| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | CP009273 | 931,037 | G→T | 5.7% | A786A (GCG→GCT) | ftsK → | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | CP009273 | 931,037 | 0 | G | T | 5.7% | 1872.8 / 8.7 | 610 | A786A (GCG→GCT) | ftsK | DNA translocase at septal ring sorting daughter chromsomes |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (295/257); new base T (9/45); total (306/304) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.23e-07 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Only 100 of 632 total aligned reads displayed.
TATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAAC > CP009273/930972‑931104 | tATCAGCAGCCACATCAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGcc < 1:18539239/68‑1 (MQ=255)tATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCTCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGcc < 1:48039682/68‑1 (MQ=255)tATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACACCCGGTTGCGcc > 1:40117984/1‑68 (MQ=255)tATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGcc > 1:2945275/1‑68 (MQ=255)tATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGcc > 1:12136742/1‑68 (MQ=255) aTCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTgcg < 1:13067945/65‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTgcg < 1:5745802/65‑1 (MQ=255) aTCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGcc < 1:673966/67‑1 (MQ=255) cagcagCCACATCAGCCTGTTGCGCCGCAGCAACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCcaca < 1:4845321/68‑1 (MQ=17) cagcagCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACGATATCAGCAGCCTCAACAACCGGTTGCGCcaca < 1:56494832/68‑1 (MQ=255) cagcagCAACATCAGCAGCTTGCTCCGCTGCCACATTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCcaca < 1:45649728/68‑1 (MQ=18) agcagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAGCCGGTTGCGCctca > 1:44950743/1‑67 (MQ=255) agcagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATAACCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCcaca > 1:41806226/1‑67 (MQ=255) tatgcCACAACTGCGGGTTCCTCCGCAGCCACATTATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCAcagc < 1:27122180/65‑1 (MQ=18) cagcCACAATAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCAcagca < 1:57813670/68‑1 (MQ=255) cagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCCGCCACAATATCAGCAGCCGCAACCCCCGGTTGCGCCAcagcc > 1:35606647/1‑67 (MQ=18) cagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCTCAATATCAGCAGCCTCAACAGCAGGTTGGGCCAaagc > 1:52468971/1‑67 (MQ=17) cagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCGCAGTATCCGCAGCATCAACAGCCGGTTGGGCctcatg > 1:51650002/1‑65 (MQ=2) cagcCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACATTATCAGCAGCCGCAACACCCGGTTGCGCCAcagca > 1:8509274/1‑68 (MQ=255) 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TGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCcac > 1:16596560‑M1/1‑68 (MQ=255) | TATCAGCAGCCACAACAGCCGGTTGCGCCGCAGCCACAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCACAGCAGCAATATCAGCAGCCGCAACAACCGGTTGCGCCGCAGCAGCAGTATCAGCAGCCACAAC > CP009273/930972‑931104 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |