954113/66‑1 (MQ=255) ctgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACg < 1:4898246/66‑1 (MQ=255) tgctgAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCt < 1:8449914/68‑1 (MQ=255) tcccgtcgccgtgacccagcgctttcagcaggcttgccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCt < 1:45390751‑M2/25‑1 (MQ=255) aaGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgc < 1:18987487/67‑1 (MQ=255) gcgcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgc > 1:2280516/1‑65 (MQ=255) gcgcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgc > 1:25527162/1‑65 (MQ=255) gcggggTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:39368015/65‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:10044941/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:39911365/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:55183175/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:30902340/68‑1 (MQ=255) gcTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:14224668/68‑1 (MQ=255) gcTGGGGCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGAtgcgctgc < 1:13667325/68‑1 (MQ=255) gggTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATgcgctgcgct < 1:12085283/68‑1 (MQ=255) gggTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATgcgctgcgct < 1:11709689/68‑1 (MQ=255) ggTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATgcgctgcgct < 1:38083861/67‑1 (MQ=255) tCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTa > 1:888415/1‑67 (MQ=255) cGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAg < 1:37422031/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTTTCAgg < 1:56216084/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:51504810/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:48109348/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:47638022/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:805330/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:2762855/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:40800237/68‑1 (MQ=255) ggCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGAAGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAgg < 1:50901328/68‑1 (MQ=255) cGACCGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTCATCAGGc < 1:56635541/67‑1 (MQ=255) gACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCt < 1:41403554/68‑1 (MQ=255) cGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTa < 1:54802502/67‑1 (MQ=255) cGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACAAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTa < 1:31774274/67‑1 (MQ=255) tagagCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACgag < 1:28119520/66‑1 (MQ=255) aaGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACgag < 1:43022778/67‑1 (MQ=255) aaGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACgag < 1:30108183/67‑1 (MQ=255) agCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGATTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt > 1:10467402/1‑68 (MQ=255) agCGCCAGCAGCTACTAAGAAAGATCCTTTACGCATGATCCCCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt > 1:42514340/1‑68 (MQ=25) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACg < 1:52738302/66‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACg < 1:26080735/66‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACg < 1:4438997/66‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:9513859/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:46817008/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:11017100/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:17964619/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:30383561/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGt < 1:35301378/67‑1 (MQ=255) gcgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa > 1:19910152/1‑68 (MQ=255) cgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa > 1:25139272/1‑67 (MQ=255) cgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa > 1:7205566/1‑67 (MQ=255) cgcCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa > 1:38708819/1‑67 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa < 1:23426333‑M2/58‑1 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTa < 1:48450469‑M2/58‑1 (MQ=255) gccagcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATc < 1:35619454‑M2/60‑1 (MQ=255) agcagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTa > 1:57769507‑M2/6‑67 (MQ=255) cagCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAccc > 1:54562189‑M2/4‑68 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAcc < 1:5713817‑M2/64‑1 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAcc < 1:21317086‑M2/64‑1 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAcc < 1:17230686‑M2/64‑1 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAcc < 1:14767094‑M2/64‑1 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTAc < 1:3448371‑M2/63‑1 (MQ=255) agCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTACCCg > 1:12932128‑M2/3‑68 (MQ=255) | CGCTTCCAGCCTGCTGGCAAGCCTGCTGAAAGCGCTGGGTCACGGCGACGGTAAGAGCGCCAGCAGCTACTAAGTAAGATGCTTTACGCCTGATGCGCTGCGCTTATCAGGCCTACGAGACGTATCTACCCG > CP009273/4607847‑4607978 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |