| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3375198 = | 608 (0.870) | 49 (0.080) | 10/94 | NT | 9.3% | coding (1097/1368 nt) | degQ | serine endoprotease, periplasmic |
| ? | CP009273 | 3375228 = | 447 (0.760) | coding (1127/1368 nt) | degQ | serine endoprotease, periplasmic | |||||
Only 100 of 1028 total aligned reads displayed.
GTAGAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAGTTGTCA > CP009273/3375161‑3375296 | gAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAgg > 1:26881618/1‑68 (MQ=255) cttttagctgcccatcgcccaacgttgcacctcccagcgctggcgtgatcatttccgcgctggAAGGt < 1:33778717‑M2/5‑1 (MQ=255) aaGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:5138881/68‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:43743232/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt > 1:245643/1‑67 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:36136644/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt > 1:36353347/1‑67 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:40300088/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:4174832/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:42165276/67‑1 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt > 1:57553337/1‑67 (MQ=255) aGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGt < 1:52656411/67‑1 (MQ=255) tGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCTCTGGAAGGTGCa > 1:56199205/1‑68 (MQ=255) gACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCa > 1:16436394/1‑67 (MQ=255) cGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAAc < 1:48628471/67‑1 (MQ=255) cGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAAc < 1:23881466/67‑1 (MQ=255) ctgaccatcgctcaacgttgcaccttCCAGCGCTGGAATGATCACGCCCGCGCGGGAAGGTGCCAcgg < 1:34689653‑M1/42‑2 (MQ=255) ctgaccatcgctcaacgttgcaccttCCAGCGCGGAAATGATGACGCCAGCGCGGGAAGGTGGAACGt < 1:17690480‑M1/42‑1 (MQ=255) tcaccatcgctcaacgttgcaccttccagcgctggcgtgaacatttcagcgctggAAGGTGCAACGt < 1:11679776‑M2/12‑1 (MQ=255) aTACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAATGTGCAACGTTGAGc > 1:19060024/1‑68 (MQ=255) aTACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGc > 1:35684602/1‑68 (MQ=255) tACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGc < 1:38292133/67‑1 (MQ=255) ccAGCACCTCTTCGTCGGCCCGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGc > 1:44604953/1‑65 (MQ=255) ccAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGAt > 1:14095100/1‑68 (MQ=255) ccAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGAt < 1:39745698/68‑1 (MQ=255) cAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATg < 1:15199317/68‑1 (MQ=255) cAGCACCTCTTCGGCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATg < 1:12866907/68‑1 (MQ=255) aGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATgg > 1:50066134/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCTGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCGGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:6388381/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:52057849/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:19762022/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:35269971/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTc > 1:48016427/1‑68 (MQ=255) cACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCCATGGTc > 1:9472074/1‑68 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGGTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGtga > 1:54501946/1‑66 (MQ=255) aCCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCa > 1:45938467/1‑68 (MQ=255) ccTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCa > 1:17372462/1‑67 (MQ=255) ccTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAg < 1:25250520/68‑1 (MQ=255) ccTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGCCAg < 1:46717499/68‑1 (MQ=255) acgttgcaccttCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGTGATGGTCa < 1:49703146‑M1/55‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:1868276/68‑1 (MQ=255) ctctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:7264043/68‑1 (MQ=255) cgttgcaccttccagcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:15861273‑M2/27‑1 (MQ=255) cgtggcaccttcccgcgctggcgtgatcatttcagcgctggAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGc < 1:27190101‑M2/27‑1 (MQ=255) tctTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCt < 1:58040087/68‑1 (MQ=255) ttCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTaa > 1:43270747/1‑68 (MQ=255) gcaccatCCAGCGCTGAAATGATCACGCCCGCGCTGGAAGGTGGAACGTTGCGCGATGGTCagcttaa < 1:50429060‑M1/61‑4 (MQ=255) gtcgGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAg > 1:53982306/1‑68 (MQ=255) accttCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCAGGAAGGTGCAACGTTGAGGGATGGTCAGCGAAAAg < 1:8852679‑M1/63‑1 (MQ=255) ggCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATg > 1:41009322/1‑68 (MQ=255) CAGCGCTGAAATGAACACGCCCGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGAAGGTCAGCTTAAAGATggcg < 1:33558569‑M1/68‑1 (MQ=255) GCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGGCAGCTAAAAGATggcggc < 1:57007760‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGTTGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:47392880‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:38774802‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:40555980‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:53538139‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:37730521‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:55214560‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:24821702‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:6584023‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTAAGCTAAAAGATGGCGGCaa < 1:13831177‑M1/68‑1 (MQ=255) CTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCaaa < 1:3053213‑M1/68‑1 (MQ=255) GAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAgg > 1:28161829‑M1/1‑68 (MQ=255) GAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAgg > 1:507670‑M1/1‑68 (MQ=255) GAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAgg > 1:47186254‑M1/1‑68 (MQ=255) GAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGAAGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAgg > 1:51848266‑M1/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATTGCGGCAAAGGTa > 1:31613620/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa > 1:10065728/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa > 1:39453272/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa > 1:1701601/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa < 1:81900/68‑1 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa > 1:7878746/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa > 1:23634196/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa > 1:55696769/1‑68 (MQ=255) aaTGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTa > 1:14813821/1‑68 (MQ=255) tCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTaaa > 1:45354020/1‑68 (MQ=255) tCACGCAAGCGCTGGAAGGTCCAACCTTGAGCTATGGTCAGCTAAAAGATGGCGTCAAAGGTATTaaa > 1:27446/1‑68 (MQ=255) cACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTaaaa < 1:21670382/68‑1 (MQ=255) gCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGt < 1:49082418/58‑1 (MQ=255) 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aaGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAGTTGTc > 1:17906493/1‑68 (MQ=255) | GTAGAAGTGACGCTCGATACCAGCACCTCTTCGTCGGCCAGCGCTGAAATGATCACGCCAGCGCTGGAAGGTGCAACGTTGAGCGATGGTCAGCTAAAAGATGGCGGCAAAGGTATTAAAATCGATGAAGTTGTCA > CP009273/3375161‑3375296 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |