| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3614228 | NA (NA) | 16 (0.030) | 10/90 | NT | 100% | coding (1677/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3614368 | 0 (0.000) | coding (1817/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 582 total aligned reads displayed.
AGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAG > CP009273/3614306‑3614435 | gCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATtgcccgaagcggt > 1:7545833‑M2/1‑52 (MQ=255) ccATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCAActgcccgaagcggtcat < 1:54395066‑M2/68‑18 (MQ=255) aaCGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcat < 1:24432745‑M2/68‑24 (MQ=255) tACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacata < 1:5810903‑M2/68‑37 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:37870279‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:5332854‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:55686595‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:41784885‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:19420329‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:70227‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:8065346‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagct > 1:13001247‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:15707757‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:28389001‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:49959200‑M2/1‑11 (MQ=255) accGCCGTCATctgccagaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagc > 1:51026854‑M2/1‑11 (MQ=255) ccgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctc < 1:16599887‑M2/68‑59 (MQ=255) ccgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctc < 1:36234823‑M2/68‑59 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGCCGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt > 1:39333349‑M2/1‑68 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCCGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt < 1:25225629‑M2/68‑1 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt < 1:52637265‑M2/68‑1 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt > 1:40083198‑M2/1‑68 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt < 1:34699264‑M2/68‑1 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt < 1:2782575‑M2/68‑1 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt < 1:8523023‑M2/68‑1 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt < 1:25833103‑M2/68‑1 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt > 1:12053463‑M2/1‑68 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt < 1:16768369‑M2/68‑1 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt < 1:42208273‑M2/68‑1 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt > 1:57076165‑M2/1‑68 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt > 1:20290541‑M2/1‑68 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt > 1:43466204‑M2/1‑68 (MQ=255) CCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGccgtccgt < 1:17425921‑M2/68‑1 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:46791033‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:32722844‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:44082924‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:30627302‑M2/1‑9 (MQ=255) cgccgTCATctgcccgaagcgggcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca > 1:12153863‑M2/1‑9 (MQ=255) gccgTCATctgcgcgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:30917433‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:18537377‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:23003915‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:33743830‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:50625234‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:35370822‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:35897854‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:7268194‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:49735732‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:8869837‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:3155755‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:29640945‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:4134944‑M2/67‑60 (MQ=255) gccgTCAActgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctca < 1:47173337‑M2/67‑60 (MQ=255) GCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTa > 1:49017597‑M2/1‑67 (MQ=255) GCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTa > 1:45633406‑M2/1‑67 (MQ=255) GCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTa > 1:22776996‑M2/1‑67 (MQ=255) CCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTAcc > 1:18044638‑M2/1‑68 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:3239620‑M2/68‑63 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:5400533‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:22057229‑M2/68‑63 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca < 1:42881032‑M2/68‑63 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagca > 1:13903244‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:351123‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:29049142‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:28601937‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:19794898‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:10970925‑M2/1‑6 (MQ=255) cgTCATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagc > 1:46187084‑M2/1‑6 (MQ=255) GTCATTGCCCCGGCCGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAc < 1:52146392‑M2/68‑1 (MQ=255) GTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGtacccc > 1:56263140‑M2/1‑66 (MQ=255) GTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAc < 1:9473820‑M2/68‑1 (MQ=255) GTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAc > 1:43878243‑M2/1‑68 (MQ=255) GTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAc < 1:38359208‑M2/68‑1 (MQ=255) GTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAc < 1:34339757‑M2/68‑1 (MQ=255) GTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCAc < 1:26620285‑M2/68‑1 (MQ=255) cATctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaac > 1:19253412‑M2/1‑3 (MQ=255) CATTGCCCCGGACGGCAGCAGAACCGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGGCCGTACCACGc < 1:44402604‑M2/68‑1 (MQ=255) CATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTggg < 1:1000375‑M2/47‑1 (MQ=255) CATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGCCCGTCCGTACCACGc > 1:20847331‑M2/1‑68 (MQ=255) tctgcccgaagtggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:21024079‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacctaaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:45114727‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:55140027‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:10323623‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:11530098‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:18984114‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:5752446‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:57387880‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:31898499‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:33228574‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:38946779‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:39228913‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:4048013‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:48424969‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:44819109‑M2/1‑1 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:23723904‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:30068043‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:33022311‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:6330367‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:14573773‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcccgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactg < 1:123421‑M2/67‑67 (MQ=255) tctgcacgaagcggtcatggtcataacgggttacataaccggaacagtcggtgaagctcagcaactga > 1:27213843‑M2/1‑1 (MQ=255) | AGACACGCAGGGCCATGAAACGCGGTATGAATACAACATCGCCGGTGACCTGACCGCCGTCATTGCCCCGGACGGCAGCAGAAACGGGACACAGTACGATGCGTGGGGAAAGGCCGTCCGTACCACGCAG > CP009273/3614306‑3614435 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |