| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3613137 | NA (NA) | 8 (0.010) | 5/98 | NT | NA | coding (586/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3613192 | NA (NA) | coding (641/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 170 total aligned reads displayed.
TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3613064‑3613137‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gaagcggTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCCGGC < CP009273/3613192‑3613127 TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGG > 1:49275284/1‑68TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGG > 1:23153813/1‑68TCGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGG > 1:14772653/1‑68 CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGA < 1:1385051/68‑1 CGTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGT‑GTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:35675207/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA > 1:20593285/1‑68 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:1755465/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:15866925/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:27847565/68‑1 GTTATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGGGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAA < 1:16973392/68‑1 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGC > 1:18423136/1‑68 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGC > 1:38870259/1‑68 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAG < 1:45121452/67‑1 TATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAG < 1:5879182/67‑1 cTCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:35897362/67‑1 cTCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:47036104/67‑1 ATCTGGCGCCAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:1833517/68‑1 ATCTGGCGACAACCAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:27183082/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:46794670/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:5242366/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:25762136/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:24999989/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:21992082/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG > 1:47231726/1‑68 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:30566237/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:33292856/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:46424152/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:45279194/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:6751035/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:1615318/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:432446/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:40839093/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGGGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:46688966/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGGTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:31983963/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGGTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:2898239/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGGGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:31112112/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGGGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGGGCCGGAAGCG < 1:36568170/68‑1 ATCTGGCGACAAACAGGCCGCAGGGGCCGTGGGGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCG < 1:12278129/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTTAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:6290557/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:45672031/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:48426900/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:30925712/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:14342264/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:18022799/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:51293392/68‑1 TCTGGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGG < 1:19610373/68‑1 GGCGACAAACAGTCCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTGGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGgtg > 1:48026973/1‑65 CCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCACCAGCCCGGT < 1:48715744/66‑1 CCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCACCAGCCCGGT < 1:20638093/66‑1 CCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:9692764/65‑1 CCGCAGGGGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCACCAGCCCGG < 1:18750159/65‑1 GGCCGTGGTGGCTGCTCGGTTGGTGTGAGCGGGTGCCGGAAGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTAC < 1:28436689/65‑1 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTTCCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:11588865/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCCCCTCATCCGCTTCC > 1:28192248/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCCCCTCATCCGCTTCC > 1:44738915/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:50338870/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:1131710/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:5986797/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:8133946/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:40904852/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:40328833/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:20231093/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:19546560/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:2380815/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:24638860/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:18716873/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:27392896/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:28005965/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:31385032/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:17377925/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:33216260/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:3520460/1‑68 AGCGGTCCACCAGCCCGGTCAGTACCCGGTACGGCGGCAGCGGCGCAGGCAGCACCTCATCCGCTTCC > 1:35811513/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |