| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3614731 = | NA (NA) | 16 (0.030) | 8/98 | NT | 100% | coding (2180/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | 3614737 = | 0 (0.000) | coding (2186/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
ACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACC > CP009273/3614671‑3614804 | ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc > 1:52233009‑M2/67‑68 (MQ=255)ggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgtc < 1:18081047‑M2/2‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtattgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:18128061‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:9409854‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:48355037‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:26306211‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:1391696‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:7129301‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:29548923‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:11665154‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa > 1:11637357‑M2/65‑67 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCa < 1:31408172‑M2/3‑1 (MQ=255) cctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggatgatgtctgTCa > 1:26342828‑M2/65‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgccctttgctgatatggctgatgtctgTCAg > 1:39060283‑M2/64‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:24335421‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:49241777‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:22386594‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:42376302‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:40120877‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:23532969‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:2368620‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:24401385‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:38473211‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:26253600‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg > 1:35958542‑M2/64‑67 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:32951341‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:12024435‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:49794423‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:20774813‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:53457084‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:9020551‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:48925593‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:55340313‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:5511976‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:1771769‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAg < 1:17692044‑M2/4‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGc < 1:23126274‑M2/5‑1 (MQ=255) ctttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGc < 1:54432738‑M2/5‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgctgtctgTCCGcc > 1:11340827‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:24956936‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:31324237‑M2/6‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:27047062‑M2/6‑1 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc > 1:52949639‑M2/63‑68 (MQ=255) tttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:21148382‑M2/6‑1 (MQ=255) tgtctcatgatacctgtaatgcccggcgacccggcgcccgtcgctgatatggctgatgtctgTCAGcc < 1:18393975‑M2/6‑1 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa > 1:25040576‑M2/62‑68 (MQ=255) ttctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCa > 1:8680990‑M2/62‑68 (MQ=255) tctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCat < 1:43298244‑M2/8‑1 (MQ=255) tctcatcatacctctaatgcagcgcgacccggtgcccttcgctgatatggcttatgtctgTCagcctg < 1:10749668‑M2/8‑3 (MQ=255) ctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCata < 1:31297431‑M2/9‑1 (MQ=255) ctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCata < 1:26302069‑M2/9‑1 (MQ=255) ctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCata < 1:22206086‑M2/9‑1 (MQ=255) ctcatcatacctgtaatgcaccgccacccggtgcccgtcgctgatatggctgatgtctgTcagcaag > 1:6421447‑M2/60‑64 (MQ=255) tacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGa < 1:46110697‑M2/16‑1 (MQ=255) tacctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgcggatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGa < 1:32572960‑M2/16‑1 (MQ=255) ctgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAgg < 1:10194400‑M2/19‑1 (MQ=255) tgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAggg < 1:4827216‑M2/20‑1 (MQ=255) tgtaatgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgcctgCCAGCCATATCAGCGAAggg < 1:21768665‑M2/20‑1 (MQ=255) gtaatgcaccgccacccggtgccctgcgctgatatggctgatgtctgGCAGCCATATCAGCGAAGGGc < 1:13228606‑M2/21‑1 (MQ=255) gtaatgcaccgccacccggggcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGc < 1:36055180‑M2/21‑1 (MQ=255) atgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCAcc < 1:19531362‑M2/24‑1 (MQ=255) atgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCAAATCAGCGAAGGGCAcc < 1:41288322‑M2/24‑1 (MQ=255) tgcaccgccacccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgt > 1:56265848‑M2/44‑44 (MQ=255) ccgccccccggtgcccttcgctgatatggctgatgtctgTCCCCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTg < 1:39582218‑M2/29‑1 (MQ=255) ccgccacccggtgccctccgctgatatggctcatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTg < 1:39519399‑M2/29‑1 (MQ=255) tcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCCCCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTa > 1:22572770‑M2/23‑68 (MQ=255) tcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTa > 1:20832444‑M2/23‑68 (MQ=255) tatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATgag > 1:2316568‑M2/16‑68 (MQ=255) tatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATgag > 1:30576275‑M2/16‑68 (MQ=255) tatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATgag > 1:36470508‑M2/16‑68 (MQ=255) gtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCg > 1:41939723‑M2/6‑66 (MQ=255) cgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGa < 1:31929710‑M2/66‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCCGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:37553632‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:43436857‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:37894558‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:13068685‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:25705044‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:13428957‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:24050145‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:40800368‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:5543227‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:15343319‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:18078927‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:54538566‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:4644129‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:19773306‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:20698350‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:50261432‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:43603953‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:21729313‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:4901539‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:45612410‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:22158381‑M2/68‑1 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:26589602‑M2/1‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGGGGCGGTGCATTACTGGGATGATGCGAAAGGCCGGCTGAcc < 1:19917100‑M2/68‑1 (MQ=255) | ACCGCACCGTGAAGGGTGAAACCGCAGAGCGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACC > CP009273/3614671‑3614804 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |