New junction evidence | |||||||||||
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seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3613129 | NA (NA) | 5 (0.010) | 5/106 | NT | NA | coding (578/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
? | CP009273 | = 3613200 | NA (NA) | coding (649/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3613060‑3613129 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTAC < CP009273/3613200‑3613173 CGCATCGTTGTCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:8240879/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:12691908/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:40264511/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:39963355/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:44613487/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:37022732/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:50373329/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:21043456/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:20744373/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:1868034/68‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTG < 1:1002042/68‑1 GCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGC < 1:6178841/68‑1 GCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGC < 1:18630611/68‑1 GCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGC < 1:39421980/68‑1 GCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGC < 1:40731455/68‑1 GCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGGGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGC < 1:19953370/68‑1 GCATCGTTATCTGGCAACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTTAGCGGGTG > 1:6554765/1‑67 CATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCC > 1:8505877/1‑68 ATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCC < 1:39282742/67‑1 ATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCC < 1:34867893/67‑1 ATCGTTATCTGGCGACAAACAGGCCGCAGGGGCCGGGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCC < 1:18386615/67‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCG < 1:17705054/68‑1 CTGGCGACAAACAGGCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGT < 1:35856339/68‑1 CCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:43683817/65‑1 GCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGT < 1:18195149/68‑1 GGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTAC < 1:8173584/65‑1 CGCATCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3613060‑3613129 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccCGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTAC < CP009273/3613200‑3613173 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |